导读:本文包含了单碱基延伸法论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:碱基,基因,引物,基因芯片,偏振,多态性,致病菌。
单碱基延伸法论文文献综述
李裕碧,周永健,李瑜元,聂玉强,杜艳蕾[1]（2015）在《应用SNaPshot单碱基延伸反应方法检测多个目的基因多态性与非酒精性脂肪性肝病易感性的关系》一文中研究指出目的探讨9个目的基因多态性与不同程度非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)的关系。方法选取102例NAFLD患者及92名健康人群,采用SNa Pshot单碱基延伸反应测定所有研究对象9个目的基因的基因型,比较两组临床一般测量指标、生化检验指标及在基因型分布上的差异。采用B超将NAFLD患者分成轻、中、重度,并比较其基因型的差异。结果除TNFα基因位点外,其余位点在NAFLD组和对照组的分布均有差异,且PNPLA3基因rs738409位点G等位基因在重度NAFLD中频率较高。结论 PNPLA3基因rs738409位点G等位基因增加NAFLD易感性,并且与NAFLD严重程度相关。(本文来源于《胃肠病学和肝病学杂志》期刊2015年08期）
黄燕茹,梅利斌,彭莹,谭虎,李浩贤[2]（2014）在《利用多重单碱基引物延伸法检测耳聋基因热点突变》一文中研究指出听觉系统中外耳、中耳、内耳结构异常及听觉传导信号通路中的听神经和各级中枢发生病变,导致听功能障碍,表现出不同程度的听力下降,统称为耳聋。我国听力残疾人数众多,每年有3万左右聋儿出生,发病率为1/500~1/1000。60%的耳聋患者是遗传因素所导致的,遗传性聋中非综合征型耳聋占70%。迄今已经定位的非综合征型耳聋基因座约有(本文来源于《2014全球华人遗传学大会全国第十叁次医学遗传学学术会议论文汇编》期刊2014-10-29）
黄燕茹[3]（2014）在《利用多重单碱基引物延伸法检测耳聋基因热点突变》一文中研究指出背景：听觉系统中外耳、中耳、内耳结构异常及听觉传导信号通路中的听神经和各级中枢发生病变,导致听功能障碍,表现出不同程度的听力下降,统称为耳聋。我国听力残疾人数众多,每年有3万左右聋儿出生,发病率为1/500～1/1000。60%的耳聋患者是遗传因素所导致的,遗传性聋中非综合征型耳聋占70%,30%为综合征型耳聋。迄今已经定位的非综合征型耳聋基因座约有136个,已克隆基因88个。虽然耳聋具有较高的遗传异质性,但大部分非综合征型耳聋由少数几个基因热点突变引起,包括GJB2、GJB3、SLC26A4、线粒体基因(mtDNA12SrRNA)等,这使遗传性耳聋的基因诊断和筛查成为可能。传统的耳聋基因检测方法包括限制性片段长度多态性分析、限制性内切酶酶切指纹-单链构象多态性分析、变性高效液相色谱法、实时荧光定量Taqman MGB探针法、PCR结合Sanger测序、高分辨率熔解曲线法等。但是这些方法很难同时对不同基因上的多个突变位点进行检测。基因芯片技术虽然能同时对多基因、多位点进行检测,但是成本昂贵,对技术要求高。因此,建立一种能一次性检测多个热点突变、可靠、经济、快速的技术尤为重要。目的：采用多重单碱基引物延伸法对耳聋先证者进行GJB2、 GJB3、SLC26A4、12SrRNA基因12个热点突变位点的一次性检测,以期建立一种快速、可靠、经济的耳聋基因诊断方法。方法：采用多重单碱基引物延伸法对96名非综合征型耳聋先证者、66名家系成员及50名正常人,共212名,进行GJB2、GJB3、 SLC26A4、12SrRNA基因12个热点突变位点的一次性检测,并采用Sanger测序进行验证。