生物筛选论文_王成,龚莉虹,郭朝成,何林峰,赵兴桃

导读:本文包含了生物筛选论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:生物,信息学,基因,腺癌,甘草,标志物,活性。

生物筛选论文文献综述

王成,龚莉虹,郭朝成,何林峰,赵兴桃[1](2019)在《模式生物斑马鱼在中药药效物质筛选中的应用进展》一文中研究指出与哺乳动物相比,斑马鱼在药物药效筛选方面具有独特的优势,目前已受到医药学界越来越多的重视。近年来,对斑马鱼的探索已延伸和扩展到中药领域,特别是对我国具有多靶点、多途径、多环节作用的传统单味中药、复方和中成药等药效物质的筛选。作为一种完整的动物模型,斑马鱼可以对中药中发挥作用的有效化学成分进行全方面、深层次的研究,进而实现对中药药效物质进行便捷、快速和高通量的筛选。结合国内外近5年文献报道,综述了模式生物斑马鱼在中药药效物质筛选方面的最新研究进展,主要从筛选心血管药物、调脂保肝药物、抗骨质疏松药物、抗肿瘤药物、抗炎药物和其他药物6个方面和独特优势进行归纳总结,以期为模式生物斑马鱼在中药中的应用研究提供新的思路,以及为研究人员在中药新药研究方面提供借鉴参考。(本文来源于《中草药》期刊2019年24期)

余东虎,黄静宇,沈小艳,汪育锦,李胜[2](2019)在《生物信息学分析筛选肺腺癌关键基因及通路》一文中研究指出目的利用生物信息学分析方法对基因芯片数据进行分析,筛选出肺腺癌相关靶基因并进行验证。方法从美国国立生物技术信息中心创建并维护的基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中下载编号为GSE10072的基因芯片,得到49例正常肺组织样本和58例肺腺癌组织样本,应用R软件读取原始数据并进行预处理,分析差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),接着对这些DEGs进行聚类分析和功能富集分析,构建蛋白质互作网络,进一步从网络中筛选出核心基因,最后从转录水平和预后来验证分析结果。结果肺腺癌组织和正常肺组织DEGs共888个,其中上调基因有317个,下调基因有571个。根据功能富集分析,细胞粘附、药物反应以及细胞外基质的组成是其较突出的生物学功能,细胞外基质受体相互作用通路以及补体和凝血级联反应通路是其突出的信号通路。得到8个核心基因进一步验证发现,GAPDH,TOP2A,BIRC5和CCNB1 4个基因的表达量与肺腺癌患者的预后相关。结论筛选出的核心基因可能在肺腺癌发展中具有重要作用,并有可能成为肺腺癌的治疗靶点和诊断靶标。(本文来源于《转化医学杂志》期刊2019年06期)

姜硕,许哲祥,王宇晴,郑春英[3](2019)在《基于甘草苷生物合成的甘草内生细菌的筛选及鉴定》一文中研究指出目的:基于甘草苷的生物合成,筛选甘草苷产生菌。方法:采用平板分离法从甘草叶中分离内生细菌;采用滤纸片法筛选内生细菌的抑菌活性;以甘草苷为对照,采用高效液相色谱(high performance liquid chromatography,HPLC)法对内生细菌发酵液进行分析,同时采用硅胶柱色谱分离法从目的菌株中分离得到甘草苷;结合形态特征观察及16S rDNA序列同源性分析对目的菌株进行鉴定。结果:从甘草叶中分离得到32株内生细菌,其中有28株内生细菌具有抑菌活性,并在内生细菌GYX9发酵液中分离得到甘草苷,经鉴定GYX9为嗜根寡养单孢菌(Stenotrophomonas rhizophila)。结论:甘草叶内生细菌GYX9可以产生甘草苷,为微生物发酵法生产甘草苷提供理论依据。(本文来源于《中国新药杂志》期刊2019年23期)

