基于核酸分析的病原微生物分子流行病学进展

论文摘要

病原微生物分型是根据微生物的生物学特性确定不同来源分离株之间关联性的过程。传统的分型方法曾经在感染性疾病流行病学相关性调查研究中发挥过重要作用。始于20世纪70年代的核酸分析技术是分子流行病学研究的主要手段,历经了对病原体遗传物质从条带、带型、序列特征分析的变迁,不仅快速、敏感、准确、可重复性高,也可从理论和实践上完整描述包括毒力、进化、耐药性等在内的病原体遗传特征,解释不同分离株之间的克隆性和遗传相关性,推动了病原微生物分子流行病学发展。本文拟概述基于核酸分析技术,特别是核酸序列相关分析在病原微生物分子流行病学方面的进展。

论文目录

• 1 质粒图谱分析
• 2 染色体DNA分析
•   2.1 染色体REA
•   2.2 基于DNA-DNA杂交的RFLP分析
•   2.3 脉冲场凝胶电泳（PFGE）
• 3 核酸扩增分型
•   3.1 PCR-RFLP
•   3.2 随机扩增DNA多态性（RAPD）
•   3.3 重复序列PCR（rep-PCR）
•   3.4 扩增片段长度多态性（AFLP）
•   3.5 高分辨熔解（HRM）温度分析
• 4 基于核酸序列的分型方法
•   4.1 单基因序列分型
•   4.2 多位点序列分型（MLST）
•   4.3 全基因组测序（WGS）
• 5 小结与展望

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 陈爱平,张拥军,严延生

关键词: 病原微生物,分子流行病学,分型,全基因组测序,综述

来源: 中国病原生物学杂志 2019年12期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技

专业: 预防医学与卫生学

单位: 重庆医药高等专科学校,福建省疾病预防控制中心,福建省人兽共患病研究重点实验室,福建医科大学公共卫生学院教学基地

分类号: R181.3

DOI: 10.13350/j.cjpb.191226

页码: 1485-1489

总页数: 5

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