川西北牦牛源牛星状病毒的检测及ORF2基因序列分析

论文摘要

牛星状病毒（BoAstV）ORF2基因在感染与免疫过程中发挥重要作用,为了解BoAstV在川西北牦牛中的流行及ORF2基因的分子特征,采集2016年-2017年川西北135份牦牛腹泻粪便样本,采用RT-PCR方法对临床样本进行检测,并对阳性样本进行完整ORF2基因的克隆。结果显示,从135份样本中检出7份BoAstV阳性,检出率为5.2%;获得的2条完整ORF2基因长度皆为2 313 bp,与GenBank中仅有的1条牦牛源BoAstV S8株的ORF2完整基因的氨基酸同源性分别为89.4%和86.1%,与BoAstV ORF2氨基酸同源性为28.5%～52.2%;这2条序列在进化树上与牦牛源BoAstV S8株单独聚于一支,与BoAstV有明显的遗传距离。研究结果丰富了牦牛源BoAstV ORF2基因信息,为研究牦牛源BoAstV的诊断和防控提供参考。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料
•     1.1.1 腹泻样本及阳性核酸
•     1.1.2 主要试剂与仪器
•   1.2 方法
•     1.2.1 总RNA的提取及cDNA的合成
•     1.2.2 RT-PCR检测牦牛源BoAstV
•     1.2.3 完整ORF2基因的克隆
•       1.2.3.1 引物的设计与合成
•       1.2.3.2 ORF2基因的分段PCR扩增
•       1.2.3.3 ORF2基因的拼接
•     1.2.4 序列及进化分析
• 2 结果
•   2.1 腹泻粪便样本中牦牛源BoAstV检测结果
•   2.2 牦牛源BoAstV ORF2片段的序列及遗传进化分析
•   2.3 牦牛源BoAstV ORF2基因的克隆
•   2.4 牦牛源BoAstV ORF2基因的遗传进化分析及氨基酸序列分析
•     2.4.1 牦牛源BoAstV ORF2的遗传进化分析
•     2.4.2 牦牛源BoAstV ORF2的氨基酸变异分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 田欣睿,汤承,岳华

关键词: 牦牛,星状病毒,基因,遗传变异

来源: 动物医学进展 2019年10期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 西南民族大学生命科学与技术学院,国家民委青藏高原动物疫病防控创新团队

基金: 四川省应用基础研究项目(2017JY0066),国家民委创新团队项目(13TD0057),四川省大学生创新创业项目(S201710656023)

分类号: S852.653

DOI: 10.16437/j.cnki.1007-5038.2019.10.007

页码: 32-38

总页数: 7

文件大小: 4258K

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