雄性SD大鼠视网膜发育转录组分析

论文摘要

研究SD大鼠视网膜发育中的基因表达谱变化。对微阵列技术检测出的基因表达量进行T检验和SAM(Significance Analysis of Microarrays),计算P值和变化倍数,筛选符合条件的基因(P<0.05和变化倍数大于1.05或小于0.95作为差异表达基因的筛选标准),得到通路和网络变化图。结果显示:SD大鼠一个月和三个月的发育过程中筛选出51个可能与视网膜发育有关的候选基因,其中有Krt8、Lox、Cryga、Dusp6、Crygb等42个基因的表达量呈现下调趋势,Opn4、Lamc2、Etv4等9个基因表达呈上调趋势,这些差异基因主要参与运输、转录调节、眼睛发育、细胞黏附和蛋白质水解等通路。研究有助于深入理解视网膜发育的分子机理。

论文目录

• 1 引言
• 2 材料与方法
•   2.1 实验
•   2.2 RNA分离
•   2.3 基因差异分析
•   2.4 表达显著变化基因
•   2.5 通路分析
•   2.6 构建网络变化图
• 3 结果
•   3.1 差异基因分析
•   3.2 通路分析
•   3.3 构建网络变化图
• 4 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李云,吕家红,陈淑芬,董鑫洁,赵秀举

关键词: 视网膜发育,网络图,转录组

来源: 武汉轻工大学学报 2019年06期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

专业: 生物学

单位: 武汉轻工大学生物与制药工程学院

基金: 湖北省教育厅科技计划重点项目(D20191603)

分类号: Q953;Q436

页码: 20-26

总页数: 7

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