单核细胞增生李斯特菌新型转录调控因子Lmo2672分子特征及其系统进化分析

论文摘要

利用PCR方法扩增单核细胞增生李斯特菌（Listeria monocytogenes,LM）野毒株SB5新型转录调控因子lmo2672基因,进行克隆、测序,对其编码蛋白的二三级结构、理化特性、蛋白结构域等分子特征进行预测分析,并进行系统进化分析。结果显示:LM-SB5 lmo2672基因全长807 bp,共编码268 aa;二级结构预测发现,该蛋白含有1个DNA结合域（185～259 aa）,2个由螺旋-转角-螺旋（helix-turn-helix）构成的HTH-18结构域（184～198 aa,226～249 aa）,位于整个蛋白的C端,无信号肽序列及跨膜结构;序列比较发现,Lmo2672属于AraC家族转录调节蛋白,其核苷酸序列与NTSN株（4b型）同源性为99.63%;与国际标准株EGD-e株（1/2a型）的同源性为97.77%;系统进化树显示,LM-SB5 lmo2672核苷酸序列与谱系Ⅱ型NTSN等菌株亲缘关系较近,而与谱系Ⅰ型菌株标准株EGD-e等亲缘关系较远。该研究结果为下一步探讨lmo2672基因在LM毒力和环境应激中的调控作用奠定了理论基础。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 菌株、培养基及试剂
•   1.2 引物设计与合成
•   1.3 LM lmo2672基因的克隆及测序
•   1.4 lmo2672基因编码蛋白质的生物信息学分析
•   1.5 lmo2672基因核苷酸序列系统进化分析
• 2 结果
•   2.1 lmo2672基因的扩增、克隆及测序
•   2.2 lmo2672基因核苷酸及编码氨基酸序列分析
•   2.3 lmo2672基因的理化特性分析
•   2.4 Lmo2672蛋白分子结构特征分析
•   2.5 lmo2672基因序列的系统进化分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李杰,孟庆玲,乔军,张星星,王晓婷,李妍,张国武,蔡扩军,才学鹏

关键词: 单核细胞增生李斯特菌,基因,克隆,分子特征,系统进化分析

来源: 中国动物传染病学报 2019年02期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 石河子大学动物科技学院,新疆农垦科学院绵羊遗传改良与健康养殖省部共建国家重点实验室,乌鲁木齐市动物疾病控制与诊断中心,中国农业科学院兰州兽医研究所

基金: 国家自然科学基金(31360596,30960274),国家重点研发计划项目子课题(2016YFD0500900),乌鲁木齐市科技局渝乌科技合作项目(Y161220001),新疆生产建设兵团中青年科技创新领军人才计划(2016BC001)

分类号: S852.61

页码: 35-41

总页数: 7

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