导读:本文包含了新基因亚型论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:亚型,基因,猪瘟,法兰西共和国,病毒,乙型肝炎,流行病学。
新基因亚型论文文献综述
任创创,陈钦艳,王学燕,杨庆利,胡莉萍[1]（2019）在《广西那坡县发现乙肝病毒新基因亚型D11》一文中研究指出目的 2011年,在广西那坡县发现一例HBsAg阳性携带者,其所携带的HBV利用S基因序列分型法无法分型,本研究意在用全基因组分型法对其进行分型。方法为便于前后对比,除2011年血清标本外,还收集该携带者2018年的血清标本。检测前后2份标本HBV血清标志物和病毒载量,使用酚氯仿法提取HBV DNA,巢式PCR扩增HBV全基因组,将扩增产物进行克隆并测序。利用软件Mega 6.0、 Bioedit 7.0对测序结果进行分析。结果 2011年和2018年的2份标本HBsAg均为阳性, 2份标本的PCR产物分别获得15个克隆株。对获得的克隆株进行生物信息学分析发现, 2011年该携带者体内乙肝病毒基因型为B型、 D型以及未知基因型; 2018年该携带者体内乙肝病毒基因型仅为D型。30个克隆株中有23个单独聚集成簇, bootstrap值为100%,与D1-D10亚型间核苷酸的差异>4%。结论该携带者体内的HBV基因型为新基因亚型D11。(本文来源于《应用预防医学》期刊2019年02期）
冯丽苹,张洪亮,彭金美,刘春晓,王倩[2]（2016）在《两株2.1d新基因亚型猪瘟病毒的全基因组序列分析及其基因亚型分子特征》一文中研究指出为研究猪瘟病毒(CSFV)2.1d新基因亚型的基因组特征,本研究根据Gen Bank中登录的Zj0801株CSFV全基因组序列设计合成6对引物,通过RT-PCR方法对2014年分离自山东的两株2.1d亚型CSFV(SDSG1410和SDLS1410)进行全基因组测序,两株CSFV全长均为12 296 nt。全基因组遗传演化分析表明这两个分离株位于一个独立分支中,属于2.1d亚型,与E2基因分型结果一致。核苷酸和推导氨基酸同源性分析显示,分离株全基因组同源性与参考株相比差异较大,与Zj0801株的全基因组同源性最高为97.3%~97.5%,而与1.1亚型的Shimen和HCLV株的同源性仅为85.0%~85.1%和84.3%~84.4%;部分基因和非翻译区变异较大,如N~(pro)、C、E2、NS2、NS5A和3'UTR。对全基因组氨基酸序列分析,结果显示2.1d亚型CSFV在V~(640)、K~(992)、A~(1020)、M~(1090)、R~(1395)和D~(2374) 6处氨基酸上具有共同的分子特征。以上研究结果增加了CSFV 2.1d新基因亚型的分型依据。(本文来源于《中国预防兽医学报》期刊2016年01期）
冯丽苹,张洪亮,刘春晓,冷超粮,陈家锃[3]（2015）在《2015年我国部分地区2.1d新基因亚型猪瘟病毒的分子流行病学分析》一文中研究指出为了解猪瘟病毒(CSFV)在我国的流行情况,本研究对2015上半年来自4个省疑似猪瘟(CSF)病料样品采用RT-PCR方法进行检测,28份样品中14份为CSFV阳性,并对这些阳性样品进行CSFV E2基因遗传进化分析。结果表明,14个病毒株中11个属于2.1d新基因亚型,它们与CSFV代表株Shimen、HCLV和2.1b基因亚型病毒株的核苷酸同源性分别为82.8%~84.1%、81.1%~82.4%和92.6%~97.1%,氨基酸同源性分别为89.8%~91.2%、88.2%~89.8%和94.1%~98.9%,其余3个病毒株属于2.1b亚型。这些2.1d亚型新分离株在E2基因的4个氨基酸(R31、S34、K303和A331)上具有相同的分子特征。本研究结果与我们2014年CSFV流行病学研究结果一致,表明2.1d亚型病毒株已成为我国现阶段CSFV的主要流行株。(本文来源于《中国预防兽医学报》期刊2015年09期）
