2018年云南省思茅地区猪场蚊PCV2检测及ORF2基因遗传进化分析

论文摘要

目的了解云南省思茅地区猪场蚊携带猪圆环病毒2型（PCV2）情况及蚊源PCV2的遗传进化特征。方法采集云南省思茅地区3个猪场周围蚊标本94份并检测PCV2携带情况,PCR扩增ORF2基因,对得到的ORF2基因进行同源性、系统进化树分析和抗原位点比对分析。结果 PCR检测蚊PCV2阳性率为15.96%（15/94）,得到的14个ORF2序列之间的核苷酸同源性为89.5%～99.9%,对应氨基酸同源性为86.2%～99.6%;与NCBI GenBank收录的22个参考ORF2序列的核苷酸同源性为79.9%～99.9%,对应的氨基酸同源性为79.5%～99.6%。系统进化树分析PCV2a亚型1个,PCV2b亚型5个,PCV2d亚型8个。抗原位点比对分析显示,PCV2 Cap蛋白氨基酸变异位点主要位于50-70aa,131-140aa,200-220aa 3个区段。结论云南省猪场蚊PCV2携带率较高,主要毒株为PCV2b和PCV2d亚型,且以PCV2d亚型较多,与我国当前猪感染PCV病毒型群体内流行情况相符。

论文目录

• 材料与方法
•   1 材料
•     1.1 蚊虫
•     1.2 主要试剂
•   2 方法
•     2.1 DNA提取
•     2.2 PCV2检测
•     2.3 PCV2 ORF2基因扩增
•     2.4 PCR产物的回收与克隆
•     2.5 PCV2 ORF2的同源性分析及遗传进化和抗原位点比对分析
• 结 果
•   1 蚊携带PCV2检测
•   2 PCV2 ORF2基因的扩增和同源性分析
•   3 PCV2 ORF2 基因的遗传进化分析
•   4 ORF2抗原位点比对分析
• 讨 论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李金凤,哈卓,李成辉,赵冠宇,李卓昕,张涵,郭影成,鲁会军,张英,金宁一

关键词: 猪圆环病毒型,基因,同源性分析,遗传进化分析

来源: 中国病原生物学杂志 2019年07期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学,农业科技

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 吉林大学动物医学学院,军事科学院军事医学研究院军事兽医研究所,东北农业大学动物医学学院,延边大学农学院,吉林市丰满区动物疫病预防控制中心,吉林大学动物科学学院

基金: 国家重点研发计划项目(No.2016YFD0500401,2018YFD0500104)

分类号: S852.651

DOI: 10.13350/j.cjpb.190702

页码: 746-749+754

总页数: 5

文件大小: 3154K

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