维药新塔花(Ziziphora bungena)zbHDS基因克隆及组织表达分析

论文摘要

对维药新塔花（Ziziphora bungena）萜类化合物生物合成途径中,关键酶1-羟基-2甲基-2-（E）-丁烯基-4-二磷酸合成酶HDS基因克隆,进行组织表达特异性分析,为研究新塔花萜类化合物生物合成途径与基因调控提供基础。结合新塔花转录组数据库,根据编码区序列设计引物,通过RT-PCR方法对Z. bungena基因HDS （zbHDS）的编码区cDNA进行克隆,对其进行相关生物信息学分析,通过Real-Time进一步分析其组织表达特异性。RT-PCR扩增了一个长2 465 bp的zbHDS （登录号:MG065856）基因片段,含一个2 229 bp的开放阅读框,编码742个氨基酸。进化树分析结果显示,与丹参（Salvia miltiorrhiza）具有较近的亲缘关系。Real-Time PCR结果显示zbHDS基因在各器官中均有表达,在茎和叶中表达量较高,根和花中表达量相对较低。本研究首次从新塔花中克隆HDS基因并获得其编码区序列,zbHDS基因具有组织表达特异性,为进一步研究新塔花中萜类化合物生物合成途径提供数据支持。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 zbHDS基因的克隆
•   1.2 zbHDS蛋白理化性质分析
•   1.3 zbHDS蛋白疏水性、信号肽、亚细胞定位及跨膜结构域预测与分析
•   1.4 zbHDS蛋白二级结构分析
•   1.5 zbHDS氨基酸序列系统进化分析
•   1.6 zbHDS mRNA在不同组织中相对表达分析
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 材料
•   3.2 主要试剂
•   3.3 总RNA的提取及cDNA的合成
•   3.4 新塔花zbHDS基因克隆与测序
•   3.5 zbHDS基因生物信息学及系统进化分析
•   3.6 Real-Time PCR

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 程波,何江,地力努尔·吐尔逊江,杨伟俊,满尔哈巴·海如拉,刘冲

关键词: 新塔花,羟甲基丁烯基磷酸合成酶,基因克隆,组织表达

来源: 基因组学与应用生物学 2019年06期

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技,农业科技

专业: 生物学,农作物

单位: 新疆维吾尔自治区药物研究所新疆维吾尔药重点实验室

基金: 新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(2017D01B45)资助

分类号: S567.239;Q943.2

DOI: 10.13417/j.gab.038.002686

页码: 2686-2691

总页数: 6

文件大小: 821K

下载量: 62