论文摘要
为研究金银花AP2转录因子参与低温的应答机制,本研究基于低温下金银花转录组测序数据,利用在线生物信息学工具对金银花AP2转录因子的理化性质、亚细胞定位、磷酸化位点、蛋白基序以及进化分析进行鉴定和分析;利用实时荧光定量PCR检测3个DREB基因和1个RAV基因在低温胁迫下的表达情况。结果表明,在金银花中共筛选了34个AP2转录因子,不同转录因子之间的理化性质存在差异,表明其在不同的微环境中发挥不同的功能;亚细胞定位结果显示,仅有2个AP2定位于叶绿体,其余均定位于细胞核,符合其作为转录因子调控下游基因的表达特性;所有AP2的磷酸化位点均依次表现为丝氨酸>苏氨酸>酪氨酸;根据AP2中所含有的AP2数量以及序列同源性,可将34个AP2分为四个大类,20个AP2属于ERF亚家族,3个属于DREB亚家族,RAV亚家族仅有1个,其余10个属于AP2亚家族。实时荧光定量PCR检测结果表明,DREB和RAV基因均能响应低温胁迫,且不同低温处理时间的不同组织的表达量存在差异。本研究为阐明金银花AP2转录因子响应低温胁迫的机制奠定了一定的理论基础。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 乔永刚,陈亮,崔芬芬,曹亚萍,王勇飞,宋芸
关键词: 金银花,转录因子,基因鉴定,表达分析
来源: 核农学报 2019年09期
年度: 2019
分类: 农业科技,基础科学
专业: 生物学,农作物
单位: 山西农业大学生命科学学院
基金: 山西省科技攻关项目(20140312001-2),山西省高等学校教学改革项目(J2015028,J2017031)
分类号: Q943.2;S567.79
页码: 1698-1706
总页数: 9
文件大小: 2852K
下载量: 609
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