杉木BR生物合成酶ClDET2基因的克隆及表达分析

论文摘要

类固醇5α-还原酶（DET2）是BR生物合成的限速酶,是调控油菜素内酯生物合成的关键基因。为了了解油菜素内酯（BR）生物合成途径中限速酶DET2的作用,本研究以杉木低涩籽率家系L为材料,采用RTPCR法从杉木中克隆获得一个转录因子基因并命名为ClDET2。分析发现,该序列包含一个长度为840 bp的CDS基因序列（开放阅读框）,编码215个氨基酸,系统进化树分析显示,ClDET2与NCBI数据库中注释的北美云杉DET2基因亲缘关系最近。通过对ClDET2基因在种子发育的4个时期进行qPCR表达检测,发现其表达量从种子发育到成熟呈总体下降的趋势。这可能是ClDET2基因主要在种子发育前期的胚珠发育阶段表达高的原因,而6～7月份杉木种子胚胎发育阶段多涩粒产生,也可能与ClDET2表达量降低有关。以上结果为进一步研究杉木ClDET2基因的功能,以及阐明涩籽产生的分子机理提供了科学依据。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 杉木DET2基因的克隆
•   1.2 DET2同源性比较和系统进化树构建
•   1.3 DET2编码蛋白质理化性质及疏水性
•   1.4 DET2功能结构域分析、亚细胞定位及二级结构预测
•   1.5 DET2蛋白信号肽预测、磷酸化结构预测及蛋白跨膜结构预测
•   1.6 DET2基因在杉木种子发育不同时期的表达
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 植物材料
•   3.2 杉木总RNA提取和cDNA制备
•   3.3 杉木DET2基因的克隆
•   3.4 杉木DET2基因生物信息学分析
•   3.5 数据统计与分析
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 理挪,林思祖,张健,张家君,吕蒙,陈宇

关键词: 杉木,基因克隆,表达分析

来源: 分子植物育种 2019年24期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,林业

单位: 福建农林大学林学院,国家林业局杉木工程技术研究中心

基金: 国家林业局杉木工程技术研究中心平台建设(ptjh130002)资助

分类号: S791.27;Q943.2

DOI: 10.13271/j.mpb.017.008058

页码: 8058-8064

总页数: 7

文件大小: 2466K

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