布鲁菌16M感染后宿主免疫相关蛋白质泛素化修饰的差异分析

布鲁菌16M感染后宿主免疫相关蛋白质泛素化修饰的差异分析

论文摘要

为探究布鲁菌感染宿主细胞早期泛素化修饰蛋白质组表达变化并筛选出影响免疫应答的关键调控蛋白,通过Label-free和泛素化富集技术以及高分辨率LC-MS/MS联用的定量蛋白质组学研究策略,对布鲁菌16M感染11 h (感染5 h,胞内复制6 h)后的巨噬细胞和未感染布鲁菌16M的巨噬细胞进行了泛素化蛋白质组学定量研究,数据库检索分析了16M感染后的巨噬细胞和未感染的巨噬细胞差异表达的泛素化位点对应的蛋白质,并应用生物信息学方法筛选出16M感染巨噬细胞后可造成宿主免疫抑制的关键蛋白质。结果显示,共鉴定出349个蛋白质上580个泛素化位点。布鲁菌16M感染组相对于未感染组167个蛋白质上259个位点泛素化修饰水平发生上调,212个蛋白质上321个位点泛素化修饰水平发生下调(差异倍数>1.5,P<0.05);35个泛素化修饰差异表达的蛋白质可能与布鲁菌感染后宿主的免疫应答有关,其中27个泛素化修饰的下调蛋白质(如Bcap31、Btk、Faf1和Akap31等),1个泛素化修饰上调蛋白质Ubqln1可能是布鲁菌感染宿主后造成免疫抑制的关键蛋白。本研究筛选获得了布鲁菌16M感染宿主细胞免疫相关差异表达的泛素化修饰蛋白质,初步揭示布鲁菌能够调控宿主免疫信号通路、自噬和凋亡等免疫应答过程中相关蛋白质的泛素化修饰,为进一步研究布鲁菌感染后调节宿主泛素化修饰进而形成免疫逃逸的分子机制提供理论基础。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 菌株、细胞和试剂
  •   1.2 蛋白质提取、胰酶酶解
  •   1.3 亲和富集
  •   1.4 液相色谱-质谱联用分析
  •   1.5 数据库搜索
  •   1.6 生物信息学分析
  • 2 结 果
  •   2.1 样品重复性检验
  •   2.2 质谱质控检测
  •   2.3 差异表达修饰位点的基序分析
  •   2.4 差异表达修饰位点对应的蛋白质生物过程分析
  •   2.5 16M感染后宿主免疫应答相关泛素化修饰蛋白质分析
  •   2.6 免疫应答相关泛素化修饰蛋白质的网络互作
  •   2.7 免疫应答相关蛋白质的泛素化类型富集分析
  • 3 讨 论
  • 4 结 论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 周玉成,郭梦楠,程世鹏,张海威,周曼莉,乔连江,杨艳玲

    关键词: 布鲁菌,泛素化修饰蛋白质组学,免疫抑制,免疫逃逸

    来源: 畜牧兽医学报 2019年11期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 中国农业科学院特产研究所,中国农业科学院兰州兽医研究所

    基金: “十三五”国家重大专项(2016YFD0500900),国家自然科学基金青年科学基金(31402183)

    分类号: S852.61

    页码: 2290-2301

    总页数: 12

    文件大小: 3391K

    下载量: 122

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