导读:本文包含了小拟南芥论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:拟南芥,基因,生物,蛋白,生长素,获得性,抗性。
小拟南芥论文文献综述
黄薇,孙琦,刘芳,金玉环,罗先梅[1]（2019）在《小拟南芥激素相关基因及GH3.6的克隆与表达》一文中研究指出植物激素是植物体内产生的一些微量的、能调节自身生理过程的有机化合物,生长素是一种重要的植物激素,在植物生长发育的过程中起着重要作用。为了探索激素相关基因在短命植物小拟南芥(Arabidopsis pumila)逆境适应过程中的作用,本研究基于小拟南芥响应高盐胁迫叶片转录组数据库,首先筛选出2156个激素相关基因,包括生长素、脱落酸、乙烯、水杨酸、茉莉酸、油菜素内酯、细胞分裂素及赤霉素相关的基因,其中生长素和脱落酸相关基因所占比例最多并且多为上调表达。进一步通过分层聚类(H-Cluster),K均值聚类(K-means Cluster)和密度聚类(SOM Cluster)分析持续上调的基因,发现一个编码吲哚乙酸酰胺合成酶的基因GRETCHEN HAGEN 3. 6(GH3. 6)在高盐胁迫过程中明显上调表达。采用RT-PCR克隆小拟南芥Ap GH3. 6基因,其开放阅读框长为1839 bp,编码612个氨基酸。系统进化分析表明,Ap GH3. 6与山"菜(Eutrema salsugineum) GH3. 6进化关系最近,属于同一进化分支。转录组数据分析表明在250 m M Na Cl下,Ap GH3. 6持续上调表达;实时荧光定量PCR分析表明Ap GH3. 6在小拟南芥各个组织中均有表达,但在花中表达量最高;高盐胁迫表达分析表明,随着胁迫时间增加,Ap GH3. 6表达量不断升高。为了进一步研究该基因的功能,构建了植物过量表达载体35S∶Ap GH3. 6并转化农杆菌GV3101。本研究为深入分析激素相关基因在小拟南芥响应盐胁迫中的功能机制奠定了基础。(本文来源于《石河子大学学报(自然科学版)》期刊2019年03期）
刘芳,肖衡,金玉环,孙琦,黄薇[2]（2019）在《短命植物小拟南芥光周期调控基因CONSTANS的克隆与表达特征分析》一文中研究指出目的光周期是影响植物生长发育的重要因素之一,CONSTANS (CO)是植物光周期开花途径中关键的基因。方法本研究基于短命植物小拟南芥(Arabidopsis pumila)转录组数据库,获得1条与拟南芥CO基因At COL1基因序列高度相似的unigene,通过RT-PCR方法从小拟南芥中克隆了该CO同源基因,命名为Ap COL1;进行了基因的生物信息学分析及节律表达、组织表达和响应非生物胁迫的表达特征分析。结果研究结果表明Ap COL1具有两个Bbox和一个CCT结构域,氨基酸序列上与At COL1相似性高达86. 8%。系统进化分析表明Ap COL1与At COL1和琴叶拟南芥(Arabidopsis lyrata)的Al COL1亲缘关系较近,且属于第I亚组成员。qRT-PCR实验表明在长日照和短日照条件下Ap COL1具有相似的昼夜节律表达特征; Ap COL1在小拟南芥各组织中均有表达,但在果荚中表达量最高。250 mmol/L Na Cl胁迫和20%PEG-6000模拟干旱胁迫12 h明显抑制Ap COL1基因的表达,并且随着胁迫时间的延长Ap COL1表达水平没有显着差异。在高温(40℃)胁迫下,Ap COL1基因的表达在24 h内先下降后上升并达到最高,48 h又下降到对照水平。低温(4℃)胁迫24 h之前,Ap COL1基因的表达没有明显变化,但处理48 h表达水平显着下降。结论本研究表明Ap COL1基因能够响应盐、干旱、高温和低温等非生物胁迫,暗示该基因在小拟南芥抵抗逆境胁迫中起着重要作用。(本文来源于《石河子大学学报(自然科学版)》期刊2019年02期）
