导读:本文包含了互作基因论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因,抗性,水稻,蛋白,春小麦,信息学,家蚕。
互作基因论文文献综述
周非凡,刘瑜,常鑫磊,林拥军[1]（2019）在《OsCPK12基因功能研究和互作蛋白筛选》一文中研究指出通过反向遗传学研究方法,构建OsCPK12基因敲除和超表达突变体,用150 mmol/L的NaCl进行盐胁迫处理,结果显示:超表达株系无论株高、根长还是叶片状态都优于野生型,而基因敲除突变体相比于野生型株高明显矮化,根的发育形态差,叶片枯黄,证实OsCPK12对水稻耐盐有正调控作用。用real-time PCR对突变体株系的根、叶鞘、叶片多个部位的激素信号转导路径基因的表达量进行分析,结果显示:超表达株系的多个激素受体编码基因和下游调控基因表达量显着上调,说明OsCPK12参与激素的信号转导并影响水稻抗逆反应。为进一步研究OsCPK12的基因功能,通过在水稻原生质体中表达融合蛋白进行OsCPK12的亚细胞定位,确定OsCPK12定位于质膜。用酵母双杂交的方法在水稻中花11膜蛋白文库中筛选到2个水通道蛋白OsPIP1-1和OsPIP2-7,且酵母点对点验证为阳性,推测OsCPK12可能通过与OsPIP1-1和OsPIP2-7互作,调控水分子进出细胞,提高了水稻的耐盐性。(本文来源于《华中农业大学学报》期刊2019年06期）
刘兆宇,胡腊,曾子成,林海,李明[2]（2019）在《COPD相关差异表达基因筛选、生物学功能分析及其编码蛋白互作网络分析》一文中研究指出目的分析慢性阻塞性肺病(COPD)患者肺组织中差异表达基因及其编码蛋白的互作关系,筛选出COPD相关的关键基因。方法从NCBI公共数据平台GEO数据库下载COPD表达谱数据集GSE57148,采用R软件及其扩展包对表达谱数据进行处理和分析,获得差异表达基因,并通过STRING、Cytoscape等对差异表达基因进行生物学功能分析及编码蛋白互作分析。结果一共获得117个基因为差异表达基因,其中发生上调的基因有63个,发生下调的基因有54个;信号通路分析发现这些基因主要富集于细胞外基质形成、胶原纤维化形成和氧化激活通路等。蛋白网络互作分析发现VWF、FGG、IGF1、F5、RPS15、RPS12、SEC61B、THBS1、F13A1为差异表达基因中的Hub基因。结论 COPD肺组织中共有117个基因差异性表达,上调表达基因63个,下调基因54个;这些差异性表达基因主要参与细胞外基质改变、纤维化和氧化还原活性等信号通路;VWF、FGG、IGF1、F5、RPS15、RPS12、SEC61B、THBS1和F13A1为Hub基因,可能在COPD的疾病进程中发挥了关键作用。(本文来源于《山东医药》期刊2019年30期）
林志坚,廖卫平[3]（2019）在《基因互作网络分析CNTN2、EFHC1/CCDC150基因为特发性全面性癫痫候选基因》一文中研究指出目的通过基因互作网络模式寻找特发性全面性癫痫候选致病基因。方法收集特发性全面性癫痫患者142例,提取患者及其父母(叁人组)外周静脉血的DNA,采用全外显子组第二代测序方法(IlluminaHiSeq 2500测序平台),测定基因组的全外显子区及±10位内含子区的基因变异。296例排除癫痫史的视网膜病变患者为对照组。以癫痫基因表型、非良性变异(最小等位基因频率<0.05,且≥1个软件预测有(本文来源于《第八届CAAE国际癫痫论坛论文汇编》期刊2019-10-18）