结果：1、采用多重单碱基引物延伸法对96名非综合征型耳聋先证者、66名家系成员及50名正常人,共212名,进行GJB2、GJB3、 SLC26A4、12SrRNA基因12个热点突变位点的一次性检测,结果与Sanger测序结果一致,准确性为100%。2、采用多重单碱基引物延伸法对96名非综合征型耳聋先证者进行GJB2、GJB3、SLC26A4、12SrRNA基因12个热点突变位点的一次性检测,大大提高了检出率,检出率为41.67%,而前期单个基因／单个位点的一次性检出率只有31.25%。3、50名正常人中有1名携带GJB2c.235delC,正常人中携带率为2%,与国内研究显示的正常人群携带率在1%～6%之间相符。结论：建立了一种可以一次性检测非综合征型耳聋GJB2、GJB3、 SLC26A4、12SrRNA基因12个热点突变位点的快速、可靠、经济的基因诊断方法。(本文来源于《中南大学》期刊2014-06-01）
房师松,柴燕文,王昕,吕星,吴春利[4]（2014）在《双碱基延伸法结合荧光偏振法快速检测新甲型H1N1耐药位点方法的建立》一文中研究指出目的建立一种利用双碱基延伸法与荧光偏振技术(Fluorescence polarization,FP)快速检测甲型H1N1流感病毒NA基因耐药突变位点的新方法。方法从GenBank随机下载30条甲型H1N1的NA(neuraminidase)基因序列,通过MEGA分析,利用Primer Premier软件设计3条特异引物,其中一对引物通过RT-PCR用于扩增含有耐药位点H275Y的NA基因,第3条引物是应用双碱基延伸终止法与荧光偏振技术检测NA基因对达菲类药物耐药位点H275Y的突变情况,再随机选取50株甲型H1N1流感病毒进行检测,与测序结果进行比对,验证检测结果的准确性。结果 50株甲型H1N1流感病毒的NA蛋白第275位氨基酸均为组氨酸,未发生H Y的替换,在灵敏度与特异性方面,与传统的基因测序结果一致性均达100%。结论本方法操作简便、敏感性及特异性高、判读结果直观明确、检测费用低,能实现对耐药位点突变的快速、准确检测,可应用于与SNP相关疾病的快速分型和突变位点的实时监测和临床检测。(本文来源于《中国人兽共患病学报》期刊2014年02期）
王敬忠,刘涛,房师松,王昕,程小雯[5]（2013）在《B型流感亚系单碱基延伸终止荧光偏振快速检测的研究》一文中研究指出目的建立一种利用单碱基延伸终止结合荧光偏振技术(Fluorescence polarization,FP)快速检测B型流感By(B/Yamagata)和Bv(B/Victoria)亚系的新方法。方法从GenBank下载By和Bv血凝素(HA)基因各50条序列,通过MEGA软件进行分析,利用Primer Premier 5.0设计B型流感病毒亚系特异性引物和单标记延伸引物,建立单碱基延伸终止法与荧光偏振检测方法。结果 40株Bv和40株By病毒用单碱基延伸终止法与荧光偏振检测,与传统的基因测序结果一致性达100%。结论本方法操作简便、敏感性及特异性高、判读结果直观明确、检测费用低,适合于流感监测实验室对流感病毒的快速分子诊断。(本文来源于《中国热带医学》期刊2013年08期）