孙琦,黄薇,刘芳,金玉环,肖建旺[3]（2019）在《小拟南芥转运蛋白基因及NHX2基因的克隆与表达》一文中研究指出转运蛋白(transport protein)是膜蛋白的一大类,介导生物膜内外的化学物质及信号的交换。植物体内存在多个与Na~+转运相关的蛋白,其中液泡膜Na~+/H~+逆向转运蛋白(Vacuolar Na~+/H~+antiporter,NHX)在离子稳态和提高植物耐盐性方面发挥着重要作用。为了深入了解转运蛋白基因在短命植物小拟南芥(Arabidopsis pumila)耐盐方面的作用,本研究首先基于小拟南芥响应高盐胁迫叶片转录组数据筛选出1157个转运蛋白基因,按功能分为Na~+转运蛋白,K~+转运蛋白,Ca~(2+)转运蛋白,ABC转运蛋白以及糖转运蛋白等,其中功能注释为Na~+转运蛋白的基因有24个。K均值(K-means)聚类分析结果显示,1157个转运蛋白基因分布于20个K subcluster,其中在K6、K9、K15子聚类中的基因数量分布较多,分别为172、193、190个。在分布于K6子聚类的Na~+转运蛋白基因中,有一个编码NHX2蛋白的基因经盐胁迫处理后明显上调表达。采用RT-PCR克隆了Ap NHX2基因,Ap NHX2开放阅读框1626 bp,编码541个氨基酸。Ap NHX2蛋白是一个典型的跨膜转运蛋白,具有12个跨膜结构区。系统进化分析表明Ap NHX2与拟南芥At NHX2亲缘关系最近。实时荧光定量PCR分析显示,Ap NHX2基因在小拟南芥各组织中均有表达,但在花中表达量最高。为进一步研究该基因的功能,构建了过量表达载体35S∶Ap NHX2并转化农杆菌GV3101。本研究为进一步阐述转运蛋白基因在小拟南芥响应盐胁迫中的功能机制奠定了基础。(本文来源于《石河子大学学报(自然科学版)》期刊2019年02期）
周童,杨立飞,夏新宇,肖衡,黄先忠[4]（2018）在《新疆小拟南芥烯醛双键还原酶基因对转基因烟草耐盐性的影响》一文中研究指出为了研究前期从新疆小拟南芥中克隆的编码烯醛双键还原酶(alkenal reductase)Ap AER基因的功能,本研究构建了带有花椰菜花叶病毒(Ca MV)的35S启动子的植物过表达载体35S:Ap AER,并转化至农杆菌GV3101中,采用叶盘法转化烟草获得了转35S:Ap AER基因的烟草。用250 mmol/L的Na Cl溶液分别胁迫转基因和野生型烟草2和4 d,并测定了脯氨酸(Proline)和丙二醛(MDA)含量、过氧化氢酶(CAT)及过量化物酶(POD)酶活力等生理指标。结果表明:高盐胁迫下14 d,转基因烟草的长势明显优于野生型烟草,转基因烟草普遍植株较高、叶片大、叶色深;转基因烟草的Proline含量、CAT及POD酶活力均高于对照,而反映质膜受损情况的MDA含量显着低于对照。表明过表达Ap AER基因,能提高转基因植株清除醛自由基的能力、提高脯氨酸等渗透调节物质的含量及相关还原酶活性,从而显着提高转基因烟草的耐盐性。(本文来源于《石河子大学学报(自然科学版)》期刊2018年03期）
金玉环,刘芳,黄薇,孙琦,黄先忠[5]（2018）在《短命植物新疆小拟南芥高盐胁迫处理下内参基因的筛选》一文中研究指出新疆小拟南芥(Arabidopsis pumila)是早春短命植物,广泛分布于新疆极端环境,是研究生物和环境适应机制较好的模式材料.实时荧光定量PCR(qRT-PCR)是一种常用的可以快速获取基因表达的分析方法,而选择合适的内参基因是实时荧光定量PCR的前提.本研究从小拟南芥全长转录组数据库中选取了14个候选内参基因,利用qRT-PCR分析内参基因在250 mmol/L NaCl胁迫处理0、3、6、12、24和48 h共6个不同时间点样品中的基因表达,利用geNorm、Norm Finder和Bestkeeper叁种软件进行数据分析.结果显示:在250 mmol/L NaCl胁迫处理下,较为稳定表达的内参基因是GAPDH和ACT1.本研究筛选出高盐胁迫处理下的稳定表达的GAPDH和ACT1基因作为内参基因,对后续验证基因的表达和揭示小拟南芥耐逆机制具有重要意义.(本文来源于《玉林师范学院学报》期刊2018年02期）
林军,张亮,黄先忠[6]（2017）在《新疆小拟南芥NAC转录因子ApNAC055的克隆及表达分析》一文中研究指出本研究从新疆特色植物小拟南芥(Arabidopsis pumila)盐胁迫转录组数据结果中,得到1条与拟南芥NAC转录因子ANAC055(Gene Bank登录号为AEE75683.1)序列高度相似的Unigene。根据ORF序列设计引物,利用RT-PCR技术从小拟南芥叶片c DNA中克隆了该基因的coding sequence(CDS),命名为Ap NAC055。生物信息分析结果表明,Ap NAC055蛋白是1个无跨膜区域的亲水性蛋白,N端具有一段No apical meristem(NAM)保守结构域;该蛋白二级结构包含73个α-螺旋和33个β-转角。系统进化分析结果表明,Ap NAC055与芜菁NAC055进化关系较近,属于同一进化分支。实时荧光定量PCR(q RT-PCR)分析结果显示,Ap NAC055在小拟南芥各组织中均有表达,在叶片和果荚中表达量均较高,尤其在果荚中;盐胁迫处理可明显诱导Ap NAC055的表达。本研究表明,Ap NAC055可能在小拟南芥耐盐中起重要作用。(本文来源于《石河子大学学报(自然科学版)》期刊2017年06期）