卢肖霞,徐韫健,谭皓妍,梁权辉,张东梅[4]（2011）在《CMY-39新基因亚型AmpC β-内酰胺酶的特性研究》一文中研究指出目的对弗劳地枸橼酸杆菌所产CMY-39新基因亚型AmpCβ-内酰胺酶进行酶特性研究。方法 pET-32a(+)/CMY-39表达质粒在BL21(DE3)中诱导表达,进行SDS-PAGE电泳和Western blotting鉴定酶蛋白的表达;原菌株和重组表达菌株进行药敏试验,并提取重组表达菌株的CMY-39酶蛋白进行AmpC酶叁维试验和酶动力学检测。结果 pET-32a(+)/CMY-39在大肠埃希菌中大量表达,蛋白相对分子质量约为60000,用特异抗体经Western检测该条带为阳性;AmpC酶叁维试验为阳性;CMY型重组菌株药敏试验结果与原菌株相比,对青霉素类和头孢西丁具有明显的水解作用,第叁、四代头孢菌素对之较为稳定,动力学结果与酶稳定性结果基本一致。结论证实重组菌株pET-32a(+)/CMY-39能高效表达CMY-39酶蛋白,表达CMY型重组菌株与原菌株比较,对β-内酰胺类抗生素的敏感性和稳定性有所增加,亲和力下降。(本文来源于《热带医学杂志》期刊2011年11期）
廖伟娇,江洁华,徐韫健,李宁[5]（2011）在《复合转座子ISEcp1B与IS903介导CTX-M ESBLs新基因亚型传播机制的研究》一文中研究指出目的研究肺炎克雷伯菌Kp49,CTX-M型超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)新亚型的基因环境,并分析其传播的分子机制。方法用K-B药敏法分析肺炎克雷伯菌Kp49的耐药性;用多重聚合酶链反应(PCR)技术扩增CTX-M-G1、TEM、SHV、DHA、ACT、IMP-1、VIM-1、ISEcp1B、IS903及Ⅰ类整合子,PCR扩增ISEcp1B下游的CTX-M型ESBLs全序列并测序。结果肺炎克雷伯菌Kp49只对亚胺培南敏感,对其余21种抗菌剂均耐药。检出TEM、SHV、CTX-M-G1及DHA基因Ⅰ类整合子。检出1种新的CTX-M ESBLs基因亚型,全长876 bp,与blaTX-M-14相比有1个核苷酸不同(GenBank登陆号:EF446126)。blaCTX-M-like的上游是ISEcp1B的遗传元件,下游是插入序列IS903的保守序列组成复合转座子。可能是ISEcp1B序列通过转座子机制俘获β-内酰胺酶,并提供-35及-10位点2个启动子,对下游CTX-M型ESBLs的高水平表达起重要的调控作用。结论插入序列ISEcp1B与IS903组成的复合转座子可能介导了新的CTX-M ESBLs基因亚型的水平传播,并驱使其高度表达,使Kp49对多种抗菌剂耐药。(本文来源于《国际检验医学杂志》期刊2011年10期）
徐韫健,张晓坤,廖伟娇,黎文成,李凯华[6]（2011）在《CMY-39型AmpC酶新基因亚型的序列分析与原核表达》一文中研究指出目的对弗劳地枸橼酸杆菌所产CMY-39型AmpC酶新基因亚型进行基因克隆和重组表达。方法以产CMY-39型AmpC酶新基因亚型的弗劳地枸橼酸杆菌总基因组DNA为模板,PCR扩增CMY-39,将其克隆入pGEM-T载体后测定该核苷酸序列,再将CMY-39基因克隆到pET-32 a(+)系统进行重组,重组菌在大肠埃希菌BL21中表达,SDS-PAGE电泳鉴定酶蛋白的表达。结果 PCR扩增出大小为1 146 bp的基因片段,与GenBank上CMY-39的基因序列同源性为99%。大肠埃希菌BL21转化pET-32 a(+)/CMY-39重组质粒后,AmpC酶叁维试验为阳性。此基因能在大肠埃希菌中大量表达,SDS-PAGE电泳显示,蛋白分子质量大约为60 kD。结论此基因为CMY-39新基因亚型,登陆号为HM565135;成功表达重组的CMY-39型酶,为进一步做酶动力学及酶的其他分子生物学特性研究奠定了基础。(本文来源于《中国微生态学杂志》期刊2011年04期）
