植物三萜皂苷代谢中糖基转移酶蛋白特性的生物信息学分析

植物三萜皂苷代谢中糖基转移酶蛋白特性的生物信息学分析

论文摘要

本文根据文献及NCBI中已收录的植物糖基转移酶(GT, Glucosyltransferase)序列,选取了红景天(Rhodiola sachalinensis)等16种植物的糖基转移酶序列,利用生物信息学软件分别对其组成及理化性质、信号肽和二级结构等进行预测和分析。结果表明,这16种植物糖基转移酶核苷酸序列长度均在1 000 bp到2 000 bp之间,含量最丰富的氨基酸为Leu、Gly、Val、Ser和Ala等,其中,桉树、北柴胡、滇牡丹、蒺藜苜蓿、毛白杨、七彩虹叶、蔷薇和红景天糖基转移酶属于稳定类蛋白,其余为不稳定类蛋白;16种植物中,只有红景天糖基转移酶序列有信号肽;糖基转移酶蛋白二级结构均由α-螺旋、无规则卷曲、延伸链和β-转角组成,且α-螺旋和无规则卷曲为主要结构。综合三种不同分析工具对16种植物中糖基转移酶的研究表明,糖基转移酶蛋白特性差别不大,显示糖基转移酶具有较高的保守性和稳定性。本文对糖基转移酶的生物信息学分析,可为研究糖基转移酶酶学特征及三萜皂苷代谢提供帮助。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 方法
  • 2 结果与分析
  •   2.1 糖基转移酶氨基酸序列组成和理化性质分析
  •   2.2 糖基转移酶蛋白质信号肽的预测分析
  •   2.3 糖基转移酶二级结构预测分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 赵志新,王通

    关键词: 糖基转移酶,蛋白特性,生物信息学

    来源: 陕西农业科学 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 商洛学院生物医药与食品工程学院

    基金: 国家级大学生创新创业训练计划项目(201811396018X)

    分类号: Q946

    页码: 49-53

    总页数: 5

    文件大小: 541K

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