兴义鸭MEF2C基因启动子区序列克隆与分析

论文摘要

为研究MEF2C基因启动子区SNPs对屠宰性状的影响,本实验运用直接测序法筛选兴义鸭MEF2C基因启动子区的SNP位点,并分析其与屠宰性状的相关性。结果表明:在兴义鸭MEF2C基因启动子上存在8个SNPs位点,分别为T-190A、A-232G、A-285G、A-617T、G-1420A、A-1437C、T-1504G、A-1524G;生物信息学分析发现T-190A、A-232G、G-1420A突变位点周围HOXA4、GCN4、Pit-1a、IRF-1等重要转录因子结合位点消失,继而生成Oct-1、ICSBP 2个新的转录因子结合位点;关联分析结果表明,T-190A不同基因型个体的兴义鸭活重存在显著差异,G-1420A不同基因型个体的兴义鸭腿肌率具有显著差异。由此推断,T-190A、G-1420A位点可能对调控兴义鸭MEF2C基因启动子区功能元件有重要影响,且2个多态性位点可能为影响兴义鸭屠宰性状的重要功能性SNP。本研究结果将为进一步确定MEF2C基因功能提供试验基础。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 实验材料
•   1.2 引物设计及PCR扩增
•   1.3 生物信息学分析
•     1.3.1 鸭MEF2C基因核心启动子预测
•     1.3.2 MEF2C基因启动子转录因子结合位点预测
•   1.4 SNPs筛选及关联性分析
• 2 结果与分析
•   2.1 基因PCR扩增结果
•   2.2 序列分析
•   2.3 MEF2C基因核心启动子预测结果
•   2.4 MEF2C基因SNPs突变对转录因子结合位点的影响
•   2.5 MEF2C基因启动子SNPs与屠宰性状的关联性分析
• 3 讨论
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 杨华婷,李辉,李兴才,赵忠海,师新彩

关键词: 兴义鸭,启动子,屠宰性状,生物信息学

来源: 中国畜牧杂志 2019年12期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 畜牧与动物医学

单位: 贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室

基金: 贵州省教育厅重点实验室开放课题基金资助项目(黔教合KY字[2018]475)

分类号: S834

DOI: 10.19556/j.0258-7033.20190403-04

页码: 102-105+139

总页数: 5

文件大小: 2010K

下载量: 75