原子键电负性均衡方法论文_张妍妍

导读:本文包含了原子键电负性均衡方法论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:电负性,原子,电荷,模型,方法,硬度,顺式。

原子键电负性均衡方法论文文献综述

张妍妍[1](2009)在《应用原子—键电负性均衡方法对镉(Ⅱ)和银(Ⅰ)配合物的理论研究》一文中研究指出原子-键电负性均衡方法是在密度泛函理论和电负性均衡原理的基础上提出的。本文应用原子-键电负性均衡方法中的σ-π模型(ABEEM-σπ),通过大量的量子化学计算,利用最小二乘法并结合自编程序,拟合确定了金属镉(Ⅱ)离子和银(Ⅰ)离子以及与金属键连的氮、氧、硫、氯等原子和键的ABEEM-σπ参数。将这些参数应用到研究镉(Ⅱ)配合物和银(Ⅰ)配合物的电荷分布的计算,结果显示由ABEEM-σπ模型计算的电荷分布可与量子化学的计算结果相媲美,线性相关系数均在95%以上,发展了ABEEM-σπ模型在第五周期过渡金属中的应用。金属硫蛋白(MT)是广泛存在于生物体内的低分子量、富含半胱氨酸、可被金属和其他因素诱导合成的细胞内金属结合非酶蛋白质。因其独特的生物学功能,近年来国内外对金属硫蛋白各方面的研究日益受到重视。本文运用新发展的ABEEM-σπ参数,从蛋白质晶体结构数据库(PDB)中精心选择了10个金属硫蛋白分子,对其活性中心的电荷分布进行了计算,与从头算的电荷分布结果比较,线性相关系数均在90%以上。说明由ABEEM-σπ模型计算的电荷分布与量子化学计算结果有很好的一致性,并且验证了拟合的ABEEM-σπ参数是适用于大分子体系的。采用原子-键电负性均衡方法,只要知道所需分子体系的结构坐标,就可以快速准确确定相关原子以及有关区域的电荷分布。因此,在计算金属生物大分子时可以节省大量的计算时间。本文应用新发展的ABEEM-σπ参数,在计算电荷的基础上,从福井谦一函数(Fukui函数)出发,对金属硫蛋白的活性中心进行了研究,比较了金属离子与配位的半胱氨酸中的巯基硫原子的活性,得出了与文献报道一致的结论。(本文来源于《辽宁师范大学》期刊2009-06-01)

邹惠园[2](2009)在《应用原子—键电负性均衡方法研究钌配合物的性质》一文中研究指出1969年美国人Rosenberg发现顺铂具有抗肿瘤活性,随后人们相继合成出几千个类似的铂配合物,但是铂类配合物的毒副作用也十分明显,而且对不少肿瘤铂类药物并不起作用.这些就促使研究者的眼光转向开发非铂类金属抗癌药物.近年来,大多数报道认为钌类配合物具有低毒性、易吸收、被排泄快的特点,更重要的是它易于被肿瘤组织吸收,因此钌配合物是最有前途的抗癌药物之一.本文首次应用以密度泛函理论和电负性均衡原理为基础的原子-键电负性均衡方法(ABEEM)中的σ-π模型(ABEEMσ-π),对钌(Ⅱ)和钉(Ⅲ)体系进行研究.通过大量的量子化学计算,利用最小二乘法,并结合我们自编的程序,拟合确定了钌配合物的ABEEMσ-π各参数.并将其应用到计算钌药物及生物大分子的电荷分布,所得结果与从头算的结果很好地相关联,并且大大地缩短了计算所需时间,拓展了ABEEM在过渡元素第二周期的应用.我们进一步计算了不同价态钌的药物分子的Fukui函数.前人在对钌(Ⅲ)配合物抗癌活性研究的过程中,提出了“还原活化”假设,即钌(Ⅲ)配合物可能只是前体药物,在体内并不发挥疗效,只有被还原活化后才能与生物分子发生作用.我们的计算结果表明,在相同的配位环境中,钌的Fukui函数变化最大;同时,钌(Ⅱ)的Fukui函数又很明显地大于钌(Ⅲ),这说明钌(Ⅱ)不仅是反应的活性中心,而且低价态的钌(Ⅱ)比钌(Ⅲ)更易发生反应,这与实验相一致,验证了“还原活化”假设的正确性,表明ABEEM应用于钌配合物的研究,具有很好的应用前景.本文还应用ABEEMσ-π模型计算了一些杂环化合物的电荷分布.将我们拟合确定的杂环化合物的ABEEMσ-π各参数应用到研究几种典型的五元、六元、稠杂环以及叶酸及维生素B_2等药物分子体系的电荷分布.结果表明由ABEEMσ-π模型获得的电荷分布与量子化学方法的计算结果有很好的一致性,线性相关系数均达到0.98以上.这说明我们拟合的参数是正确的,也进一步验证了ABEEMσ-π模型的合理性和可靠性.为将来应用ABEEM/MM于上述领域内的相关分子性质的动态模拟研究打下了基础.(本文来源于《辽宁师范大学》期刊2009-05-01)

杨忠志,范文杰[3](2005)在《应用原子键电负性均衡方法σπ模型研究顺式丙烯酸的分子内氢键和构象》一文中研究指出在密度泛函理论框架下发展的原子键电负性均衡方法σπ模型(ABEEMσπ),在探讨有机分子体系的结构和性质等方面取得了令人满意的成果.本文利用该模型计算了顺式丙烯酸不同构象的氢键值.根据氢键能与构象稳定性的关系,预测并解释了构象的稳定性,并与从头计算结果相比较,取得了很好的一致性.(本文来源于《辽宁师范大学学报(自然科学版)》期刊2005年02期)

