大黄鱼糟制过程中宏基因组学研究

论文摘要

采用宏基因组学技术分析不同糟制阶段大黄鱼的菌相变化,并确定糟制每个阶段的优势微生物。结果表明,糟制过程中菌相逐渐趋于单一,样品丰富度不断减少,多样性下降,均匀度变差。整个糟制过程中样品的优势菌以革兰氏阳性菌为主。细菌样品糟制前期(糟制1 d)芽孢杆菌属为优势菌,占45.06%,弧菌属和涅瓦菌属数量次之,分别占9.00%和6.71%。糟制后期(糟制30 d)魏斯氏菌属、涅瓦菌属、芽孢杆菌属和乳杆菌属,成为优势菌菌群的主要组成,分别占26.38%,15.35%,12.10%和7.59%。真菌菌相糟制前、后变化较大,糟制前期优势菌为柄孢壳属和毛孢子菌属,分别占8.46%和6.35%。糟制中期、威克汉姆酵母逐渐取代了其它大部分真菌,成为绝对优势菌,占94.71%。细菌样品属水平经聚类分析发现:酒糟样品和糟制1 d样品聚为一类,糟制4 d样品和糟制8 d样品聚为一类,鲜鱼样品、糟制16 d样品和糟制30 d样品各为一类。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料
•   1.2 仪器与设备
•   1.3 试验方法
•     1.3.1 样品处理与采集
•     1.3.2 宏基因组DNA提取
•     1.3.3 16S rDNA V4区和ITS1区的PCR扩增
•     1.3.4 构建上机文库并测序
•   1.4 统计与分析
•     1.4.1 原始双端序列的过滤和连接
•     1.4.2 优质序列的获取
•     1.4.3 OTU聚类
•     1.4.4 多样性分析
•     1.4.5 聚类分析
• 2 结果与分析
•   2.1 大黄鱼糟制过程总基因组DNA提取结果
•   2.2 糟制大黄鱼细菌16S rDNA V4区和真菌ITS1区扩增结果
•   2.3 原始数据整理、过滤及质量评估
•   2.4 OTU聚类结果
•   2.5 基于物种丰度分析
•   2.6 基于群落结构分析
•     2.6.1 样品群落组成分析
•     2.6.2 Beta多样性分析
•     2.6.3 聚类分析
• 3 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 蔡瑞康,吴佳佳,戴志远,叶剑,宋恭帅

关键词: 糟制大黄鱼,宏基因组学,菌相,聚类分析

来源: 中国食品学报 2019年01期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑

专业: 轻工业手工业

单位: 浙江工商大学海洋食品研究院,浙江省水产品加工技术研究联合重点实验室

基金: 浙江省自然科学基金青年科学基金项目(LQ15C200001),浙江省公益技术研究农业项目(2014C32048)

分类号: TS254.4

DOI: 10.16429/j.1009-7848.2019.01.025

页码: 190-199

总页数: 10

文件大小: 450K

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