赤红球菌环二鸟苷酸效应蛋白的筛选、验证和表达分析

赤红球菌环二鸟苷酸效应蛋白的筛选、验证和表达分析

论文摘要

c-di-GMP是一种细菌内普遍存在的第二信使,它与细菌许多重要生理过程密切相关,c-di-GMP发挥这些生理作用离不开其效应蛋白。本文通过affinity pull-down和LC/MS/MS的方法获得了赤红球菌SD3的一个c-di-GMP的效应蛋白,并进行了验证。此外用荧光定量PCR方法研究了在甲苯胁迫下赤红球菌SD3中该效应蛋白基因转录变化情况。生物信息学分析表明表明该c-di-GMP的效应蛋白为亲水性蛋白,位于细胞质中,与c-di-GMP的结合自由能为-12.71kcal/mol。通过Blast比对和保守结构域分析表明该效应蛋白为核糖体蛋白L22。荧光定量PCR结果表明在甲苯胁迫下,该效应蛋白的表达提高到原来的5.50倍。本研究首次在赤红球菌中确定了一个c-di-GMP效应蛋白,并揭示了该蛋白与赤红球菌SD3有机溶剂耐受性之间的关系。

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文章来源

类型: 国内会议

作者: 袁媛,张帆,胡琳,吴钟昊,彭仁

关键词: 效应蛋白,核糖体蛋白,荧光定量,生物信息学分析,赤红球菌

来源: 华东六省一市生物化学与分子生物学会联盟2019年学术与教学交流会 2019-07-12

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 江西师范大学生命科学学院

分类号: Q936

页码: 48

总页数: 1

文件大小: 46k

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