低温胁迫对水稻苗期根系影响的蛋白质组学研究

论文摘要

为了从蛋白质水平揭示水稻苗期响应低温胁迫的分子机理,以耐冷性强的东乡野生稻和冷敏感品种中嘉早17为材料,于5℃低温处理0,1,2,3 d后分别测定根系活力、过氧化物酶活性、超氧化物歧化酶活性、丙二醛含量等生理指标。随后利用iTRAQ技术对5℃低温处理3 d后水稻幼苗的根系差异蛋白质组进行分析。通过生理指标分析,5℃低温处理影响东乡野生稻和中嘉早17的根系生理指标,且在低温处理第3天,两者已出现明显差异。通过差异蛋白质组学分析,与常温(25℃)相比,东乡野生稻经低温处理后共鉴定到167个差异蛋白,其中,上调表达蛋白61个,下调表达蛋白106个;中嘉早17经低温处理后共鉴定到261个差异表达蛋白,其中,上调表达蛋白122个,下调表达蛋白139个。通过GO功能分析,这些差异蛋白质主要参与代谢、细胞和单机体过程,主要涉及细胞及细胞成分,主要起着结合和催化作用。通过KEGG分析,这些差异蛋白质主要参与代谢、次级代谢产物合成和碳代谢等代谢通路。通过对东乡野生稻和中嘉早17中均发生差异表达的29个蛋白质的进一步分析,了解到两者受低温危害后根系部分蛋白质的表达动态。本研究鉴定到的差异表达蛋白质为进一步阐述水稻耐冷机理及耐冷基因的挖掘提供理论依据。

论文目录

• 1 材料和方法
•   1.1 试验材料
•   1.2 样品处理
•   1.3 试验方法
•     1.3.1 生理指标测定
•     1.3.2 蛋白质样品制备
•     1.3.3 蛋白质酶解和标记
•     1.3.4 色谱SCX分级及质谱分析
•     1.3.5 数据处理及生物信息学分析
•     1.3.6 qRT-PCR验证
• 2 结果与分析
•   2.1 低温处理对水稻苗期根系的生理指标影响
•   2.2 低温胁迫对水稻苗期根系的蛋白质组分析
•     2.2.1 根系差异表达蛋白的鉴定结果
•     2.2.2 根系差异表达蛋白的生物信息学分析
•     2.2.3 qRT-PCR分析验证
• 3 结论与讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 唐秀英,王会民,龙起樟,黄永兰,芦明,万建林

关键词: 水稻,低温胁迫,蛋白质组学,苗期,根系

来源: 华北农学报 2019年06期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 农作物

单位: 江西省超级水稻研究发展中心

基金: 江西省农业科学院青年基金项目(2015CQN001),江西省科技计划重大项目(20143ACF60008),江西现代农业科研协同创新项目(JXXTCX2015006-002)

分类号: S511

页码: 82-88

总页数: 7

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