龙眼Dlf3h基因的克隆、表达及其生物信息学分析

论文摘要

本研究应用聚合酶链式反应（PCR）技术对龙眼黄烷酮-3-羟化酶基因（Dlf3h）进行克隆;运用实时荧光定量PCR （Quantitative real time PCR）技术对Dlf3h基因在龙眼根、茎、叶组织中的表达进行分析;采用生物信息学方法对Dlf3h蛋白理化性质、信号肽、亚细胞定位、亲疏水性、二级结构、三级结构等进行预测。结果表明:成功克隆获得一条长度为1 098 bp的Dlf3h基因,由366个氨基酸组成;该基因在根中表达量最高,其次为叶,在茎中表达量最低;生物信息学分析表明Dlf3h没有信号肽和跨膜结构,是一种可溶性亲水蛋白,定位于细胞核内;二级结构元件主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,具有卷曲螺旋;Ramachandran评估表明应用SWISS-MODEL构建的三级结构模型可靠,其配体结合位点为217 His和275 His。本研究结果为进一步研究龙眼类黄酮合成的分子调控机制提供依据。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 Dlf3h基因的克隆
•   1.2 Dlf3h基因的组织表达分析
•   1.3 Dlf3h蛋白保守结构域分析及系统进化树构建
•   1.4 Dlf3h一级结构和理化性质分析
•   1.5 Dlf3h蛋白的信号肽、跨膜结构域、亚细胞定位及亲疏水性预测
•   1.6 Dlf3h蛋白的二级结构及模体预测分析
•   1.7 Dlf3h蛋白的卷曲螺旋域分析
•   1.8 Dlf3h蛋白三级结构建模及结合位点预测
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 试验材料
•   3.2 龙眼总RNA的提取与cDNA第一条链的合成
•   3.3 Dlf3h基因的克隆
•   3.4 Dlf3h组织特异性表达分析
•   3.5 Dlf3h生物信息学分析
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 郑威,董学明,张秋颖,于雪飞,陈宁,季宇彬,李文兰

关键词: 龙眼,生物信息学分析,基因克隆,表达分析

来源: 分子植物育种 2019年15期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,园艺

单位: 哈尔滨商业大学生命科学与环境科学研究中心,哈尔滨商业大学药学院

基金: 黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划(UNPYSCT-2017210),哈尔滨商业大学青年科研项目(17XN007),哈尔滨商业大学博士启动基金(2014LG06,2016BS24),哈尔滨商业大学研究生创新项目(YJSCX2018-545HSD),黑龙江省自然基金(H2017001),哈尔滨市应用技术研究与开发项目(2016RQQXJ127)共同资助

分类号: S667.2;Q943.2

DOI: 10.13271/j.mpb.017.004944

页码: 4944-4953

总页数: 10

文件大小: 4231K

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