花花柴KcbHLH71基因的克隆及表达分析

花花柴KcbHLH71基因的克隆及表达分析

论文摘要

高温胁迫可引起植物体内生长素类激素含量和活性变化,也可影响其生理生化过程进而产生胁迫蛋白以提高自身抵抗或适应逆境的能力。根据高温胁迫下花花柴转录组测序分析结果,发现生长激素合成相关基因bHLH显著上调,通过PCR克隆获得该基因碱基序列,命名为KcbHLH71,并利用定量PCR对高温胁迫下该基因的表达模式进行分析。结果显示,花花柴KcbHLH71基因完整ORF为1 038 bp,编码345个氨基酸,分子量大小为38.8 kD,pI为6.8;编码蛋白含有b HLH蛋白家族的特征基序列和保守结构域,有信号肽,无跨膜结构,定位于细胞核。系统发育结果显示花花柴KcbHLH71与菊科的向日葵、莴苣bHLH71蛋白的相似性分别为88%和83%,即认为它们同源性最高,亲缘关系最近。表达分析结果显示,高温胁迫下,花花柴KcbHLH71基因2 h的表达量受到最大抑制,之后逐渐上升,当12 h时达到高峰,12~24 h再次出现下降,但仍高于对照水平。以上研究结果表明,高温可以显著诱导KcbHLH71基因的表达,推测该基因可能参与花花柴响应高温胁迫的正调控。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 KcbHLH71基因及编码的蛋白质序列预测分析
  •   1.2 KcbHLH71的理化性质及结构预测分析
  •   1.3 KcbHLH71的高级结构预测分析
  •   1.4 KcbHLH71的表达分析
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 试验材料
  •   3.2 KcbHLH71基因的克隆及测序
  •   3.3 KcbHLH71基因的生物信息学分析
  •   3.4 KcbHLH71的表达分析
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李丽,王彦芹

    关键词: 花花柴,转录因子,基因克隆,生物信息学分析

    来源: 基因组学与应用生物学 2019年03期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,医药卫生科技

    专业: 生物学

    单位: 塔里木大学生命科学学院,塔里木大学塔里木盆地生物资源保护利用兵团重点实验室-省部共建国家重点实验室培训基地

    基金: 国家自然基金项目(31460071,31660085)资助

    分类号: Q943.2

    DOI: 10.13417/j.gab.038.001178

    页码: 1178-1185

    总页数: 8

    文件大小: 795K

    下载量: 117

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