吴谦,王平[4](2019)在《肺癌呼吸标志物筛选及其生物信息学分析》一文中研究指出采用结合转录组、代谢通路、蛋白结构的呼出气体检测生物信息学分析方法来确定肺癌气体标志物,用于肺癌的筛选诊断.采用标准仪器(GCMS)检测肺癌病人和正常人的呼吸气体样本;经统计分析,筛选出10种特异性挥发性有机物(VOC).采用转录组分析得到肺癌和健康人的差异表达基因,其富集的代谢通路与人体内产生VOC的代谢通路一致,证明所筛选的VOC标志物与肺癌病人代谢具有相关性.基于此VOC建立的肺癌诊断模型的灵敏度、特异性和整体正确率分别为86.2%,91.2%和89.6%,说明所提方法能简便、有效区分正常人和肺癌病人,为早期肺癌筛查提供方便、可靠的检测方法.(本文来源于《浙江大学学报(工学版)》期刊2019年12期)

尤红俊,赵倩倩,韩稳琦,常凤军,寿锡凌[5](2019)在《基于基因表达综合数据库芯片的慢性心力衰竭生物标志物的筛选与生物信息学分析》一文中研究指出目的:对慢性心力衰竭(CHF)患者基因芯片数据进行生物信息学分析,寻找表达特征基因谱。方法:利用基因表达综合数据库(GEO)中基因芯片数据筛选出CHF信息的芯片。分别采用GO富集分析和KEGG富集分析对差异基因进行功能注释和通路分析。结果:CHF患者外周血样品中9个基因存在差异表达,其中4个(CX3CR1、HSPA1L、DYNLL1、MYC)表达上调,5个(JUN、ZNF331、RORA、TRIM13、PPP1R16B)表达下调。这些差异表达的基因被富集到不同的生物学过程或分子功能的子集中,主要集中在14个方面,在分子功能—蛋白质结合方面富集最显着(GO:0005515),同时主要富集在Inflammatory bowel disease (IBD)、MAPK signaling pathway、Erb B signaling pathway和Colorectal cancer四条通路上。结论:通过对GEO数据库中CHF的表达数据分析研究而筛选出的差异表达基因,可能为该疾病的早期诊断治疗和靶向药物的开发提供重要理论依据。(本文来源于《心肺血管病杂志》期刊2019年11期)

黄琪峰,郑琳琳,张菁[6](2019)在《生物信息学分析筛选肺腺癌靶基因及评估预后的价值》一文中研究指出目的基于生物信息学分析筛选肺腺癌靶基因及评估预后价值。方法对叁个数据集(GSE118370、GSE32863、TCGA-LUAD)分别使用limma和edgeR包筛选出肺腺癌差异表达基因,对共同差异基因进行功能富集分析,通过String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,采用Cytoscape进行可视化分析并用其插件cytoHubba来筛选关键基因,采用Kaplan-Meier曲线进行总体生存分析。结果共224个共同差异基因,其中上调基因34个,下调基因190个。共同差异基因在血管生成、白细胞调节、免疫反应等生物学过程富集。通过从PPI网络中筛选出8个关键基因,分别为IL6、VWF、PECAM1、SPP1、CDH5、CXCL12、TIMP1、CLDN5。生存分析显示,PECAM1与LUAD的预后有关。肿瘤组织中PECAM1表达高于正常组织,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 PECAM1是一种与肺腺癌预后相关的新的生物标志物,有望成为肺腺癌的一个治疗的靶点。(本文来源于《医学信息》期刊2019年22期)

刘焜,张公亮,毕景然,桑雪,侯红漫[7](2019)在《盘锦蜢虾酱中产生物胺细菌的初步筛选》一文中研究指出蜢虾酱作为一种高盐分的发酵制品是一种常见的调味品,但是在微生物发酵过程中受细菌作用,蜢虾中蛋白质降解为氨基酸后,发生脱羧反应,产生不同种的生物胺,过量会影响蜢虾酱的食用安全性,因此,明确蜢虾酱中产生物胺细菌的多样性对蜢虾酱安全性及品质具有重要意义。研究对从中国盘锦蜢虾酱中分离出的44个菌株进行的脱羧实验,接菌后的脱羧酶液体培养基在37℃下培养24h后观察颜色反应。44种菌株中有25个菌株产生生物胺,芽孢杆菌属中产生腐胺6种(50%),尸胺9种(75%),酪胺8种(66%),色胺8种(66%),精胺11种(92%),组胺7种(58%),苯乙胺8种(66%),其中哈夫尼菌株中产生腐胺4种(80%),尸胺5种(100%),酪胺,色胺,精胺,组胺2种(40%)苯乙胺1种(20%)。其中考克氏菌属与纤维菌属全部产生腐胺、尸胺、色胺、精胺、组胺、苯乙胺。此结果可为虾酱的食品安全性具有重要的指导意义。(本文来源于《中国食品科学技术学会第十六届年会暨第十届中美食品业高层论坛论文摘要集》期刊2019-11-13)

