广西人群MALAT1基因启动子区rs600231和 rs4102217位点遗传多态性

广西人群MALAT1基因启动子区rs600231和 rs4102217位点遗传多态性

论文摘要

目的研究广西地区健康人群转移相关的肺腺癌转录物1(MALAT1)基因启动子区rs600231和rs4102217位点的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs),并与不同人群的数据进行比较。方法采取SNPscan高通量技术检测广西地区207例健康人群目标位点基因型,统计分析基因型和等位基因频率与人类基因组单体型图(Haplotype map, HapMap)公布的欧洲人群(HapMap-CEU)、北京汉族人群(HapMap-HCB)、日本人群(HapMap-JPT)和非洲人群(HapMap-YRI)数据间的差异。结果 rs600231A/G存在AA(38.2%)、AG(46.4%)、GG(15.4%)3种基因型,与HapMap-JPT、HapMap-YRI人群的多态性相比,差异有统计学意义(P<0.05);同HapMap-CEU人群比较,其基因型差异无统计学意义(P>0.05),但等位基因分布差异有统计学意义(P<0.05);rs4102217 G/C存在GG(75.4%)、CG(23.2%)、CC(1.4%)3种基因型,同HapMap-CEU和HapMap-JPT人群多态性相比,差异均有统计学意义(P<0.05);此外,上述两位点多态性在性别差异无统计学意义(P>0.05)。结论广西地区健康人群MALAT1启动子rs600231A/G和rs4102217G/C位点存在多态性,且在不同地区呈现不同程度的分布差异。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 研究对象
  •   1.2 主要仪器与试剂
  •   1.3 方法
  •     1.3.1 标本采集
  •     1.3.2 样本DNA制备
  •     1.3.3 引物设计与合成
  •     1.3.4 SNP scan分型检测
  •   1.4 实验数据处理
  • 2 结果
  •   2.1 rs600231A/G和rs4102217G/C位点多态性实验结果
  •   2.2 两位点多态性与不同人群的比较
  •   2.3 rs600231A/G和rs4102217G/C位点多态性在性别间的比较
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王艳,刘纯宏,谭昙,雷茗,黄艳云,蓝艳,韦叶生

    关键词: 转移相关的肺腺癌转录物,多态性,启动子区,广西人群

    来源: 临床检验杂志 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,基础科学

    专业: 生物学,基础医学

    单位: 右江民族医学院附属医院检验科,右江民族医学院附属医院皮肤科,桂林医学院附属医院检验科

    基金: 国家自然科学基金(81560552),广西壮族自治区本级财政科技计划项目(2018AB58018),广西自然科学基金(2018GXNSFAA138120)

    分类号: R394

    DOI: 10.13602/j.cnki.jcls.2019.12.16

    页码: 941-945

    总页数: 5

    文件大小: 782K

    下载量: 47

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