基于网络药理学的干姜抗肿瘤转移作用机制分析

论文摘要

目的:采用网络药理学方法探究中药干姜的主要活性成分及其抗肿瘤转移作用机制。方法:在中药系统药理学分析平台（TCMSP）数据库中检索干姜的化学成分,根据"类药五原则"与"口服生物利用度"≥30%这一标准筛选干姜的活性成分,预测其活性成分对应的作用靶点,采用Cytoscape 3.2.1软件构建活性成分-预测靶点网络图。在Genecards数据库中以"anti-tumor metastasis"为关键词搜索抗肿瘤转移靶点,与干姜靶点映射筛选出共同靶点作为干姜的抗肿瘤转移靶点。将干姜抗肿瘤转移靶点导入STRING数据库中进行蛋白质-蛋白质相互作用分析,构建靶蛋白相互作用网络图（PPI）,利用Cytoscape 3.2.1的"CytoNCA"插件筛选干姜的抗肿瘤转移核心靶点。使用DAVID数据库及Cytoscape 3.2.1的"GlueGO"插件对干姜抗肿瘤转移靶点进行KEGG信号通路富集分析和GO生物过程富集分析。结果:获得干姜中具有类药性、口服吸收良好的活性成分52种,对应靶点101个。其中抗肿瘤转移靶点40个,核心靶点10个。KEGG富集分析得到与干姜抗转移作用有关的信号通路62条,主要涉及TNF信号通路、VEGF信号通路等。GO富集分析得出与干姜抗转移作用有关的生物过程45个,主要涉及低氧反应、活性氧代谢过程等。结论:本研究初步揭示了干姜的药效物质基础及其可能的抗肿瘤转移作用机制,可为干姜抗肿瘤研究提供参考。

论文目录

• 1 方法
•   1.1 干姜活性成分及靶点筛选
•   1.2 干姜活性成分-靶点网络构建
•   1.3 干姜抗肿瘤转移相关靶点的搜集
•   1.4 抗肿瘤转移靶点互作网络的构建
•   1.5 KEGG信号通路和GO生物过程富集分析
• 2 结果
•   2.1 干姜主要活性成分信息
•   2.2 干姜主要活性成分-预测靶点网络
•   2.3 干姜抗肿瘤转移作用靶点的搜集与干姜活性成分-抗肿瘤转移靶点网络的构建
•   2.4 靶蛋白互作网络构建
•   2.5 KEGG信号通路富集分析
•   2.6 GO生物过程分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 耿胜男,杨莉,李阳杰,杜钢军

关键词: 网络药理学,干姜,抗肿瘤转移,靶点,信号通路

来源: 中药材 2019年11期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技

专业: 中药学

单位: 郑州工业应用技术学院,河南大学药学院药物研究所

基金: 河南省自然科学基金(182300410310),郑州工业应用技术学院校级科研项目(2018YB021)

分类号: R285.5

DOI: 10.13863/j.issn1001-4454.2019.11.035

页码: 2658-2668

总页数: 11

文件大小: 6404K

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