王敬忠,刘涛,王昕,房师松,程小雯[6]（2013）在《B型流感单碱基延伸终止荧光偏振法分型分析》一文中研究指出目的了解2010~2012年深圳市B型流感的流行状况,应用单碱基延伸终止荧光偏振法快速诊断,为制定预防控制措施提供依据。方法从GenBank随机下载By和Bv HA基因,通过MEGA分析,利用Primer Premier软件设计特异引物和通用探针,应用单碱基延伸终止法与荧光偏振技术对流感哨点监测医院随机采集流感样病例的咽拭子或咽漱液标本进行快速检测,用HA(IHemagglutination inhibition)实验确认的B型流感病毒亚系分离毒株进行特异性验证。结果 2010~2012年共采集并检测流感样病例咽拭子4 630份,快速诊断B型流感病毒阳性189例,与HAI分离并鉴定结果一致,总阳性率为4.08%;以2012年第7周阳性率最高,达51.61%;病毒阳性者平均年龄为(13±15)岁,其中小于10岁组的阳性率最高,达4.70%。结论 2010~2012年深圳市B型流感病毒的监测中,Victoria亚型为主要流行株。深圳B型流感病毒主要累及青少年和老年人群。应继续加强监测工作,并在流行季节及时采取预防控制措施以保护公众的身体健康。(本文来源于《中国热带医学》期刊2013年05期）
唱凯,陈伟,张泉,徐泽刚,靳晓军[7]（2010）在《基于“单碱基延伸和酶放大系统”的SNP漏声表面波生物传感器的实验研究》一文中研究指出目的探讨漏声表面波生物传感器检测单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)的方法。方法分别在漏声表面波生物传感器反应体系加入2条仅存在一个碱基不同(A/G)的靶序列,与固定的探针杂交。利用酶生物信号放大系统,结合单碱基延伸技术,观察其杂交信号的改变。结果靶位点为完全匹配的A时,相位下降(6.47°±0.42°);而靶位点为错配的G时,相位下降仅为(0.77°±0.25°),两者差异有统计学意义(P<0.01)。结论成功建立了漏声表面波生物传感器检测SNP的新方法。(本文来源于《第叁军医大学学报》期刊2010年03期）
陆长勇,施春雷,张春秀,陈婧,史贤明[8]（2009）在《基于单碱基延伸标签反应的常见食源性致病菌基因芯片检测方法的建立》一文中研究指出针对8种常见的食源性致病菌(金黄色葡萄球菌、副溶血弧菌、单核细胞增生李斯特菌、沙门氏菌、阪崎肠杆菌、志贺氏菌、肠出血性大肠杆菌O157:H7和空肠弯曲杆菌),建立了基于单碱基延伸标签反应原理的基因芯片检测方法。筛选和整合8种食源性致病菌基因组中的特异性序列和相应PCR引物,致病菌靶DNA片段被扩增和纯化作为单碱基延伸标签反应的模板,反应产物在DNA芯片上与探针进行杂交反应,然后通过扫描基片对荧光强度结果进行判断。实验结果表明,可采用基于单碱基延伸标签反应的基因芯片方法同时特异性检测8种食源性致病菌,基因组DNA多重检测灵敏度可达到0.1 pg。以鼠伤寒沙门氏菌为单一检测对象的细菌纯培养物灵敏度可达到5×10~2 cfu/mL。本方法可以快速灵敏地检测食源性致病菌,为食源性疾病的诊断和防治提供了一个有效的方法。(本文来源于《中国食品科学技术学会第六届年会暨第五届东西方食品业高层论坛论文摘要集》期刊2009-11-11）
赵云坡,张浩,杨晓楠,詹帅,黄勇平[9]（2009）在《采用单碱基延伸法检测家蚕单核苷酸多态性位点》一文中研究指出单核苷酸多态性(SNP)分型可以作为丰富的分子标记用于家蚕群体遗传学、基因组注释以及功能基因研究。利用SNaPshot试剂盒的SNP分型方法,对以单碱基延伸法检测家蚕SNP位点进行了探索。首先对SNP位点进行PCR扩增,然后以PCR产物为模板,以4种荧光标记ddNTPs为底物,采用延伸引物扩增SNP位点处的一个碱基,最后用377测序仪进行基因分型。通过对家蚕2个SNP位点的分析结果表明,利用单碱基延伸法可以准确地检测SNP位点,并且可以知道该位点的碱基。由于单碱基延伸法可以通过多重PCR在1个反应体系检测多至10个位点,因此该方法不仅方便快捷,并且可以实现高通量检测SNP位点。(本文来源于《蚕业科学》期刊2009年03期）
