导读:本文包含了区序列分析论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:序列,基因,乌头,病毒,子区,综合征,白斑。
区序列分析论文文献综述
胡露露,赵子雅,王瑞宁,王亚琪,刘铮铸[1]（2019）在《赤狐EDNRB基因编码区序列分析及启动子预测》一文中研究指出为了研究赤狐内皮素受体B基因(EDNRB)编码蛋白的结构、功能及预测其5′端上游2 000 bp的候选启动子区的核心启动子区与转录因子的结合位点,从NCBI数据库中获得赤狐EDNRB基因的数据,利用生物信息学方法分析其编码区及候选启动子区。结果表明:赤狐EDNRB基因编码氨基酸的总数为443个,编码产物为不稳定的疏水蛋白。二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,存在信号肽和二硫键。该编码蛋白存在于内质网、细胞质膜和线粒体中。该编码蛋白含有7次跨膜G蛋白偶联受体超家族结构域。赤狐与乌苏里貉的亲缘关系最近,与犬关系较近。该基因的5′端上游存在潜在的启动子区域,同时发现存在转录调控元件和转录因子结合位点,不存在CpG岛。通过对赤狐EDNRB基因进行生物信息学分析,能够初步预测其编码区的结构、功能以及该基因的核心启动子区与转录因子结合位点,为其遗传特性及调控机制的研究提供基本信息。(本文来源于《畜牧与兽医》期刊2019年08期）
王郅媛,姚婷,范雅为,张燕,王友升[2]（2018）在《华莱士瓜采后丝状真菌的分离及rDNA ITS区序列分析》一文中研究指出从采后贮藏期间自然发病的华莱士瓜上分离到12株丝状真菌,将分离菌经纯化后回接到健康无损的华莱士瓜上,发病特征与分离发病果实一致,确定其为华莱士瓜的病原菌。结合形态学观察和rDNA内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列分析,结果表明:分离到1株黑附球菌(Epicoccum nigrum)、1株草酸青霉菌(Penicillium oxalicum)、2株链格孢属(Alternaria Nees ex Wallr.)真菌、3株曲霉属(Aspergillus Micheli ex Fr.)真菌和5株镰刀属(Fusarium LK. ex Fr.)真菌。其中,黑附球菌(E. nigrum)为甜瓜中首次发现的病原菌,而草酸青霉菌(P. oxalicum)、细极链格孢菌(Alternaria tenuissima)、泡盛曲霉菌(Aspergillus awamori)、木贼镰刀菌(Fusarium equiseti)、轮状镰刀菌(F. verticillioides)和燕麦镰刀菌(F. avenaceum)分别为甜瓜上分离到的青霉属、链格孢属、曲霉属和镰刀属的新菌株。(本文来源于《食品科学》期刊2018年20期）
陈红莲,王永杰,程云生,宋光同[3]（2018）在《安徽省克氏原螯虾白斑综合征病毒缺失区序列分析》一文中研究指出为了解安徽省克氏原螯虾(Procambarus clarkii)白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)缺失区ORF23/24和ORF14/15的遗传差异及其与世界各地WSSV的遗传进化关系,2016年4月—8月,在安徽省6个市采集了9个养殖克氏原螯虾样本进行WSSV套式PCR检测,扩增病毒缺失区ORF23/24和ORF14/15,将获得的序列进行比较分析。结果显示,9个样本均在第1轮PCR扩增中获得阳性结果,其ORF23/24区与中国台湾株(TW)比对,缺失5 892 bp或9 310 bp,其ORF14/15区与WSSV祖先株(TH-96-Ⅱ)比对,缺失5138 bp或5948 bp。其中8个样本中WSSV与2008至2010年在江苏的克氏原螯虾中检测到的一些毒株的ORF23/24和ORF14/15区缺失情况相同,且这些病毒ORF14/15区均缺失5 138 bp,与TW株缺失情况相同。(本文来源于《水产科技情报》期刊2018年04期）