刘列,秦蔚,孙玚,刘欣茹,罗琼[4]（2019）在《水稻与纹枯病菌互作中免疫相关基因的表达研究》一文中研究指出【目的】近年来水稻纹枯病的危害不断加重,在一些地区已成为水稻最严重的病害,严重威胁到中国水稻的产量和品质。由于引起水稻纹枯病的立枯丝核菌具有强腐生性和广寄主范围的特性,利用传统方法至今尚未筛选到高抗的资源品种。为了找到与抗性相关的基因和为抗性研究及抗病育种提供帮助。【方法】本研究在苗期和成株期接种抗病性不同的4个水稻品种,利用qPCR方法研究了在2个生育期接种纹枯病菌后24 h和48 h水稻免疫相关基因的表达量变化。【结果】初步明确WARK71和WARK53是介导水稻纹枯病抗性的关键基因,可作为抗性相关的标记基因。【结论】水稻与纹枯病菌的互作中可能存在受水稻发育时期调控的开关基因。进一步系统分析水稻对纹枯病菌的抗性组分可为抗性基因的合理利用、水稻抗病品种的培育和预防纹枯病研究提供理论基础。(本文来源于《云南农业大学学报(自然科学)》期刊2019年05期）
王存忠[5]（2019）在《西北水地春小麦基因型与环境互作及其产量稳定性探讨》一文中研究指出对于水地春小麦在进行栽培过程中,小麦栽培环境以及植物基因型之间具有内在的关联性。西北地区具备适宜春小麦存活以及生长的独特区域环境,并且体现为多样的生态环境以及较大的小麦产能波动。在此前提下,对于西北地区栽植水地春小麦应当能够明确当地环境与春小麦基因型的联系,确保水地春小麦可以达到更为稳定的小麦产量状态。(本文来源于《农业开发与装备》期刊2019年08期）
刘列,张世梅,王明环,张杰,杨敏[6]（2019）在《水稻与弱毒丝核菌互作中免疫相关基因表达研究》一文中研究指出水稻纹枯病的病原菌为立枯丝核菌(Rhizoctonia solani Kǜhn)。用10株弱毒丝核菌提前接种水稻后,再接种纹枯病病原菌,观察其发病症状,并用实时荧光定量RT-PCR方法研究了接种不同处理后的水稻9个抗性基因表达情况,筛选出参与水稻纹枯病抗病过程的基因和能使水稻提前获得系统抗性的弱毒丝核菌菌株。结果显示,参与水稻诱导抗性的抗性基因主要为PR10a、ORK10、NAC4、WRKY53、WRKY71。大部分弱毒双核丝核菌能诱导水稻抗性基因表达,诱导效果最好的弱毒丝核菌菌株是②BS-J-06-8-1、④chd-YT-3-5和⑨DL-YT-06-4-9。(本文来源于《中国植保导刊》期刊2019年08期）
李燕飞,辛玉琼,高世东,赵培玉,刘舞贞[7]（2019）在《甘蓝型油菜CIPK22基因的特性分析与互作蛋白CBL的鉴定》一文中研究指出甘蓝型油菜(Brassica napus)作为重要的油料作物之一,其产量与品质常受到环境因素的影响。钙离子是生物体内重要的应答内外刺激的第二信使。作为植物特有的钙信号解码蛋白,类钙调磷酸蛋白B (calcineurin B-like protein, CBL)以及与之互作的CIPK (CBL-interacting protein kinase)家族部分成员的功能与调控机制已经在模式植物拟南芥中被广泛报道,但是在甘蓝型油菜中却报道寥寥。本研究从甘蓝型油菜中克隆到一个CIPK家族的基因序列,分析表明它与拟南芥中CIPK22基因序列高度相似,故命名为Bna CIPK22。亚细胞定位结果显示Bna CIPK22定位在细胞质与细胞核。实时荧光定量(q RT-PCR)技术检测Bna CIPK22对多种非生物逆境和激素处理后的响应,发现Bna CIPK22的表达受脱落酸(abscisic acid, ABA)、水杨酸(salicylic acid, SA)、冷害、渗透胁迫和盐害处理诱导。同时,利用酵母双杂交体系,筛选到可能与Bna CIPK22互作的Bna CBL蛋白,并通过双分子荧光互补(Bi FC)技术进行了验证。本研究结论为深入了解CIPK22的功能与调控机制提供参考。(本文来源于《植物生理学报》期刊2019年08期）
