普通烟草ATⅢ氨基转移酶家族序列鉴定与表达分析

论文摘要

氨基转移酶是5’-磷酸吡哆醛依赖酶,在植物的生长发育和非生物胁迫的反应中起重要作用。ATⅢ氨基转移酶家族（classⅢ aminotransferase family）是转氨酶家族中一个非常重要的亚家族。本研究利用普通烟草（Nicotiana tabacum）基因组序列信息,鉴定出26个ATⅢ家族成员,对烟草ATⅢ家族进行理化性质分析表明,普通烟草ATⅢ家族成员之间的理化性质差异较大;系统进化和结构域分析显示,烟草ATⅢ家族成员可形成4个分支,同一分支内ATⅢ家族成员的保守结构域的种类和组织形式高度一致;将19个家族成员定位在12条染色体上;分析普通烟草转录组数据,结果显示大多数家族成员在不同组织中都有表达,主要集中在叶脉、打顶后茎和叶、离体叶片等组织。对NtATⅢ1和NtATⅢ2基因的qRT-PCR分析显示,这两个基因主要在植物地上组织中表达。本研究为普通烟草ATⅢ基因的功能研究提供依据。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 普通烟草ATⅢ家族蛋白质理化性质分析及进化分析
•   1.2 普通烟草ATⅢ蛋白结构域鉴定及保守结构域分析
•   1.3 染色体定位分析
•   1.4 普通烟草ATⅢ基因家族的组织表达分析
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 普通烟草ATⅢ家族蛋白质序列的鉴定及理化性质分析
•   3.2 普通烟草ATⅢ家族系统进化树的构建
•   3.3 普通烟草ATⅢ家族成员结构域分析
•   3.4 染色体定位分析
•   3.5 普通烟草ATⅢ基因的组织表达分析
•     3.5.1 转录组数据分析
•     3.5.2 普通烟草RNA的提取及反转录
•     3.5.3 qRT-PCR分析

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 王晓,王大伟,夏菲,李晓旭,吴华,姜山,孙玉合

关键词: 氨基转移酶家族,普通烟草,生物信息学分析

来源: 基因组学与应用生物学 2019年01期

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技,农业科技

专业: 生物学,农作物

单位: 中国农业科学院烟草研究所烟草行业烟草基因资源利用重点实验室

基金: 中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-TRIC02)资助

分类号: S572;Q943.2

DOI: 10.13417/j.gab.038.000251

页码: 251-259

总页数: 9

文件大小: 3773K

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