1个含有SDR结构域PKS/NRPS基因的克隆

论文摘要

聚酮和非核糖体多肽的复合化合物具有独特的生理活性,它们由聚酮合酶/非核糖体肽合成酶（PKS/NRPS）催化合成。目前球孢白僵菌Beauveria bassiana中含SDR结构域的PKS/NRPS酶的生物合成机制尚不清楚,采用基因挖掘技术从球孢白僵菌基因组中分离得到1个PKS/NRPS基因（命名Bbpks2）,利用生物信息学分析对其功能进行预测并检测该基因在以6.0 g·L-1麦芽提取物和3.0 g·L-1酵母提取物为基本氮源培养基,7种碳源添加物和以1.8 g·L-1麦芽糖和6.0 g·L-1葡萄糖为基本碳源培养基,4种氮源添加物培养基上的具体表达情况,其中每种添加物含量为4.0 g·L-1。结果显示:Bbpks2基因长度为12 051 bp,编码4 016个氨基酸;其结构域组织顺序为KS-AT-DH-MTKR-ACP-C-A-PP-SDR,是一种含有SDR结构域的PKS/NRPS;系统进化分析发现,BbPKS2与球孢白僵菌JEF007菌株（PMB64475.1）、头状虫草Tolypocladium capitatum（PNY25600.1）等的PKS/NRPS蛋白聚在同个分支中,可能参与一种聚酮/非核糖体多肽类化合物的生物合成;比较不同氮源、碳源添加物对Bbpks2基因表达的影响,发现该基因在添加了乳糖的培养基上的表达量是其他碳源添加物的3.4倍以上,添加了牛肉浸粉的培养基上表达量是其他氮源添加物的1.3倍以上。该研究为下一步通过异源表达鉴定Bbpks2基因的具体功能,及其调控机理研究和基因资源利用奠定基础。图3参30

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 菌株和培养条件
•   1.2 试剂与器材
•   1.3 Bbpks2基因的挖掘及克隆
•   1.4 聚类分析方法
•   1.5 Bbpks2基因在不同培养基上的表达
• 2 结果与分析
•   2.1 Bbpks2基因全长cDNA的克隆及其序列分析
•   2.2 BbPKS2蛋白的分子系统进化分析
•   2.3 Bbpks2基因在含有不同碳氮源添加物培养基上的表达
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 原晓龙,李娟,李云琴,王毅

关键词: 森林保护学,球孢白僵菌,杂合,生物信息学分析

来源: 浙江农林大学学报 2019年06期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室,云南大学中草药生物资源研究所云百草实验室

基金: 国家自然科学基金资助项目（31860177）,云南省应用基础研究计划面上项目（2016FB055）,云南省林业科学院创新基金项目（QN2018-01）

分类号: Q78

页码: 1247-1253

总页数: 7

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