刘慧,郭丹丽,蔡大润,黄先忠[7]（2016）在《小拟南芥ApZFP基因异源超表达促进拟南芥开花并提高耐逆性》一文中研究指出锌指蛋白(ZFP)是一类重要的转录因子,广泛参与植物的生长发育和非生物胁迫应答。新疆小拟南芥(Arabidopsis pumila)又名无苞芥,是十字花科短命植物,具有高光效、繁殖力强和适应干旱等生物学特征,而且比模式植物拟南芥(A.thaliana)更耐高盐胁迫。将前期克隆的小拟南芥锌指蛋白基因Ap ZFP通过花滴法转化到哥伦比亚生态型拟南芥(Col-0)中,获得了独立表达的转基因株系。表型观察发现,过量表达Ap ZFP基因可促使拟南芥在长短日照下均提前开花。实时荧光定量PCR结果显示,转基因拟南芥株系中,光周期途径中的CO基因和年龄途径中的SPL基因表达上调;春化、环境温度和自主途径中的FLC基因表达下调;编码成花素的基因FT及下游开花相关基因AP1和LFY的表达量均升高。进一步通过盐、干旱和ABA胁迫处理Ap ZFP转基因株系的种子和幼苗,发现在胁迫处理下,与对照相比,转基因拟南芥种子萌发率较高,幼苗主根较长。因此推测,Ap ZFP在植物发育过程中具有多种功能,可能既参与植物的开花转变过程,又同其它植物的锌指蛋白基因一样,参与植物的耐逆过程。(本文来源于《植物学报》期刊2016年03期）
郑丽洁,林军,黄先忠[8]（2016）在《小拟南芥双键还原酶基因OpDBR的克隆及表达分析》一文中研究指出从小拟南芥,又名无苞芥(Olimarabidopsis pumila,异种名Arabidopsis pumila)幼苗叶片c DNA文库中获得1条与拟南芥烯醛双键还原酶基因At DBR1(Gen Bank登录号为NP_197202.2)高度相似的EST序列,该序列包含1个1041 bp的最大开放阅读框(ORF),推测编码346个氨基酸(Gen Bank登录号为KU845686)。利用RT-PCR技术从小拟南芥叶片的c DNA中克隆了该基因,命名为Op DBR。比对分析结果表明,该基因属于中链还原/脱氢酶(medium chain reductase/dehydrogenases,MDR)超级家族,具有double bond reductase-like保守蛋白结构域;该蛋白的二级结构包含106个α-螺旋和48个β-转角。系统进化树分析结果表明,Op DBR编码产物与预测的亚麻芥烯醛双键还原酶(Gen Bank登录号为XP_010492631.1)遗传关系最为接近,属于同一进化分支。实时荧光定量RT-PCR(q RT-PCR)结果显示,Op DBR在小拟南芥的不同组织中都有表达,茎中表达量最高,根中最低。其在200 mmol/L Na Cl、4℃、100μmol/L ABA、20%PEG-6000处理下的表达结果分析显示,该基因可能在小拟南芥应对逆境胁迫时起着重要作用。(本文来源于《石河子大学学报(自然科学版)》期刊2016年02期）
裴娟,欧秀玲,李凤,孔德真,王琨[9]（2016）在《新疆小拟南芥NPR1基因对植物系统获得性抗性的影响》一文中研究指出旨在研究小拟南芥NPR1基因的第叁内含子对基因表达的影响。克隆出带有第叁内含子的小拟南芥NPR1基因,构建诱导型植物表达载体并对拟南芥进行农杆菌遗传转化,经5 mmol/L外源水杨酸12 h诱导,利用Real-time PCR技术检测拟南芥病程相关蛋白的表达量。结果显示野生型拟南芥的NPR1、PR-1、PR-2、PR-5表达量高于转基因拟南芥;相对于野生型拟南芥,转基因拟南芥中SOD、POD酶活显着降低,而CAT酶活增加未达到显着水平。结果表明转入含有第叁内含子的Ap.NPR1基因,转基因植株系统获得性抗性途径受到抑制,植株抗病性降低,说明第叁内含子使得系统获得性抗性途径的基因表达受到抑制。(本文来源于《中国农学通报》期刊2016年14期）
