计算机分子对接(MD)与分子动力学方法(ADMET)技术在模拟呕吐毒素降解中的应用

论文摘要

计算机分子对接是模拟受体和底物之间通过能量匹配和几何匹配而相互识别的过程。其被广泛运用于虚拟筛选活性物质以及初步判断分子活性和毒性等领域,并对我们进行实体分子活性毒性试验起到了重要的指导作用。分子动力学方法ADMET(吸收,分配,代谢,排泄和毒性)是当代药物设计和药物筛选中十分重要的方法。早期ADMET性质研究主要以人源性或人源化组织功能性蛋白质为"药靶",体外研究技术与计算机模拟等方法相结合,研究目标分子与体内生物物理和生物化学屏障因素间的相互作用。在本实验中我们利用计算机分子对接以ADMET分析软件,对脱氧雪腐镰刀菌烯醇(呕吐毒素)以及其降解产物进行计算机分子模拟分析,初步模拟呕吐毒素及其降解产物的毒性强弱,对呕吐毒素降解研究有重要的辅助作用。

论文目录

• 1 概述
• 2 呕吐毒素化学结构及性质
•   2.1 化学结构
•   2.2 化学性质
•   2.3 呕吐毒素降解产物
• 3 材料与方法
•   3.1 试验材料及仪器
•   3.2 测定方法
•     3.2.1 输入目标分子
•       3.2.1.1 绘制目标分子
•       3.2.1.2能量优化，产生最优构象
•     3.2.2 ADMET分子动力学分析
•     3.2.3 定义蛋白受体分子
• 4 结果和讨论
•   4.1 呕吐毒素及其降解产物分子动力学研究
•   4.2 呕吐毒素及其降解产物分子对接
•   4.2 分子对接打分情况
• 5 小结

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 陈晋莹,秦静雯,杨娟,张宇冲

关键词: 呕吐毒素降解,计算机分子对接,分子动力学分析

来源: 粮食储藏 2019年06期

年度: 2019

分类: 农业科技,工程科技Ⅰ辑

专业: 轻工业手工业

单位: 中储粮成都储藏研究院有限公司

基金: 2018~2020年度中国科协青年人才托举工程(20181NR001)

分类号: TS210.1

页码: 32-37

总页数: 6

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