徐兴然,肖昌,梁龙,余兴龙,张青婵[7]（2005）在《系统发生分析发现牛病毒性腹泻病病毒新基因亚型》一文中研究指出本研究对我国首次分离获得的牛源牛病毒性腹泻病毒(BVDV)毒株Changchun 184(CC-184)和猪源牛病毒 性腹泻病毒ZM-95进行了遗传衍化关系研究。选择主要抗原E2基因为研究对象,首先应用RT-PCR及套式PCR 克隆得到CC-184和ZM-95的E2片段,通过序列测定发现CC-184和ZM-95 E2基因长度分别为1,122bp和1, 125bp,各自编码374和375个氨基酸残基。核酸序列同源性比较和系统发生分析表明2株病毒均属于BVDV-1, CC-184与Osloss亲缘关系最近,都属于已有的b基因亚型,其E2基因同源性达91．8％。而ZM-95的E2基因有 一个特征性的变异区,包含一个密码子序列插入,这一变异区编码了一段有别于其他瘟病毒的五肽氨基酸序列 HYKKK。结果还表明ZM-95与BVDV-1现有的5个基因亚型的亲缘关系均较远,E2基因同源性最高(与Oregon c24v)只有72．4％。而BVDV-1亚型内毒株间的同源性大于85％,亚型间的同源性在69％～75％之间,充分说明 ZM-95是BVDV-1中一个新发现的基因亚型。通常认为猪源BVDV来源于牛,应该与牛源BVDV有十分近的遗 传关系,但是本研究发现ZM-95与其他已知牛源BVDV较低的基因同源性说明猪源BVDV还具有独立的遗传衍 化与传播来源的可能性。(本文来源于《中国病毒学》期刊2005年06期）
周康凤[8]（2002）在《法国HAV爆发中Ⅰa和Ⅰb亚型同时流行并发现一新基因谱系》一文中研究指出1999年1月3日～3月2日,在盛产贝类的法国布列塔尼北部爆发了甲型肝炎。作者对其进行了流行病学调查,并收集了11例患者的急性期血清样本,用Abbott试剂盒检测血清HAV IgM。 作者先用QIAamp Viral RNA试剂盒提取了(本文来源于《国外医学(流行病学传染病学分册)》期刊2002年02期）
新基因亚型论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
为研究猪瘟病毒(CSFV)2.1d新基因亚型的基因组特征,本研究根据Gen Bank中登录的Zj0801株CSFV全基因组序列设计合成6对引物,通过RT-PCR方法对2014年分离自山东的两株2.1d亚型CSFV(SDSG1410和SDLS1410)进行全基因组测序,两株CSFV全长均为12 296 nt。全基因组遗传演化分析表明这两个分离株位于一个独立分支中,属于2.1d亚型,与E2基因分型结果一致。核苷酸和推导氨基酸同源性分析显示,分离株全基因组同源性与参考株相比差异较大,与Zj0801株的全基因组同源性最高为97.3%~97.5%,而与1.1亚型的Shimen和HCLV株的同源性仅为85.0%~85.1%和84.3%~84.4%;部分基因和非翻译区变异较大,如N~(pro)、C、E2、NS2、NS5A和3'UTR。对全基因组氨基酸序列分析,结果显示2.1d亚型CSFV在V~(640)、K~(992)、A~(1020)、M~(1090)、R~(1395)和D~(2374) 6处氨基酸上具有共同的分子特征。以上研究结果增加了CSFV 2.1d新基因亚型的分型依据。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
新基因亚型论文参考文献
[1].任创创,陈钦艳,王学燕,杨庆利,胡莉萍.广西那坡县发现乙肝病毒新基因亚型D11[J].应用预防医学.2019
[2].冯丽苹,张洪亮,彭金美,刘春晓,王倩.两株2.1d新基因亚型猪瘟病毒的全基因组序列分析及其基因亚型分子特征[J].中国预防兽医学报.2016
[3].冯丽苹,张洪亮,刘春晓,冷超粮,陈家锃.2015年我国部分地区2.1d新基因亚型猪瘟病毒的分子流行病学分析[J].中国预防兽医学报.2015
[4].卢肖霞,徐韫健,谭皓妍,梁权辉,张东梅.CMY-39新基因亚型AmpCβ-内酰胺酶的特性研究[J].热带医学杂志.2011
[5].廖伟娇,江洁华,徐韫健,李宁.复合转座子ISEcp1B与IS903介导CTX-MESBLs新基因亚型传播机制的研究[J].国际检验医学杂志.2011
[6].徐韫健,张晓坤,廖伟娇,黎文成,李凯华.CMY-39型AmpC酶新基因亚型的序列分析与原核表达[J].中国微生态学杂志.2011
[7].徐兴然,肖昌,梁龙,余兴龙,张青婵.系统发生分析发现牛病毒性腹泻病病毒新基因亚型[J].中国病毒学.2005
[8].周康凤.法国HAV爆发中Ⅰa和Ⅰb亚型同时流行并发现一新基因谱系[J].国外医学(流行病学传染病学分册).2002
论文知识图
