• 基于多个k值的DNA序列不对齐比对方法的研究

    基于多个k值的DNA序列不对齐比对方法的研究

    论文摘要随着下一代基因测序技术的发展,生物学领域产生了大量的数据,对这些生物数据的处理是一个急需解决的问题,同时也是计算机,数学等其他多个领域面临的一个重大挑战,生物信息学在这...
  • 增强型稀疏后缀数组索引的高错误率reads比对

    增强型稀疏后缀数组索引的高错误率reads比对

    论文摘要生物序列比对有助于定位序列之间的相似区域.测序技术的快速发展需要序列比对算法能够灵活地处理更长且错误率更高的reads序列.通过增强型稀疏后缀数组对参考序列建立索引,自...
  • 基于Spark的基因组学数据比对算法的并行化研究与比对平台构建

    基于Spark的基因组学数据比对算法的并行化研究与比对平台构建

    论文摘要近年来,随着高通量测序技术的出现,极大的推动了生物信息领域的发展,基因组序列比对是生物信息数据分析的关键环节。BLAST(BasicLocalAlignmentSear...
  • 基于多核和众核平台的并行DNA序列比对算法

    基于多核和众核平台的并行DNA序列比对算法

    论文摘要从人类基因组计划实施开始,生物计算包括的理论,方法以及相关的应用被越来越多的生物,医学以及其他医务工作者所需要和关注。生物计算作为一个交叉学科,它的发展与研究越来越凸显...
  • 基于de Bruijn图模型的基因组序列映射算法研究

    基于de Bruijn图模型的基因组序列映射算法研究

    论文摘要随着高通量测序技术的快速发展和测序成本的逐渐降低,个体基因组测序已成为研究不同物种的基因型,变异情况和相关疾病的重要手段。生物信息学为人类探索生命体活动规律,疾病产生机...
  • 基于分治算法的DNA序列比对成本模型

    基于分治算法的DNA序列比对成本模型

    论文摘要DNA序列比对在生物信息学中起着重要作用,目前已经有越来越多的DNA序列比对算法。本文将列出两种典型的算法,即分治算法和动态规划算法,通过使用这两种算法,可以得到最优比...
  • 一例猪繁殖与呼吸综合征病的诊断

    一例猪繁殖与呼吸综合征病的诊断

    论文摘要河南某地区一猪场肥猪群出现严重呼吸道症状,母猪出现流产现象,病理剖检显示猪肺门淋巴结肿大,猪肺脏呈现间质性肺炎病变,边缘出现实变,临床症状显示疑似猪繁殖与呼吸综合征病(...
  • 动态规划法进行基因双序列比对的探索和实现

    动态规划法进行基因双序列比对的探索和实现

    论文摘要动态规划法是生物信息学中一个最流行的解决方法,序列的比较、基因的识别、蛋白质序列的重排以及蛋白质结构和功能的分析等很多生物信息学中的问题都可以通过动态规划法解决,但是动...