靶向果蝇Kr-h1基因的mi RNA预测及其生物信息学分析

论文摘要

目的预测靶向果蝇Kr-h1（Krǜppel homolog1）基因的miRNA,并对其生物学功能及相关生物信息学进行分析,为进一步研究miRNA通过调控Kr-h1的表达而参与保幼激素（juvenile hormone,JH）对果蝇变态发育的调控奠定基础。方法通过microT-CDS、Targetscan和miRanda在线预测网站,对靶向Kr-h1基因的miRNA进行预测,对预测得到的多个miRNA按靶向结合可能性的大小进行汇总,3个网站均能预测到的miRNA为交集miRNA,对交集miRNA的靶基因及Kr-h1基因进行生物信息学功能分析。结果 microT-CDS、Targetscan和miRanda分别预测到30、7和11个靶向Kr-h1的miRNA,其中交集miRNA有4个,为miR-8、miR-277、miR-927和miR-964。功能分析发现,交集miRNA的靶基因主要参与细胞过程、生物过程和代谢过程,Kr-h1基因主要与昆虫生长发育及生殖相关。结论潜在靶向Kr-h1的miRNA涉及多个生物学过程,与昆虫的生长发育密切相关。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 Kr-h1基因3′UTR序列
•   1.2 数据来源的预测
•   1.3 靶向Kr-h1基因的miRNA预测
•   1.4 基因及靶向miRNA功能分析
• 2 结果
•   2.1 靶向Kr-h1的miRNA预测
•   2.2 网站预测结果汇总分析
•   2.3 miRA-927靶基因生物信息学分析
•   2.4 Kr-h1基因功能
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 董文韬,杨卓妮娜,何倩毓,刘胜军

关键词: 果蝇,靶向,基因,生物信息学

来源: 中国生物制品学杂志 2019年06期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 黑龙江八一农垦大学动物科技学院

基金: 国家自然科学基金(31501899),黑龙江省自然科学基金(C2016040),黑龙江八一农垦大学青年创新人才项目(2016-KYYWF-0167,CXRC2016-07),黑龙江八一农垦大学博士启动基金(XYB2015-07)

分类号: Q811.4

DOI: 10.13200/j.cnki.cjb.002297

页码: 624-628+633

总页数: 6

文件大小: 275K

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