计算生物学分析在基因组编辑研究中的应用

计算生物学分析在基因组编辑研究中的应用

论文摘要

基因组编辑是对基因组遗传信息进行定向改造的技术,其中CRISPR/Cas系统是目前应用最广泛的基因组编辑新技术。将先进的高通量测序以及相关计算生物分析应用于基因编辑研究,可进一步优化基因编辑效率和精度等检测流程,实现对全基因组功能基因筛选的监测。同时,利用基于生物信息及机器学习和深度学习等新方法,可对向导RNA(gRNA)的高效设计和实现对编辑效果的预测。本文将对计算生物学分析在CRISPR/Cas基因编辑系统的应用及研究进展等进行概述。

论文目录

  • 1 gRNA设计中的计算生物学分析
  • 2 利用高通量测序对CRISPR/Cas介导的基因组编辑效果进行评估
  • 3 整合高通量测序与相关计算分析, 利用CRISPR/Cas介导的基因组编辑实现全基因组水平基因的功能筛选
  • 4 机器学习在基因组编辑研究中的应用
  • 5 总结与展望
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王滢,熊义春,陈佳,杨力

    关键词: 基因组编辑,高通量测序,计算生物学,生物信息,机器学习,深度学习

    来源: 生命的化学 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 中国科学院计算生物学重点实验室中国科学院-德国马普学会计算生物学伙伴研究所中国科学院上海生命科学研究院营养与健康研究院中国科学院大学,上海科技大学生命科学与技术学院

    基金: 国家自然科学基金项目(31730111)

    分类号: Q78

    DOI: 10.13488/j.smhx.20181204

    页码: 28-38

    总页数: 11

    文件大小: 1177K

    下载量: 257

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