庄晶玲,于洋,靳艳[8](2019)在《利用LC-MS/MS筛选发酵法制备的枸杞生物活性肽》一文中研究指出生物活性肽具有降血压、降血糖、抗氧化、抗菌及免疫调节等活性。动植物蛋白质经过酶解或微生物发酵可制备生物活性肽。枸杞是我国传统的药食同源药材,具有滋补肝肾、益精明目的功效。本研究的目的是利用基于LC-MS/MS的生物活性肽快速筛选方法,筛选枸杞蛋白发酵物中的生物活性肽。该研究使用枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)发酵法发酵枸杞蛋白,建立利用LC-MS/MS及构效关系、生物信息学计算结合的生物活性肽筛选方法,对枸杞发酵物中的生物活性肽进行鉴定和筛选。在枸杞发酵物中共鉴定到来源于14个蛋白的75条肽段,其中有5条具有ACE或DPP-Ⅳ抑制活性。NSLSLPNFHP和SLSLPNFHP具有较强的ACE抑制活性,IC_(50)分别为0.017±0.002 mM和0.027±0.012 mM;LLEPIGVVGH具有较高的DPP-Ⅳ抑制活性,IC_(50)值为0.210±0.008 mM。结果表明,枯草芽孢杆菌发酵法可制备降压肽和降糖肽,该技术可提高枸杞的综合利用价值。建立了一种基于LC-MS/MS结合构效关系及生物信息学计算的生物活性肽筛选方法,该方法高效、准确,对于复杂样品中生物活性肽的筛选具有重要意义。(本文来源于《中国食品科学技术学会第十六届年会暨第十届中美食品业高层论坛论文摘要集》期刊2019-11-13)

李墨翰,杨梅,曹雪妍,康世墨,李玮轩[9](2019)在《基于脂质组学技术对不同泌乳期牛乳脂质的对比研究及其生物标志物的筛选》一文中研究指出牛乳中含有数千种脂质,是自然界脂质组成最复杂的物质之一。牛乳脂质对于改善人类健康和提高食品成分的理化性质具有重要功能。然而,不同泌乳期间牛乳脂质的变化情况仍有待研究。本研究收集沈阳市辉山牧场牛初乳、牛常乳样本各20份,采用基于超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱的脂质组学技术对牛初乳及牛常乳中的13个亚类335种脂质进行了定量表征。以P <0.0001、VIP> 1.2、FC±> 2、AUC> 0.9为标准在其中筛选出63种差异脂质,进而筛选出6种潜在脂质生物标志物并在独立的测试集进行了验证及评估,分别是PE (P-16:0/22:5)、PE (P-16::0/20:4)、TG (18:0/22:0/22:4)、PE (18:2/0:0)、Hex2Cer (d14:0/24:0)、Hex2Cer (d15:0/24:0)。牛初乳牛常乳间的差异脂质变化情况为解释泌乳期间牛乳营养成分变化提供了重要依据,筛选出的6种潜在生物标志物可以作为牛乳质量评估及掺假鉴定的标准,并为牛乳中单个脂质分子的功能性研究提供了前瞻性思路。(本文来源于《中国食品科学技术学会第十六届年会暨第十届中美食品业高层论坛论文摘要集》期刊2019-11-13)