陆长勇,施春雷,张春秀,陈婧,史贤明[10]（2009）在《基于单碱基延伸标签反应的常见食源性致病菌基因芯片检测方法的建立》一文中研究指出针对8种常见的食源性致病菌(金黄色葡萄球菌、副溶血弧菌、单核细胞增生李斯特菌、沙门氏菌、阪崎肠杆菌、志贺氏菌、肠出血性大肠杆菌O157:H7和空肠弯曲杆菌),建立了基于单碱基延伸标签反应原理的基因芯片检测方法。筛选和整合8种食源性致病菌基因组中的特异性序列和相应PCR引物,致病菌靶DNA片段被扩增和纯化作为单碱基延伸标签反应的模板,反应产物在DNA芯片上与探针进行杂交反应,然后通过扫描基片的荧光强度进行判断。实验结果表明,可采用基于单碱基延伸标签反应的基因芯片方法同时特异性检测8种食源性致病菌,基因组DNA多重检测灵敏度可达到0.1pg,以鼠伤寒沙门氏菌为单一检测对象的细菌纯培养物灵敏度可达到5×102CFU/mL。本方法可以快速灵敏地检测食源性致病菌,为食源性疾病的诊断和防治提供了一个有效的方法。(本文来源于《生物工程学报》期刊2009年04期）
单碱基延伸法论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
听觉系统中外耳、中耳、内耳结构异常及听觉传导信号通路中的听神经和各级中枢发生病变,导致听功能障碍,表现出不同程度的听力下降,统称为耳聋。我国听力残疾人数众多,每年有3万左右聋儿出生,发病率为1/500~1/1000。60%的耳聋患者是遗传因素所导致的,遗传性聋中非综合征型耳聋占70%。迄今已经定位的非综合征型耳聋基因座约有
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
单碱基延伸法论文参考文献
[1].李裕碧,周永健,李瑜元,聂玉强,杜艳蕾.应用SNaPshot单碱基延伸反应方法检测多个目的基因多态性与非酒精性脂肪性肝病易感性的关系[J].胃肠病学和肝病学杂志.2015
[2].黄燕茹,梅利斌,彭莹,谭虎,李浩贤.利用多重单碱基引物延伸法检测耳聋基因热点突变[C].2014全球华人遗传学大会全国第十叁次医学遗传学学术会议论文汇编.2014
[3].黄燕茹.利用多重单碱基引物延伸法检测耳聋基因热点突变[D].中南大学.2014
[4].房师松,柴燕文,王昕,吕星,吴春利.双碱基延伸法结合荧光偏振法快速检测新甲型H1N1耐药位点方法的建立[J].中国人兽共患病学报.2014
[5].王敬忠,刘涛,房师松,王昕,程小雯.B型流感亚系单碱基延伸终止荧光偏振快速检测的研究[J].中国热带医学.2013
[6].王敬忠,刘涛,王昕,房师松,程小雯.B型流感单碱基延伸终止荧光偏振法分型分析[J].中国热带医学.2013
[7].唱凯,陈伟,张泉,徐泽刚,靳晓军.基于“单碱基延伸和酶放大系统”的SNP漏声表面波生物传感器的实验研究[J].第叁军医大学学报.2010
[8].陆长勇,施春雷,张春秀,陈婧,史贤明.基于单碱基延伸标签反应的常见食源性致病菌基因芯片检测方法的建立[C].中国食品科学技术学会第六届年会暨第五届东西方食品业高层论坛论文摘要集.2009
[9].赵云坡,张浩,杨晓楠,詹帅,黄勇平.采用单碱基延伸法检测家蚕单核苷酸多态性位点[J].蚕业科学.2009
[10].陆长勇,施春雷,张春秀,陈婧,史贤明.基于单碱基延伸标签反应的常见食源性致病菌基因芯片检测方法的建立[J].生物工程学报.2009
论文知识图
