辣椒健康植株与患枯萎病植株根际土壤古菌群落多样性的比较研究

论文摘要

采集漳州3个辣椒种植基地枯萎病典型患病样地的健康植株(以下简称JK)根际土壤和患病植株(以下简称KW)根际土壤,对土样中的古菌群落进行基于IlluminaMiseq测序平台的宏基因组高通量测序,明确健康辣椒植株与患枯萎病植株根际土壤细菌群落多样性,为辣椒枯萎病生态防控提供理论依据。结果表明,患枯萎病植株根际土壤细菌的优质序列比健康植株少480条,OTUs少11个。在门水平上,健康植株和患病植株根际土壤微生物组成相似,最优势门均为奇古菌门,但相对丰度存在差异。在属水平上,健康植株根际的亚硝化球菌属Nitrososphaera相对丰度比患病植株增加了38.61%,亚硝化侏儒菌属Nitrosopumilus相对丰度比患病植株增加1.89%,患病植株的Methanomassiliicoccus属相对丰度却比健康植株增加了10.92%。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 供试土样
•   1.2 DNA提取
•   1.3 基因扩增及测序
•   1.4 序列数据分析
• 2 结果与分析
•   2.1 α多样性分析和OTUs（Operational Taxonomic Units）差异比较
•   2.2 古菌群落组成结构比较
•   2.3 健康和患病辣椒根际土壤古菌门水平优势种群比较
•   2.4 健康和患病辣椒根际土壤古菌属水平优势种群比较
• 3 结论与讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 戴瑞卿,林明辉,赖宝春,吴振强,王家瑞

关键词: 辣椒枯萎病,根际土壤,高通量测序,古菌多样性

来源: 福建热作科技 2019年04期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,农业基础科学,农艺学,植物保护,园艺

单位: 福建省漳州市农业科学研究所,福建省漳州市平和县林业局安厚林业站

基金: 福建省科技计划项目（2017N0042）,福建省作物有害生物监测与治理重点项目（MIMCP-201802）

分类号: S154.3;S436.418.1

页码: 10-14

总页数: 5

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