论文摘要
逐个SNP的全基因组关联分析中的统计量不仅依赖于遗传效应,而且依赖于SNP,因此统计量不能直接应用于推断无遗传效应的零假设中。检测不同样本的QTN,常用的统计量除了卡方统计量,还有t统计量、F统计量和标准正态统计量。首先给出了各个统计量之间的关系,接下来针对冗余参数背景下的全基因组关联分析,提出了检验统计量阈值的快速计算方法。再次利用获得的高通量SNP的统计概率构建卡方统计量,进而估计临界值。最后模拟不同样本的阈值并与文献上提出的阈值算法比较。大量模拟实验证明,提出的方法快速而且有效。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 野金花,方铭,徐艳,高德宝,周晓晶,张巧生,张莹
关键词: 统计量,阈值,全基因组关联分析,模拟
来源: 黑龙江八一农垦大学学报 2019年03期
年度: 2019
分类: 农业科技,基础科学,医药卫生科技
专业: 生物学,生物医学工程
单位: 黑龙江八一农垦大学理学院,集美大学水产学院,黑龙江八一农垦大学动物科学技术学院
基金: 2017年大庆市指导项目(采用随机森林法解析猪的经济性状位点:zd-2017-76),2017年校内培育课题(动物全基因组关联分析的分层求解策略——基于随机回归模型:XZR2017-13)
分类号: Q811.4
页码: 125-130
总页数: 6
文件大小: 164K
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标签：统计量论文; 阈值论文; 全基因组关联分析论文; 模拟论文;