乳腺癌患者表观诱导的潜在肿瘤标志物的研究

论文摘要

目的研究甲基化在乳腺癌中的调控特征,并筛选出由甲基化介导的潜在乳腺癌标志物。方法通过使用Illumina 450K芯片,寻找位于基因启动子区域的甲基化位点。通过比较癌症组织和癌旁组织的DNA甲基化水平和基因表达水平来检测差异甲基化位点和差异表达基因。进一步对这些有差异的甲基化位点和基因关系对进行关联分析,并使用受到甲基化调控的基因对乳腺癌患者进行生存分析,如果基因能将患者的生存时间显著区分,则作为候选的乳腺癌标志物。最后,对这些潜在的标志物进行功能注释。结果基因启动子区域的甲基化位点在乳腺癌患者中既有低甲基化特征,也有高甲基化特征,绝大多数差异的甲基化位点会对基因起负向调控作用。一些与生存相关的基因是已知的乳腺癌相关基因。结论 DNA甲基化可以通过调控基因表达影响乳腺癌,通过检测这些肿瘤标志物的甲基化状态可能对乳腺癌诊断起到重要作用。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料
•   1.2 检测方法
•     1.2.1 甲基化水平检测:
•     1.2.2 基因启动子的甲基化水平:
•     1.2.3 基因表达水平检测:
•   1.3 差异分析
•     1.3.1 差异甲基化位点的识别:
•     1.3.2 差异基因的识别:
•   1.4 甲基化与基因表达的关联分析
•   1.5 生存分析
•   1.6 功能注释
•   1.7 统计学分析
• 2 结果
•   2.1 乳腺癌基因启动子区域的差异甲基化统计分析
•   2.2 乳腺癌差异表达基因统计分析
•   2.3 甲基化对基因表达调控的结果统计分析
•   2.4 筛选由甲基化介导的乳腺癌肿瘤标志物
•   2.5 潜在肿瘤标志物的功能注释分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 于玺文

关键词: 乳腺癌,甲基化,标志物

来源: 哈尔滨医科大学学报 2019年05期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技

专业: 肿瘤学

单位: 哈尔滨医科大学医科院办公室

分类号: R737.9

页码: 527-531

总页数: 5

文件大小: 1741K

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