申雅文,马田田,霍春月,杨宗霖,路一平[8]（2019）在《家蚕snoRNA Bm-15的细胞定位及与类Notch受体基因的互作关系》一文中研究指出【目的】前期研究中发现的一个家蚕Bombyx mori C/D box snoRNA Bm-15能够与类Notch受体基因(Notch-like receptor gene,NLR)发生体外互作。本研究旨在了解家蚕中snoRNA Bm-15与NLR的互作机制。【方法】利用实时荧光定量PCR检测snoRNA Bm-15和NLR在家蚕幼虫、蛹及成虫不同发育阶段的表达谱;利用原位杂交鉴定snoRNA Bm-15与NLR在BmN4细胞中的定位,以探索两者之间的互作机制。【结果】表达谱分析发现,snoRNA Bm-15及NLR在家蚕幼虫期的表达趋势基本一致,均呈现先下降后上升的趋势,2龄幼虫中表达量最低。在家蚕化蛹过程中,snoRNA Bm-15表达量呈现逐渐下降的趋势,到处女蛾时表达量最低。而NLR在雌虫化蛹后第1天表达量最低,处女蛾中表达量最高。利用原位杂交进行细胞定位发现,snoRNA Bm-15不仅存在于BmN4细胞核中,在细胞质中也有分布;而NLR则大部分分布于细胞核中,与Bm-15在核内有位置重迭。【结论】首次在鳞翅目昆虫中发现一个snoRNA Bm-15同时存在于细胞核和细胞质中,与其互作的基因NLR则主要存在于细胞核中,与Bm-15有位置重迭。二者在家蚕幼虫阶段存在一致的表达模式,在化蛹及化蛾过程中存在相反的表达模式,提示snoRNA Bm-15与NLR在家蚕不同发育阶段可能存在不同的互作模式。(本文来源于《昆虫学报》期刊2019年08期）
刘佩佩,苗晶晶,刘力铷,姚琳琳,潘鲁青[9]（2019）在《菲律宾蛤仔雌激素相关受体基因克隆及互作蛋白筛选》一文中研究指出采用RACE技术克隆鉴定了菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)雌激素相关受体(rpERR)基因的cDNA序列。rpERR基因全长序列为2 340 bp,开放阅读框ORF为1 453 bp,编码484个氨基酸,理论分子量为54.5 kDa。氨基酸序列同源性分析表明菲律宾蛤仔ERR与脊椎动物ERRγ同源性相近,与其他无脊椎动物聚为一个分支,与虾夷扇贝的ERR同源性最高。rpERR含有核受体超家族通常的6个结构域。通过qRT-PCR技术检测发现ERR在菲律宾蛤仔的鳃、消化盲囊、性腺、闭壳肌和外套膜组织中各组织中均有表达,在性腺中的表达量最高。运用酵母双杂交技术对菲律宾蛤仔酵母cDNA文库进行互作蛋白筛选、测序及生物信息学分析,获得了菲律宾蛤仔ERR互作蛋白为cAMP应答元件结合蛋白。根据rpERR的生物信息学分析、各组织中表达特征以及互作蛋白推测其功能可能涉及性腺发育与物质能量代谢等重要生物学过程的调节。(本文来源于《中国海洋大学学报(自然科学版)》期刊2019年S1期）
张蕴显,王雅梅,周萍[10]（2019）在《蚁群优化算法构建乳腺癌中miRNA调控的关键基因互作网络》一文中研究指出目的筛选ER阳性乳腺癌中受miRNA调控的关键基因,以此构建乳腺癌中miRNAmRNA互作网络,进而了解ER阳性乳腺癌的调控机制,为筛选ER阳性乳腺癌诊断预后的生物标志物和治疗靶点打下基础。方法利用MCF-7细胞系的AGO-IP(HITS-CLIP Protocol for Argonaute)高通测序实验数据,发现miRNA对mRNA的真实调控关系,并以此构建基于RNAs诱导的沉默复合体(RNAinduced silencing complex,RISCs) miRNA-mRNA调控模组。根据调控模组利用蚁群优化算法在基因互作网络中筛选关键基因,构建ER阳性乳腺癌中miRNA调控下的关键基因互作网络,并对关键基因进行功能分析。结果本研究筛选出106个关键基因,244个调控关键基因的miRNA。