BasS/BasR双组分系统调控禽致病性大肠杆菌耐药性的机制研究

BasS/BasR双组分系统调控禽致病性大肠杆菌耐药性的机制研究

论文摘要

禽致病大肠杆菌(Avian pathogenic Escherichia coli,APEC)是严重危害我国及世界上禽畜养殖业中常见的致病菌之一,尤其在鸡、鸭养殖业最为常见,因其发生及分布范围广,目前为止对于防治禽致病大肠杆菌病,除了大量使用抗菌药物外依然没有更好的办法。随着抗生素的长期使用以及滥用,导致耐药谱不断扩大,不仅造成其耐药性不断增强,而且还出现了多重耐药菌株。因此,寻找新的药物靶点十分重要。双组分调控系统是广泛分布于各种细菌体内的一种调控系统,BasS/BasR是大肠杆菌内一种信号转导系统。但在多重耐药菌株中,BasS/BasR是否与其耐药性有关联,学术界鲜有报道。转录组学的结果表明多重药物外排泵emrD的转录水平在basSR敲除株中发生了变化。此实验揭示了 BasS/BasR双组分系统对禽致病大肠杆菌耐药性的影响,进而说明BasSR双组分系统对耐药性的调控机制。通过转录组学分析,发现basSR基因敲除株的多个药物外排泵编码基因的转录水平与野生型菌株相比有显著性差异。1.为了验证野生株和敲除株的耐药程度,选用二倍稀释法对临床分离株APEC40、APEC40ΔbasSR 和 MG1655、MG1655ΔbasSR 进行耐药性实验。结果发现,APEC40和APEC40ΔbasSR对克林霉素、环丙沙星、四环素、多西环素和十二烷基硫酸钠的最小抑菌浓度分别为 1.0mg/mL、2.5μg/mL、12.5μg/mL、2.0mg/mL,MG1655 和MG1655ΔbasSR对林可霉素、红霉素、诺氟沙星和多西环素的最小抑菌浓度分别为1.2mg/mL、400μg/mL、2.5μg/mL、3.125μg/mL,说明basSR基因敲除后,APEC40ΔbasSR和MG1655AbasSR耐药性均有所降低。2.为进一步研究basSR基因敲除对菌株的影响,选用细菌存活率和比浊法对其进行研究,结果表明,当basSR基因敲除后,basSR基因敲除株表现出了对喹诺酮类、四环素类、林可霉素类及大环内酯类等抗菌剂的耐药性变化,说明BasSR系统对禽致病大肠杆菌的耐药性存在调控效应。3.通过RNA抽提、反转录PCR实验和实时荧光定量PCR(RT-qPCR)实验对耐药基因emrD的转录水平变化进行检测。结果发现,当basSR基因敲除后,敲除株的emrD基因转录水平与野生株相比,其转录水平不同程度的有所降低,而在回补菌株中,得到了显著的回补。说明basSR基因敲除后对emrD基因转录水平有显著的影响。4.关于BasS/BasR系统对耐药基因的调控研究,利用蛋白体外表达与纯化技术、蛋白-DNA凝胶阻滞技术等分子生物学手段研究BasR蛋白对emrD耐药基因的调控,确定直接调控或间接调控的调控类型。实验结果表明,BasR蛋白可以与emrD耐药基因的启动子区域发生特异性的结合。由此推断,BasSR系统是依赖于BasR蛋白直接调控耐药基因emrD的转录。该研究也为寻找防治禽致病大肠杆菌的潜在药物靶标以及探寻辅助抗生素治疗APEC感染的新思路提供重要的实验基础和科研依据。

论文目录

  • 致谢
  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 英文缩写词表
  • 文献综述
  •   1 大肠杆菌研究概况
  •   2 禽致病性大肠杆菌毒力因子
  •     2.1 菌毛
  •     2.2 肠毒素
  •     2.3 外膜蛋白
  •   3 大肠杆菌耐药性研究概述
  •   4 双组分系统
  •   5 外排泵
  • 1 引言
  •   1.1 本课题研究的目的及意义
  •   1.2 国内外研究进展
  •   1.3 研究内容
  •   1.4 技术路线
  • 2 材料与方法
  •   2.1 实验材料
  •     2.1.1 菌株来源
  •     2.1.2 主要试剂
  •     2.1.3 酶及试剂盒
  •     2.1.4 主要仪器设备
  •     2.1.5 培养基和常用试剂的配制
  •   2.2 方法步骤
  •     2.2.1 目的菌株的鉴定
  •     2.2.2 药敏试验
  •     2.2.3 耐药基因的检测
  •     2.2.4 荧光定量PCR
  •     2.2.5 BasR蛋白的纯化表达
  •     2.2.6 凝胶阻滞实验(EMSA)
  • 3 结果与分析
  •   3.1 药敏试验
  •     3.1.1 二倍稀释法检测野生株及敲除株的MIC值
  •   3.2 BasSR系统对菌株生长的影响
  •     3.2.1 细菌存活率法检测野生株及敲除株的生长情况
  •     3.2.2 比浊法检测野生株及敲除株的生长情况
  •   3.3 耐药基因的检测
  •     3.3.1 PCR扩增耐药基因
  •   3.4 RT-qPCR检测emrD的转录水平
  •     3.4.1 总RNA质量鉴定
  •     3.4.2 RT-qPCR检测emrD转录水平
  •   3.5 BasR蛋白的表达与纯化
  •     3.5.0 表达载体的构建及验证
  •     3.5.1 BasR蛋白表达
  •     3.5.2 BasR蛋白纯化与浓缩
  •     3.5.3 BasR蛋白对emrD的调控机制
  • 4 讨论
  •   4.1 禽致病大肠杆菌耐药现状
  •   4.2 禽致病性大肠杆菌耐药机制研究
  •   4.3 双组分系统对禽致病性大肠杆菌耐药性的影响
  •   4.4 RT-qPCR对emrD转录水平的检测
  •   4.5 BasSR系统对emrD的调控机制
  • 5 结论
  • 参考文献
  • 作者简介
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 李静

    导师: 薛挺

    关键词: 双组分系统,耐药性,禽致病大肠杆菌,多重耐药外排泵,抗菌剂

    来源: 安徽农业大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 安徽农业大学

    分类号: S852.61

    DOI: 10.26919/d.cnki.gannu.2019.000031

    总页数: 67

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