梁志强,孔德真,李辉玲,裴娟,祝建波[10]（2015）在《小拟南芥HDG12基因的克隆、生物信息学分析及植物表达载体的构建》一文中研究指出以小拟南芥基因组DNA为模板,运用同源克隆法获得小拟南芥HDG12基因,命名为Ap HDG12。运用生物信息学方法,对Ap HDG12基因的理化性质、保守序列、二级结构、亚细胞定位等进行了分析,并进行同源建模。经测序和生物信息学软件预测分析,结果显示,Ap HDG12基因由10个外显子和9个内含子组成,mRNA长度为2 064 bp,编码687个氨基酸,亚细胞定位于细胞核。系统进化树显示Ap HDG12与Capsella rubella遗传距离最近,CDD保守序列分析结果显示Ap HDG12有18~79位的同源异型域和206~436位的START结构域,属于HD-zipⅣ类基因家族,同时构建了植物表达载体p BI121::HDG12,转化到农杆菌GV3101中,为进一步研究基因功能奠定基础。(本文来源于《江苏农业科学》期刊2015年02期）
小拟南芥论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的光周期是影响植物生长发育的重要因素之一,CONSTANS (CO)是植物光周期开花途径中关键的基因。方法本研究基于短命植物小拟南芥(Arabidopsis pumila)转录组数据库,获得1条与拟南芥CO基因At COL1基因序列高度相似的unigene,通过RT-PCR方法从小拟南芥中克隆了该CO同源基因,命名为Ap COL1;进行了基因的生物信息学分析及节律表达、组织表达和响应非生物胁迫的表达特征分析。结果研究结果表明Ap COL1具有两个Bbox和一个CCT结构域,氨基酸序列上与At COL1相似性高达86. 8%。系统进化分析表明Ap COL1与At COL1和琴叶拟南芥(Arabidopsis lyrata)的Al COL1亲缘关系较近,且属于第I亚组成员。qRT-PCR实验表明在长日照和短日照条件下Ap COL1具有相似的昼夜节律表达特征; Ap COL1在小拟南芥各组织中均有表达,但在果荚中表达量最高。250 mmol/L Na Cl胁迫和20%PEG-6000模拟干旱胁迫12 h明显抑制Ap COL1基因的表达,并且随着胁迫时间的延长Ap COL1表达水平没有显着差异。在高温(40℃)胁迫下,Ap COL1基因的表达在24 h内先下降后上升并达到最高,48 h又下降到对照水平。低温(4℃)胁迫24 h之前,Ap COL1基因的表达没有明显变化,但处理48 h表达水平显着下降。结论本研究表明Ap COL1基因能够响应盐、干旱、高温和低温等非生物胁迫,暗示该基因在小拟南芥抵抗逆境胁迫中起着重要作用。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
小拟南芥论文参考文献
[1].黄薇,孙琦,刘芳,金玉环,罗先梅.小拟南芥激素相关基因及GH3.6的克隆与表达[J].石河子大学学报(自然科学版).2019
[2].刘芳,肖衡,金玉环,孙琦,黄薇.短命植物小拟南芥光周期调控基因CONSTANS的克隆与表达特征分析[J].石河子大学学报(自然科学版).2019
[3].孙琦,黄薇,刘芳,金玉环,肖建旺.小拟南芥转运蛋白基因及NHX2基因的克隆与表达[J].石河子大学学报(自然科学版).2019
[4].周童,杨立飞,夏新宇,肖衡,黄先忠.新疆小拟南芥烯醛双键还原酶基因对转基因烟草耐盐性的影响[J].石河子大学学报(自然科学版).2018
[5].金玉环,刘芳,黄薇,孙琦,黄先忠.短命植物新疆小拟南芥高盐胁迫处理下内参基因的筛选[J].玉林师范学院学报.2018
[6].林军,张亮,黄先忠.新疆小拟南芥NAC转录因子ApNAC055的克隆及表达分析[J].石河子大学学报(自然科学版).2017
[7].刘慧,郭丹丽,蔡大润,黄先忠.小拟南芥ApZFP基因异源超表达促进拟南芥开花并提高耐逆性[J].植物学报.2016
[8].郑丽洁,林军,黄先忠.小拟南芥双键还原酶基因OpDBR的克隆及表达分析[J].石河子大学学报(自然科学版).2016
[9].裴娟,欧秀玲,李凤,孔德真,王琨.新疆小拟南芥NPR1基因对植物系统获得性抗性的影响[J].中国农学通报.2016
[10].梁志强,孔德真,李辉玲,裴娟,祝建波.小拟南芥HDG12基因的克隆、生物信息学分析及植物表达载体的构建[J].江苏农业科学.2015
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