甘蔗抗坏血酸过氧化物酶基因ScAPX1的克隆和表达分析

论文摘要

通过克隆甘蔗ScAPX1及分析其在低温胁迫中的表达,为深入研究甘蔗APX1在低温胁迫中的功能及为甘蔗抗寒育种的分子机理提供依据。以甘蔗叶片总RNA为模板,通过RT-PCR技术克隆甘蔗叶片ScAPX1的完整ORF序列,采用生物信息学软件分析所克隆基因的编码蛋白特性,并用荧光定量PCR分析该基因在2个抗寒性差异较大的甘蔗品种GT28和YL6低温胁迫下的表达模式。结果表明,克隆得到甘蔗ScAPX1（NCBI登录号为KC794939）,其包含一个759 bp的完整开放阅读框,编码252个氨基酸。该基因编码的蛋白不含信号肽,为可溶性蛋白,无跨膜结构,定位于细胞质,与高粱氨基酸的同源性为98%,推测其为胞质型抗坏血酸过氧化物酶基因。qRT-PCR分析结果表明,随着低温（0-4℃）时间的延长,2个甘蔗品种ScAPX1的表达量均是先上升后下降,但表达量存在差异,在整个胁迫过程中,抗寒强品种GT28的表达量始终比抗寒弱品种YL6高。甘蔗ScAPX1积极响应低温逆境胁迫,该基因的诱导表达与甘蔗品种本身的抗寒性密切相关。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料
•     1.1.1 材料
•     1.1.2 试验试剂
•   1.2 方法
•     1.2.1 总RNA的提取和cDNA第一链的合成
•     1.2.2 ScAPX的克隆
•     1.2.3 ScAPX1的生物信息学分析
•     1.2.4 ScAPX1的实时荧光定量表达分析
• 2 结果
•   2.1 总RNA和cDNA质量的检测
•   2.2 抗坏血酸过氧化物酶（ScAPX1）基因全长cDNA克隆
•   2.3 ScAPX1生物信息学分析
•   2.4 甘蔗ScAPX1低温胁迫下的表达分析
• 3 讨论
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张保青,邵敏,黄玉新,黄杏,宋修鹏,陈虎,王盛,谭秦亮,杨丽涛,李杨瑞

关键词: 甘蔗,基因克隆,低温胁迫,表达分析

来源: 生物技术通报 2019年12期

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 生物学,农作物

单位: 广西农业科学院甘蔗研究所中国农业科学院甘蔗研究中心广西甘蔗遗传改良重点实验室农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室,广西大学农学院,广西林业科学研究院,广西壮族自治区亚热带作物研究所

基金: 国家重点研发计划(2018YFD1000500),国家自然科学基金项目(31760415,31660356),广西科技计划(桂科AA17202042-1),广西农业科学院基本科研业务专项项目(桂农科2018JZ16,桂农科2017JZ19),广西科技基地和人才专项(桂科AD17195100),广西八桂学者专项(2013-03),国家现代农业产业技术体系广西甘蔗创新团队专项(gjnytxgxcxtd-03-01)

分类号: S566.1;Q943.2

DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2019-0396

页码: 31-37

总页数: 7

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