根据乳腺癌中miRNA调控的关键基因互作网络识别出了YWHAG、EP300、CHEK1、SMAD2、SMAD1、SYK、FGFR1、PIK3R2、IRS1、TGFBR2、CHUK和CSDE1等12个hub基因;并发现了hsa-miR-940、hsa-miR-545-3p、hsa-miR-3065-5p、hsa-miR-15a-5p、hsa-miR-181b-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-765、hsa-miR-4723-5p、hsa-miR-454-3p、hsa-miR-374a-5p、hsa-miR-34a-5p、hsa-miR-30e-5p、hsa-miR-19a-3p、hsa-miR-15b-5p、hsa-miR-149-5p和hsa-miR-128-3p等16个hub miRNA。这些基因主要对肿瘤细胞的增殖、侵袭、化疗抗性、放疗抗性和耐药性起重要作用。结论本研究筛选出的关键基因及调控关键基因的miRNA对ER阳性乳腺癌的耐药性、化疗抗性、放疗抗性及肿瘤细胞的增殖、侵袭有重要调控作用,对ER阳性乳腺癌临床治疗及预后起到重要参考作用。(本文来源于《北京生物医学工程》期刊2019年04期）
互作基因论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的分析慢性阻塞性肺病(COPD)患者肺组织中差异表达基因及其编码蛋白的互作关系,筛选出COPD相关的关键基因。方法从NCBI公共数据平台GEO数据库下载COPD表达谱数据集GSE57148,采用R软件及其扩展包对表达谱数据进行处理和分析,获得差异表达基因,并通过STRING、Cytoscape等对差异表达基因进行生物学功能分析及编码蛋白互作分析。结果一共获得117个基因为差异表达基因,其中发生上调的基因有63个,发生下调的基因有54个;信号通路分析发现这些基因主要富集于细胞外基质形成、胶原纤维化形成和氧化激活通路等。蛋白网络互作分析发现VWF、FGG、IGF1、F5、RPS15、RPS12、SEC61B、THBS1、F13A1为差异表达基因中的Hub基因。结论 COPD肺组织中共有117个基因差异性表达,上调表达基因63个,下调基因54个;这些差异性表达基因主要参与细胞外基质改变、纤维化和氧化还原活性等信号通路;VWF、FGG、IGF1、F5、RPS15、RPS12、SEC61B、THBS1和F13A1为Hub基因,可能在COPD的疾病进程中发挥了关键作用。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
互作基因论文参考文献
[1].周非凡,刘瑜,常鑫磊,林拥军.OsCPK12基因功能研究和互作蛋白筛选[J].华中农业大学学报.2019
[2].刘兆宇,胡腊,曾子成,林海,李明.COPD相关差异表达基因筛选、生物学功能分析及其编码蛋白互作网络分析[J].山东医药.2019
[3].林志坚,廖卫平.基因互作网络分析CNTN2、EFHC1/CCDC150基因为特发性全面性癫痫候选基因[C].第八届CAAE国际癫痫论坛论文汇编.2019
[4].刘列,秦蔚,孙玚,刘欣茹,罗琼.水稻与纹枯病菌互作中免疫相关基因的表达研究[J].云南农业大学学报(自然科学).2019
[5].王存忠.西北水地春小麦基因型与环境互作及其产量稳定性探讨[J].农业开发与装备.2019
[6].刘列,张世梅,王明环,张杰,杨敏.水稻与弱毒丝核菌互作中免疫相关基因表达研究[J].中国植保导刊.2019
[7].李燕飞,辛玉琼,高世东,赵培玉,刘舞贞.甘蓝型油菜CIPK22基因的特性分析与互作蛋白CBL的鉴定[J].植物生理学报.2019
[8].申雅文,马田田,霍春月,杨宗霖,路一平.家蚕snoRNABm-15的细胞定位及与类Notch受体基因的互作关系[J].昆虫学报.2019
[9].刘佩佩,苗晶晶,刘力铷,姚琳琳,潘鲁青.菲律宾蛤仔雌激素相关受体基因克隆及互作蛋白筛选[J].中国海洋大学学报(自然科学版).2019
[10].张蕴显,王雅梅,周萍.蚁群优化算法构建乳腺癌中miRNA调控的关键基因互作网络[J].北京生物医学工程.2019
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