东北地区远东鼩鼱（Sorex isodon）遗传多样性与分子系统地理学分析

论文摘要

远东鼩鼱（Sorex isodon）隶属鼩鼱目（Soricomorpha）鼩鼱科（Soricidae）鼩鼱属（Sorex）的小型哺乳动物。本文采用Cyt b基因全序列分子标记的方法,对中国东北部地区的远东鼩鼱（Sorex isodon）的遗传多样性和分子系统地理学进行了研究。对遗传多样性的研究表明:（1）将获得的中国东北地区3个种群（大兴安岭、小兴安岭和长白山山脉）的远东鼩鼱77个样本进行测序,分析得到的Cyt b基因全序列,共获得64个单倍型。整体单倍型多态性（h）为0.9920,核苷酸差异平均数（i）为11.9490,核苷酸多态性（π）为0.0105,可见中国东北地区分布的远东鼩鼱整体具有较丰富的遗传多样性。从3个种群遗传多样性参数来看,长白山山脉种群具有最高的遗传多样性（h=0.9890、i=12.5810、π=0.0110）,暗示长白山山脉可能是远东鼩鼱末次冰期避难所。（2）对中国东北地区远东鼩鼱的3个种群进行分析,种群间的遗传距离的范围是0.0062-0.0154,采样点之间的遗传距离的则在0.0039-0.0152之间,东北地区远东鼩鼱3个种群的遗传距离与地理分布程正相关关系。（3）中国东北地区远东鼩鼱种群间的F-统计量与遗传相似系数的实验结果是一致的,并且与种群间的地理距离完全相符。（4）系统发生树显示远东鼩鼱样本首先分为两大支。一大支主要是由大兴安岭样本和小兴安岭样本构成,这个大分支中还存在一个由4个长白山山脉样本（YDFH1、YDHD11、YDHD21、YDHD26）构成的小分支,进一步暗示长白山山脉可能是冰期避难所。另一大支主要是由长白山山脉样本构成的;来自于南韩的样本存在于该大分支上,值得关注的大兴安岭的1个样本（YDHZ3）和小兴安岭1个样本（YDLB7）与长白山山脉1样本（YDHD25）,以及来自于芬兰和俄罗斯贝加尔湖地区的样本共同构成一个小分支,这个小分支也存在于该大分支上,进一步暗示长白山山脉可能是冰期避难所。（5）中性检验及构建错配分布图的分析均显示东北地区远东鼩鼱整体未历史过种群扩张。对分子系统地理学的研究表明:将获得的中国东北地区远东鼩鼱单倍型和来自于GenBank地区的远东鼩鼱单倍型构建中介网络图,结果显示中介网络图存在3个部分,一个部分主要是由中国东北地区大兴安岭和小兴安岭的样本具有的单倍型构成,同时也具有长白山山脉4个单倍型（3个黄色来自于横道河子地区,1个紫色来自于凤凰山地区）;另一部分完全是由中国东北地区长白山山脉单倍型构成;第三部分包括中国东北地区3个种群的单倍型,还包括俄罗斯贝加尔湖单倍型和芬兰单倍型。3个分支都具有长白山山脉单倍型,该中介网格分析结果暗示中国长白山山脉为远东鼩鼱末次冰期避难所。

论文目录

• 中文摘要
• abstract
• 第1章 绪论
•   1.1 鼩鼱属
•     1.1.1 鼩鼱属概述
•     1.1.2 鼩鼱属的分类
•     1.1.3 鼩鼱属的物种分布
•     1.1.4 生物学特性的研究
•       1.1.4.1 形态学特征
•       1.1.4.2 种群数量和种群动态
•       1.1.4.3 食性与能量
•       1.1.4.4 繁殖
•       1.1.4.5 栖息地选择
•     1.1.5 分子系统学
•     1.1.6 遗传多样性
•     1.1.7 分子系统地理学
•   1.2 远东鼩鼱
•     1.2.1 分类地位和地理分布
•     1.2.2 形态特征
•     1.2.3 生活习性
•     1.2.4 繁殖
•     1.2.5 生理学
•     1.2.6 生态学
•     1.2.7 分子生物学
•   1.3 本研究的意义
• 第2章 材料与方法
•   2.1 实验材料
•     2.1.1 实验对象
•     2.1.2 主要实验仪器
•   2.2 实验方法
•     2.2.1 提取全基因组DNA
•     2.2.2 PCR扩增
•     2.2.3 琼脂糖凝胶电泳检测
•     2.2.4 纯化与测序
•   2.3 数据处理
• 第3章 结果
•   3.1 东北地区远东鼩鼱的遗传多样性
•     3.1.1 中国东北地区远东鼩鼱Cyt b基因全序列的碱基组成及序列变异
•     3.1.2 中国东北地区远东鼩鼱的遗传多样性
•     3.1.3 中国东北地区远东鼩鼱的遗传距离
•     3.1.4 中国东北地区远东鼩鼱的遗传分化
•     3.1.5 远东鼩鼱的聚类分析
•   3.2 远东鼩鼱的分子系统地理学研究结果
•     3.2.1 远东鼩鼱的遗传距离
•     3.2.2 远东鼩鼱的聚类分析
•     3.2.3 远东鼩鼱的中介网格分析
•     3.2.4 中国东北地区远东鼩鼱的种群历史动态分析
• 第4章 讨论
•   4.1 中国东北地区远东鼩鼱的遗传多样性
•   4.2 远东鼩鼱鼩鼱的遗传分化
•   4.3 远东鼩鼱的分子系统地理学分析
• 第5章 结论
• 参考文献
• 致谢
• 攻读学位期间发表论文

文章来源

类型: 硕士论文

作者: 白薇

导师: 刘铸

关键词: 远东鼩鼱,细胞色素,遗传多样性,遗传结构,分子地理系统学

来源: 牡丹江师范学院

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学,生物学

单位: 牡丹江师范学院

分类号: Q953

DOI: 10.27757/d.cnki.gmdjs.2019.000142

总页数: 61

文件大小: 1715K

下载量: 80