基于微卫星标记研究舟山群岛黄毛鼠种群的扩散模式

基于微卫星标记研究舟山群岛黄毛鼠种群的扩散模式

论文摘要

扩散是生物个体重要的生活史特征,对种群内的群体遗传结构和社会关系有重要影响。生态扩散是指个体从一个地点向另外一个地点运动。地下啮齿动物的繁殖、栖息地选择以及对其生存环境的破坏都与它们的扩散行为密切相关。研究地下啮齿动物的扩散行为,对控制危害、保护生物多样性具有十分重要的意义。啮齿目动物表现出高度多样化的扩散模式,但由于地下啮齿类动物栖息于地下,对其扩散模式的研究有一定难度。本研究采用8个微卫星位点遗传标记,对5个距离较近岛屿上的黄毛鼠种群的空间遗传结构和扩散模式展开研究,主要结果如下:1、在168个个体中共检测到95个等位基因,平均等位基因数目为12。观测杂合度显著高于期望杂合度,平均观测杂合度为0.936,平均期望杂合度为0.847。黄毛鼠种群具有较高的遗传多样性,平均多态信息含量为0.826。8个微卫星位点均显著偏离Hardy-Weinberg平衡。2、黄毛鼠各种群间的遗传分化程度较低,5个种群聚为了3簇,大猫岛种群与小猫岛种群为一簇,大摘箬山种群与小摘箬山种群为一簇,小盘峙种群单独为一簇。3、用分配检验法,在168个个体中共检测到34个扩散者,占总个体数的20%。小盘峙岛、小摘箬山、大摘箬山、大猫岛、小猫岛5个种群的扩散率分别为8.11%(3/37),14.81%(4/27),35.71%(10/28),34.29%(12/35),13.89%(5/36)。大摘箬山种群扩散范围最大,在其它4个种群中都有分布,其中大摘箬山种群与小摘箬山种群之间以及大猫岛种群与小猫岛种群之间个体扩散最为频繁,与种群地理分布格局相一致。4、黄毛鼠种群性别偏倚扩散分析结果:(1)F-统计量分析结果显示雌性的遗传分化系数(Fst=0.076)高于雄性的遗传分化系数(Fst=0.058),近交系数雄性间(Fis=-0.234)小于雌性间(Fis=-0.207);(2)分配检验得到雌性个体间的更正分配指数为0.068,雄性个体间的更正分配指数为-0.08;(3)距离隔离检验显示雌性个体的遗传距离与地理距离之间存在显著的正相关性(P<0.05),而雄性个体的遗传距离与地理距离之间存在负的相关性但并不显著(P>0.05);三种方法一致推断出黄毛鼠种群是雄性偏倚扩散。5、空间遗传学分析结果显示舟山群岛黄毛鼠个体间存在一种非随机的空间遗传结构,且符合地理距离隔离模型。空间自相关分析显示,这种遗传相似性发生的空间尺度在2.5 km距离范围内,表现为在这个距离尺度内具有正的自相关系数;在三个年龄组中,近距离内幼年组呈现出非随机分布的空间遗传结构,说明在采样期间主要是幼鼠进行扩散。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 1 绪论
  •   1.1 研究背景
  •   1.2 扩散
  •     1.2.1 扩散的概念
  •     1.2.2 扩散原因
  •     1.2.3 扩散的研究方法
  •   1.3 性别偏倚扩散
  •     1.3.1 偏倚扩散的概述
  •     1.3.2 性别偏倚扩散假说
  •     1.3.3 基于分子标记研究偏性扩散的方法
  •   1.4 空间遗传学
  •     1.4.1 概况
  •     1.4.2 研究方法
  •   1.5 研究内容
  •   1.6 研究目的和意义
  • 2 材料和方法
  •   2.1 研究地概况
  •     2.1.1 研究地概况
  •     2.1.2 物种概述
  •     2.1.3 样本采集
  •   2.2 实验方法
  •     2.2.1 实验试剂
  •     2.2.2 仪器设备
  •     2.2.3 基因组DNA的提取
  •     2.2.4 PCR扩增
  •   2.3 数据分析
  •     2.3.1 遗传多样性分析
  •     2.3.2 遗传结构
  •     2.3.3 性别偏倚扩散
  •     2.3.4 偏倚扩散的原因
  •     2.3.5 空间自相关分析
  • 3 结果与分析
  •   3.1 遗传多样性
  •   3.2 种群的遗传结构
  •   3.3 扩散率
  •   3.4 偏性扩散
  •     3.4.1 F-统计量
  •     3.4.2 分配检验
  •     3.4.3 地理隔离模型
  •   3.5 偏倚扩散的原因
  •   3.6 空间自相关分析
  •     3.6.1 黄毛鼠种群的空间遗传结构
  •     3.6.2 不同年龄组黄毛鼠群体的空间遗传结构
  • 4 讨论与结论
  •   4.1 遗传多样性
  •   4.2 遗传结构
  •   4.3 扩散率
  •   4.4 分配检验
  •   4.5 偏性扩散
  •   4.6 空间遗传结构
  •     4.6.1 黄毛鼠种群的空间遗传结构
  •     4.6.2 空间遗传结构发生的尺度
  • 展望
  • 参考文献
  • 攻读学位期间发表的研究论文
  • 致谢
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 刘小丽

    导师: 王艳妮

    关键词: 黄毛鼠,微卫星,性别偏倚扩散,空间遗传结构,舟山群岛

    来源: 浙江师范大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 浙江师范大学

    分类号: Q958

    DOI: 10.27464/d.cnki.gzsfu.2019.000193

    总页数: 58

    文件大小: 2186K

    下载量: 28

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