刘洋[4]（2018）在《猪ZBED6基因和Tβ4基因启动子核心区序列分析》一文中研究指出本课题组在前期民猪冷应激实验中筛选出ZBED6基因和Tβ4基因,二者表达均存在显着差异,以与肌肉生长发育相关的ZBED6基因和与毛囊发育、毛发生长显着相关的Tβ4基因为目的基因,分析启动子活性、筛选转录因子,以研究对民猪生长性状的转录调控的影响。锌指蛋白ZBED6(zinc finger bed domain containing 6,ZBED6)基因的突变,可促进骨骼肌中胰岛素样生长因子2(insulin-like growth factor 2,IGF2)转录水平的显着上调,从而促进细胞增殖和肌管形成。ZBED6的过表达不仅可以抑制IGF2的转录,还能调控下游上千个与发育类疾病、癌症和心血管疾病密切相关的重要基因。但关于该基因转录调控的作用机理目前尚不清楚,有待研究。胸腺素β4(thymosin beta4,Tβ4)基因是一个与毛囊发育和毛发生长显着相关的基因。利用胸腺素β4干预毛囊外毛根鞘细胞,其增殖效应明显,说明胸腺素β4通过刺激毛囊外毛根鞘细胞增殖分化能够促进毛囊生长,然而具体作用机制尚不明确。本研究利用分子生物学技术对ZBED6基因和Tβ4基因的5′端序列进行克隆,通过生物信息学方法预测两种基因潜在的转录因子结合位点,构建ZBED6基因和Tβ4基因5′端序列不同长度缺失片段的报告基因荧光表达载体,利用双荧光素酶报告系统对两种基因的启动子区进行活性分析,利用缺失突变和过表达技术确定两个基因的转录调控元件,获得主要研究结果如下:(1)以翻译起始密码子的“A”为+1,克隆得到猪ZBED6基因-2053~-21 bp序列,经双荧光素酶报告系统检测,具有启动子活性。分段缺失后发现最小活性区域位于-1808~-1777 bp之间,存在正调控元件。(2)利用在线软件预测ZBED6基因的-1808~-1777 bp区域内,存在CREMtaul、NKx2-5(var.2)、HINFP、Adf-1和CREB3五个转录因子结合位点。突变掉Adf-1和CREB3的识别位点能够极显着降低ZBED6基因的启动子活性(P<0.01)。但过表达CREB3元件,不能促进ZBED6基因的表达,说明(-2041/-1565)-pGL3区域内GACGT序列不是CREB3的结合位点。由于猪的Adf-1序列未知,暂只能确定ZBED6基因的最小活性区域在-1808~-1777 bp内。(3)以翻译起始密码子的“A”为+1,克隆得到猪Tβ4基因-1218~+29 bp序列,经双荧光素酶报告系统检测,具有启动子活性。分段缺失发现最小活性区域位于-155~-105 bp之间,存在正调控元件。(4)利用生物信息学软件预测Tβ4基因的-155~-105 bp区域内,存在ELK-1、MYBAS1和E2F-1叁个转录因子结合位点。突变掉ELK-1识别位点能够显着降低Tβ4基因的启动子活性(P<0.05)。过表达分析ELK-1转录元件可以促进Tβ4基因的表达,证明ELK-1是Tβ4基因转录调控的关键因子。(本文来源于《东北农业大学》期刊2018-06-01）
陈红莲,王永杰,蒋业林,程云生,张静[5]（2017）在《安徽省克氏原螯虾白斑综合征病毒变异区序列分析》一文中研究指出白斑综合征已给安徽省克氏原螯虾产业带来了巨大的经济损失。为了解安徽省白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)分子流行病学,2016年4—8月在安徽省6个市采集9个养殖的克氏原螯虾样本进行WSSV套式PCR检测,扩增病毒可变区ORF94、ORF75和ORF125,将获得序列进行比较分析。结果显示,9个样本均在第1轮PCR扩增中获得阳性结果,其ORF94的重复单元(repeat unit,RU)数量为2、4、7、8和12,2RUs为常见基因型,ORF75的组合RUs总数为3、6、9、10和11,9 RUs为常见基因型,排列顺序为45、102、45、102、3×45、102和45,ORF125的RUs为5~9,其中7 RUs和6 RUs为常见基因型。(本文来源于《安徽农业大学学报》期刊2017年05期）
