论文摘要
基于茶树基因组数据,通过生物信息学方法,对茶树全基因组TCP家族成员进行染色体定位、基因结构、编码蛋白特性和系统进化关系分析,同时采用荧光定量PCR验证茶树TCPs在不同组织部位的相对表达水平。结果表明,茶树全基因组中共鉴定出36个具有典型TCP保守结构域的转录因子基因,其CDS全长和编码氨基酸的数量分别在453～1 824 bp和150～607 aa之间,命名为CsTCP1～CsTCP30。系统进化分析显示,茶树TCP转录因子家族可分为2个亚族:ClassⅠ和ClassⅡ,并可进一步分为8个亚组（A～H）,其中ClassⅠ亚族中的TCP蛋白属于PCF或TCP-P类型,而ClassⅡ可分为CYC/TB1和CIN两种类型。基因结构和保守结构域分析结果显示,同一亚组内,TCP蛋白具有相似的氨基酸结构和保守区域,而不同亚组之间具有较大差异,暗示不同类型TCP转录因子可能具有独特的生理功能。除CsTCP21b外,其余35个CsTCP基因在茶树叶片不同生长时期均有表达,但其表达水平呈现不同趋势;荧光定量分析显示其家族成员具有组织表达特异性;外源GA3和ABA处理可以显著激活或抑制该家族基因成员的表达。
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文章来源
类型: 期刊论文
作者: 温贝贝,罗勇,刘冬敏,张向娜,李娟,王英姿,王坤波,黄建安
关键词: 茶树,转录因子,全基因组,系统进化分析,定量表达
来源: 园艺学报 2019年12期
年度: 2019
分类: 农业科技
专业: 农作物
单位: 湖南农业大学茶学教育部重点实验室,国家植物功能成分利用工程技术研究中心,湖南省植物功能成分利用协同创新中心
基金: 国家自然科学基金项目（31670691,31500567,31470692)
分类号: S571.1
DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0320
页码: 2369-2382
总页数: 14
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