刘敏,曾双双,魏洁,颜元良,龚志成[10](2019)在《左旋多巴诱导异动症潜在血液生物标志物的筛选》一文中研究指出目的分析帕金森患者左旋多巴诱导异动症的相关因素,筛选可能的潜在血液生物标志物。方法基于某叁级甲等医院电子病历系统,收集帕金森病住院患者基本情况及检查结果,利用SPSS 23. 0统计学软件分析各项指标和变量与异动症发生的相关性。结果入选帕金森患者313例,其中异动症64例,发生率为20. 45%;发病年龄45岁以下,左旋多巴治疗时间不少于4年,较高的每日左旋多巴等效剂量及较低水平的直接胆红素、肌酐、淋巴细胞计数与较高的发生率明显相关(P <0. 05)。结论每日左旋多巴等效剂量、左旋多巴治疗时间、发病年龄是异动症的重要预测因素,血液中的直接胆红素、肌酐及淋巴细胞计数水平是异动症的潜在生物标志物。(本文来源于《中国药业》期刊2019年21期)

生物筛选论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的利用生物信息学分析方法对基因芯片数据进行分析,筛选出肺腺癌相关靶基因并进行验证。方法从美国国立生物技术信息中心创建并维护的基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中下载编号为GSE10072的基因芯片,得到49例正常肺组织样本和58例肺腺癌组织样本,应用R软件读取原始数据并进行预处理,分析差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),接着对这些DEGs进行聚类分析和功能富集分析,构建蛋白质互作网络,进一步从网络中筛选出核心基因,最后从转录水平和预后来验证分析结果。结果肺腺癌组织和正常肺组织DEGs共888个,其中上调基因有317个,下调基因有571个。根据功能富集分析,细胞粘附、药物反应以及细胞外基质的组成是其较突出的生物学功能,细胞外基质受体相互作用通路以及补体和凝血级联反应通路是其突出的信号通路。得到8个核心基因进一步验证发现,GAPDH,TOP2A,BIRC5和CCNB1 4个基因的表达量与肺腺癌患者的预后相关。结论筛选出的核心基因可能在肺腺癌发展中具有重要作用,并有可能成为肺腺癌的治疗靶点和诊断靶标。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

生物筛选论文参考文献

[1].王成,龚莉虹,郭朝成,何林峰,赵兴桃.模式生物斑马鱼在中药药效物质筛选中的应用进展[J].中草药.2019

[2].余东虎,黄静宇,沈小艳,汪育锦,李胜.生物信息学分析筛选肺腺癌关键基因及通路[J].转化医学杂志.2019

[3].姜硕,许哲祥,王宇晴,郑春英.基于甘草苷生物合成的甘草内生细菌的筛选及鉴定[J].中国新药杂志.2019

[4].吴谦,王平.肺癌呼吸标志物筛选及其生物信息学分析[J].浙江大学学报(工学版).2019

[5].尤红俊,赵倩倩,韩稳琦,常凤军,寿锡凌.基于基因表达综合数据库芯片的慢性心力衰竭生物标志物的筛选与生物信息学分析[J].心肺血管病杂志.2019

[6].黄琪峰,郑琳琳,张菁.生物信息学分析筛选肺腺癌靶基因及评估预后的价值[J].医学信息.2019

[7].刘焜,张公亮,毕景然,桑雪,侯红漫.盘锦蜢虾酱中产生物胺细菌的初步筛选[C].中国食品科学技术学会第十六届年会暨第十届中美食品业高层论坛论文摘要集.2019

[8].庄晶玲,于洋,靳艳.利用LC-MS/MS筛选发酵法制备的枸杞生物活性肽[C].中国食品科学技术学会第十六届年会暨第十届中美食品业高层论坛论文摘要集.2019

[9].李墨翰,杨梅,曹雪妍,康世墨,李玮轩.基于脂质组学技术对不同泌乳期牛乳脂质的对比研究及其生物标志物的筛选[C].中国食品科学技术学会第十六届年会暨第十届中美食品业高层论坛论文摘要集.2019

[10].刘敏,曾双双,魏洁,颜元良,龚志成.左旋多巴诱导异动症潜在血液生物标志物的筛选[J].中国药业.2019

论文知识图

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