欧洪,李娜,胡亮,王婷,何静[6]（2016）在《乌头霜霉病病原菌rDNA-ITS和28S rDNA D1/D2区序列分析》一文中研究指出目的明确四川江油地区栽培乌头霜霉病病原菌乌头霜霉Peronospora aconiti rDNA-ITS和28 S rDNA D1/D2区序列,为病害诊断和防治提供理论基础。方法从病株收集病原菌分生孢子及菌丝,提取DNA,扩增rDNA-ITS和28 S rDNA D1/D2片段序列,进行测序分析,并构建邻接(neighbor-joining,NJ)发育树分析病原菌种类。结果检测出的病原菌rDNA-ITS序列与NCBI数据库中霜霉属P.pulveracea、P.aparines相似度为94%,28 S rDNA D1/D2区序列与霜霉属P.pulveracea、P.ficariae、P.bulbocapni相似度达97%。结论分子rDNA-ITS和28 S rDNA D1/D2区序列鉴定的结论和形态学鉴定的结论一致,乌头霜霉病病原菌为霜霉科霜霉属乌头霜霉Peronospora aconiti Yu,其rDNA-ITS和28 S rDNA D1/D2区序列可用于该病原物的鉴定。(本文来源于《中草药》期刊2016年15期）
马学旻,袁芳,陈慧,马江涛[7]（2016）在《宁夏手足口病患者柯萨奇病毒A14型VP1区序列分析》一文中研究指出目的了解宁夏手足口病(HFMD)患者中柯萨奇病毒A14型(CVA14)分离株的基因特征。方法收集2013年实时荧光PCR法检测非EV71和非CVA16肠道病毒核酸阳性标本280份,用RD和Hep-2细胞进行肠道病毒分离培养,分离到的毒株采用RT-PCR法扩增其VP1区基因并进行核苷酸序列测定,测序结果利用BLAST进行型别鉴定。对鉴定为CVA14的毒株进行VP1区基因同源性分析和进化分析。结果从280份标本中共分离到肠道病毒36株,其中有2株鉴定为CVA14。2株CVA14宁夏分离株相互间核苷酸同源性为99.4%,氨基酸同源性为99.3%;与原型株G14的核苷酸同源性为82.3%~82.5%,氨基酸同源性为96.6%。系统进化显示,2株CVA14宁夏株与国内其他省份CVA14毒株处于同一分支。结论引起手足口病的病原除了优势病毒株EV71和CVA16外,同时还存在着CVA14等一些较少见、易忽略的肠道病毒共同循环的现象,因此应不断加强HFMD监测,以全面了解HFMD的流行趋势和抗原变异。(本文来源于《宁夏医学杂志》期刊2016年06期）
迟艳红,陈华增,杨翠华,孙玉苗,齐继光[8]（2016）在《桃花水母的核糖体RNA基因ITS区序列分析及物种鉴定》一文中研究指出利用PCR扩增和DNA测序技术,获得了青岛野外采集到的桃花水母(Craspedacusta)核糖体RNA基因ITS区序列。序列比对以及系统进化分析显示,在青岛采集到的桃花水母与索氏桃花水母(Craspedacusta sowerbyi)的ITS区序列相似度最高,同源性在93%以上;同时,在系统发育树中也与索氏桃花水母聚为一支。研究结果表明,青岛采集到的桃花水母为索氏桃花水母,这也是青岛地区桃花水母的新记录。(本文来源于《海洋科学》期刊2016年02期）
韩绪春,何锡栋,黄宝钦,罗忠宝,吴晓平[9]（2015）在《鸡传染性支气管炎病毒HQ P_(10)毒株非编码区序列分析》一文中研究指出研究旨在探讨鸡传染性支气管炎病毒(IBV)的遗传变异情况,为鸡传染性支气管炎的防控提供基础数据。通过对IBV HQ毒株第10代鸡胚培养病毒的5′端非编码区(5′UTR)和3′UTR序列进行c DNA末端快速扩增(RACE)和序列分析。结果表明:HQ P10的5′UTR长度为525 nt,相较于Beaudette毒株,序列中发生4个位点的碱基缺失突变,1个位点的碱基插入突变,导致其SL1-SL4茎环结构有所改变,与参考毒株的相应序列同源性在94%~99%之间;而3′UTR长度为363 nt,与参考毒株相应序列的同源性在45%~98%之间,与H120的同源性在93.3%,而与H52株、M41株的同源性则较低,分别为46.4%和45.9%。UTR对病毒RNA的合成具有重要作用,HQ P10毒株UTR中的突变对病毒复制效率的影响还有待进一步研究。(本文来源于《中国家禽》期刊2015年08期）