宋辉[4](2002)在《应用原子—键电负性均衡方法研究多肽分子》一文中研究指出分子的各种性质主要是由体系的电子密度决定的,因此获得体系的电荷分布随分子构型和化学环境而变化的信息十分重要。近年来,以电子密度为基本变量的密度泛函理论的发展,为模拟这种包括环境变化的电荷分布提供了一个直接而极具潜力的理论框架。在生物体系中,静电作用十分重要,而生物大分子的原子净电荷的计算就显得尤为重要。我们在电负性均衡原理的基础上,通过原子——键电负性均衡方法中的???模型,计算了一些生物大分子的总能量、电荷分布、整体硬度等,并对结果进行了讨论。同时利用算得的结果,计算了在生物分子构象中起着重要作用的氢键的能量,且计算结果与实验值符合的很好,并进行了相关的讨论。我们利用此模型算得的整体硬度也很好的解释了药物分子的结构和活性之间的关系。(本文来源于《辽宁师范大学》期刊2002-06-01)

许永[5](2001)在《原子—键电负性均衡方法中σπ模型的理论研究及应用》一文中研究指出发展准确、快速的计算方法来探讨大分子体系的结构和性质间的内在关系是当今理论化学界的热点课题之一。密度泛函理论下的电负性均衡原理能够很好处理该类问题。我们在电负性均衡原理基础上,通过原子-键电负性均衡方法中的σπ模型,利用最小二乘法拟合得到了一些原子和化学键的参数,并对参数反映出来的化学信息进行了讨论。应用上述方案,计算了一些分子的总能量、电荷分布、整体硬度等信息,并对结果进行了讨论。结果表明,我们得到的两套参数均是合理的。应用ABEEMσπ/STO-3G模型下的整体软度很好的解释了药物分子的结构和活性的关系。根据最大硬度原理,利用ABEEMσπ/3-21G参数的计算结果,能够很好地解释Diels-Alder反应的区位选择性。(本文来源于《辽宁师范大学》期刊2001-06-01)

原子键电负性均衡方法论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

1969年美国人Rosenberg发现顺铂具有抗肿瘤活性,随后人们相继合成出几千个类似的铂配合物,但是铂类配合物的毒副作用也十分明显,而且对不少肿瘤铂类药物并不起作用.这些就促使研究者的眼光转向开发非铂类金属抗癌药物.近年来,大多数报道认为钌类配合物具有低毒性、易吸收、被排泄快的特点,更重要的是它易于被肿瘤组织吸收,因此钌配合物是最有前途的抗癌药物之一.本文首次应用以密度泛函理论和电负性均衡原理为基础的原子-键电负性均衡方法(ABEEM)中的σ-π模型(ABEEMσ-π),对钌(Ⅱ)和钉(Ⅲ)体系进行研究.通过大量的量子化学计算,利用最小二乘法,并结合我们自编的程序,拟合确定了钌配合物的ABEEMσ-π各参数.并将其应用到计算钌药物及生物大分子的电荷分布,所得结果与从头算的结果很好地相关联,并且大大地缩短了计算所需时间,拓展了ABEEM在过渡元素第二周期的应用.我们进一步计算了不同价态钌的药物分子的Fukui函数.前人在对钌(Ⅲ)配合物抗癌活性研究的过程中,提出了“还原活化”假设,即钌(Ⅲ)配合物可能只是前体药物,在体内并不发挥疗效,只有被还原活化后才能与生物分子发生作用.我们的计算结果表明,在相同的配位环境中,钌的Fukui函数变化最大;同时,钌(Ⅱ)的Fukui函数又很明显地大于钌(Ⅲ),这说明钌(Ⅱ)不仅是反应的活性中心,而且低价态的钌(Ⅱ)比钌(Ⅲ)更易发生反应,这与实验相一致,验证了“还原活化”假设的正确性,表明ABEEM应用于钌配合物的研究,具有很好的应用前景.本文还应用ABEEMσ-π模型计算了一些杂环化合物的电荷分布.将我们拟合确定的杂环化合物的ABEEMσ-π各参数应用到研究几种典型的五元、六元、稠杂环以及叶酸及维生素B_2等药物分子体系的电荷分布.结果表明由ABEEMσ-π模型获得的电荷分布与量子化学方法的计算结果有很好的一致性,线性相关系数均达到0.98以上.这说明我们拟合的参数是正确的,也进一步验证了ABEEMσ-π模型的合理性和可靠性.为将来应用ABEEM/MM于上述领域内的相关分子性质的动态模拟研究打下了基础.

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

原子键电负性均衡方法论文参考文献

[1].张妍妍.应用原子—键电负性均衡方法对镉(Ⅱ)和银(Ⅰ)配合物的理论研究[D].辽宁师范大学.2009

[2].邹惠园.应用原子—键电负性均衡方法研究钌配合物的性质[D].辽宁师范大学.2009

[3].杨忠志,范文杰.应用原子键电负性均衡方法σπ模型研究顺式丙烯酸的分子内氢键和构象[J].辽宁师范大学学报(自然科学版).2005

[4].宋辉.应用原子—键电负性均衡方法研究多肽分子[D].辽宁师范大学.2002

[5].许永.原子—键电负性均衡方法中σπ模型的理论研究及应用[D].辽宁师范大学.2001

论文知识图

2 SOD 模型分子的 ABEEM 和 DFT 电荷分...Ni-SOD模型分子的ABEEM和DFT(B3LYP/6...2 SOD 模型分子的 ABEEM 和 DFT甲酰胺二聚体的结构图以六元环为基础的二维石墨类分子初始结...回答以下3个问题: (1) 为什么卟啉

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