阿尔茨海默症潜在风险基因的预测

论文摘要

目的运用生物信息学方法揭示阿尔茨海默症(AD)的生物学过程和通路,预测疾病潜在风险基因。方法首先对收集的AD易感基因进行基因本体论分析和通路富集分析发掘易感基因涉及的生物学过程和通路,并且提取关键的通路串话聚类模块;应用施泰纳最小树算法构建AD特异性蛋白质子网络,预测潜在风险基因。结果研究得到587个AD易感基因。进行GO和通路富集分析得到参与AD的显著性生物学过程和48条关键通路。通过分析特异性子网络,预测出5个潜在风险基因:HSP90AB1、PRKACA、GRB2、PPP1CA和PRKN。结论 AD的发生可能是不同系统的通路共同异常所导致,免疫系统在其中发挥较为重要的作用;预测得到5个AD潜在易感基因。

论文目录

• 1 方法
•   1.1 AD易感基因的收集
•   1.2 功能富集分析
•   1.3 通路串话分析
•   1.4 构建AD特异性子网络和风险基因的预测
• 2 结果
•   2.1 收集的AD基因集
•   2.2 GO富集分析
•   2.3 通路富集分析
•   2.4 疾病特异性网络分析
• 3 讨论
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 樊婷,王举

关键词: 阿尔茨海默症,通路富集分析,通路串话网络,分析,特异性子网络

来源: 航天医学与医学工程 2019年06期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,工程科技Ⅱ辑

专业: 精神病学

单位: 天津医科大学生物医学工程与技术学院,宁夏回族自治区人民医院肿瘤科

基金: 国家自然科学基金(2016YFC0906300)

分类号: R749.16

DOI: 10.16289/j.cnki.1002-0837.2019.06.005

页码: 497-502

总页数: 6

文件大小: 7892K

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