利用基因YKT6鉴定疫霉属的不同种（英文）

论文摘要

利用分子标记或对特异位点的碱基序列进行分析是植物病原物分子检测的基础,可以在属和种的水平上对物种进行区分和鉴定。对疫霉属的不同种已有一系列的分子检测方法。SNARE蛋白相关基因YKT6拥有保守的侧翼编码区,适于设计疫霉属特异性的PCR引物,同时其内含子所具有的多态性可开发出几乎所有疫霉种的分子标记。利用疫霉属特异性引物对P-YKT6-F/P-YKT6-R可在31个疫霉种中特异地扩增出一条约600 bp的条带,而在腐霉或其他真菌中不能扩增出该条带。利用大豆疫霉的引物对Ps-YKT6-F/Ps-YKT6-R和辣椒疫霉的引物对Pc-YKT6-F/Pc-YKT6-R,能分别从大豆疫霉菌株和辣椒疫霉菌株中扩增出一条399 bp和282 bp的条带,常规PCR和巢式PCR的灵敏度分别达到100 pg和10 fg。利用这些引物也可从土壤和病组织中检测到目标病原菌。此外,利用上述特异性引物开发出了大豆疫霉和辣椒疫霉的实时定量PCR检测方法。基于YKT6基因的分子标记和检测方法可用于疫霉种的调查检测和法定定量检测。

论文目录

• 1 Introduction
• 2 Materials and Methods
•   2.1 Source of strains
•   2.2 Culture conditions and DNA extraction
•   2.3 DNA amplification
•   2.4 Real-time PCR
• 3 Results
•   3.1 Sequence analysis and primer design
•   3.2 Specificity test of the primers
•   3.3 Determination of P.sojae and P.capsici primers sensitive
•   3.4 Developm ent of real-tim e PCR assay using the species-specific prim ers
•   3.5 Evaluation of the species-specific primers using diseased plant issues
•   3.6 Quantitative detection in infested field soil
• 4 Discussion

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 赵伟,迟元凯,段劲生,陈晴晴,Myat Phyu Khine,汪涛,戚仁德

关键词: 分子标记,辣椒疫霉,大豆疫霉,基因

来源: 植物病理学报 2019年01期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,农业基础科学,植物保护

单位: 安徽省农业科学院植物保护与农产品质量安全研究所,缅甸教育部研究与创新部生物技术研究系

基金: Anhui Provincial Natural Science Foundation(1508085MC43),The National Key Research and Development Program of China(2016YFD0200207)

分类号: S432.44

DOI: 10.13926/j.cnki.apps.000143

页码: 43-55

总页数: 13

文件大小: 1213K

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