孙顺昌,陈群蓉,陈曦,彭运生[10]（2015）在《中国汉族人群UGT1A1基因非翻译区序列分析》一文中研究指出目的:对中国汉族人群尿苷二磷酸葡糖醛酸基转移酶1A1(uridine diphosphate glucuronosyltransferase 1A1,UGT1A1)基因的5'和3'-非翻译区序列进行分析,寻找非翻译区的多态性变异。方法:收集220例健康汉族个体的外周血,并抽提基因组DNA,通过聚合酶链反应扩增UGT1A1基因的5'和3'-非翻译区,通过测序确定DNA序列。结果:在中国汉族人群中UGT1A1基因的5'非翻译区存在2个多态性位点:-64(G/C)和TATAA盒区A(TA)6TAA/A(TA)7TAA;-64位G频率为98.4%,C频率为1.6%。TATAA盒中A(TA)6TAA频率为93.4%,A(TA)7TAA频率为6.6%。3'非翻译区也存在2个多态性位点:1813C/T和1941C/G,所有个体在1813和1941位点均呈纯合性,且1813C和1941C呈遗传共分离(单倍型频率为73.6%),1813T和1941G(单倍型频率为26.4%)呈遗传共分离。结论:中国汉族人群UG T1A1基因的3'-非翻译区1813和1941纯合多态性位点呈遗传共分离可能是基因组自然选择的结果,其机制有待进一步研究。(本文来源于《中国实验血液学杂志》期刊2015年02期）
区序列分析论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
从采后贮藏期间自然发病的华莱士瓜上分离到12株丝状真菌,将分离菌经纯化后回接到健康无损的华莱士瓜上,发病特征与分离发病果实一致,确定其为华莱士瓜的病原菌。结合形态学观察和rDNA内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列分析,结果表明:分离到1株黑附球菌(Epicoccum nigrum)、1株草酸青霉菌(Penicillium oxalicum)、2株链格孢属(Alternaria Nees ex Wallr.)真菌、3株曲霉属(Aspergillus Micheli ex Fr.)真菌和5株镰刀属(Fusarium LK. ex Fr.)真菌。其中,黑附球菌(E. nigrum)为甜瓜中首次发现的病原菌,而草酸青霉菌(P. oxalicum)、细极链格孢菌(Alternaria tenuissima)、泡盛曲霉菌(Aspergillus awamori)、木贼镰刀菌(Fusarium equiseti)、轮状镰刀菌(F. verticillioides)和燕麦镰刀菌(F. avenaceum)分别为甜瓜上分离到的青霉属、链格孢属、曲霉属和镰刀属的新菌株。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
区序列分析论文参考文献
[1].胡露露,赵子雅,王瑞宁,王亚琪,刘铮铸.赤狐EDNRB基因编码区序列分析及启动子预测[J].畜牧与兽医.2019
[2].王郅媛,姚婷,范雅为,张燕,王友升.华莱士瓜采后丝状真菌的分离及rDNAITS区序列分析[J].食品科学.2018
[3].陈红莲,王永杰,程云生,宋光同.安徽省克氏原螯虾白斑综合征病毒缺失区序列分析[J].水产科技情报.2018
[4].刘洋.猪ZBED6基因和Tβ4基因启动子核心区序列分析[D].东北农业大学.2018
[5].陈红莲,王永杰,蒋业林,程云生,张静.安徽省克氏原螯虾白斑综合征病毒变异区序列分析[J].安徽农业大学学报.2017
[6].欧洪,李娜,胡亮,王婷,何静.乌头霜霉病病原菌rDNA-ITS和28SrDNAD1/D2区序列分析[J].中草药.2016
[7].马学旻,袁芳,陈慧,马江涛.宁夏手足口病患者柯萨奇病毒A14型VP1区序列分析[J].宁夏医学杂志.2016
[8].迟艳红,陈华增,杨翠华,孙玉苗,齐继光.桃花水母的核糖体RNA基因ITS区序列分析及物种鉴定[J].海洋科学.2016
[9].韩绪春,何锡栋,黄宝钦,罗忠宝,吴晓平.鸡传染性支气管炎病毒HQP_(10)毒株非编码区序列分析[J].中国家禽.2015
[10].孙顺昌,陈群蓉,陈曦,彭运生.中国汉族人群UGT1A1基因非翻译区序列分析[J].中国实验血液学杂志.2015
论文知识图
