藜麦GRF转录因子家族的鉴定及表达分析

论文摘要

生长调控因子（growth-regulatingfactor,GRF）是植物特有的一类转录因子,对植物的生长发育起重要的调控作用。藜麦是一种单体植物即可满足人体基本营养需求的食物,也是未来最具潜力的农作物之一。但是关于藜麦GRF基因家族的研究至今尚缺乏报道。因此,本研究利用生物信息学方法,对藜麦GRF基因进行全基因组鉴定,并对其理化性质、基因结构、保守结构域、系统发育关系及组织表达进行分析。结果表明,藜麦中共有18个GRF转录因子,蛋白长度77～621 aa,分子量8.81～67.38 kD,等电点5.23～9.37;每个成员含有1～4个内含子及2～5个外显子,这些GRF蛋白都具有由31～35个氨基酸组成的QLQ保守结构域或由25～43个氨基酸组成的WRC保守结构域。系统进化分析表明,藜麦与拟南芥的GRF转录因子亲缘关系比水稻更近。表达图谱显示,藜麦GRF基因具有明显的组织表达特异性,总体在种子中的表达量较高,其次是在花序和根中,在其他组织中的表达量相对较低。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 基因组数据和转录组数据的来源
•   1.2 藜麦GRF基因家族成员的鉴定及分析
•   1.3 系统进化树的构建
•   1.4 藜麦GRF基因结构分析
•   1.5 藜麦GRF家族成员保守结构域分析
•   1.6 藜麦GRF基因的组织表达分析
•   1.7 基因的荧光定量表达分析
• 2 结果与分析
•   2.1 藜麦GRF基因家族成员的鉴定及分析
•   2.2 藜麦GRF基因家族系统发育关系分析
•   2.3 藜麦GRF基因结构分析
•   2.4 藜麦GRF基因家族保守结构域分析
•   2.5 藜麦GRF基因家族的组织表达分析
• 3 讨论
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 时丕彪,何冰,费月跃,王军,王伟义,魏福友,吕远大,顾闽峰

关键词: 藜麦,转录因子,进化分析,表达分析

来源: 作物学报 2019年12期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,农作物

单位: 盐城市新洋农业试验站,江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所

基金: 江苏现代农业(蔬菜)产业技术体系(盐城)推广示范基地项目(JATS(2018)137),江苏省农业科学院探索性颠覆性创新计划项目(ZX(17)2015)资助~~

分类号: Q943.2;S519

页码: 1841-1850

总页数: 10

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