发菜β-酮脂酰ACP合成酶Ⅱ(FabF)的基因克隆表达与生物信息学分析

发菜β-酮脂酰ACP合成酶Ⅱ(FabF)的基因克隆表达与生物信息学分析

论文摘要

FabF基因编码的β-酮脂酰ACP合成酶Ⅱ是脂肪酸合成循环反应中的关键酶之一。为了解发菜Fab F分子信息,本研究通过设计特异性引物克隆发菜Fab F基因,对Fab F的核苷酸序列及推译的氨基酸序列进行生物信息学分析并进行原核表达。结果表明:①发菜Fab F全长为1 251 bp(Gen Bank的登录号为KX421859),氨基酸序列中包含Thr磷酸化位点11个、Tyr磷酸化位点7个、Ser磷酸化位点15个;第72位的赖氨酸(Lys)亲水性最强,第358位的缬氨酸(Val)疏水性最强。②二级结构和三级结构预测结果表明Fab F蛋白主要是由随机卷曲、α螺旋、β折叠和β转角构成。③将Fab F基因在大肠杆菌中表达,得到一个43.9 k D的外源蛋白,对此蛋白进行MALDI-TOF/TOF-MS鉴定,证明该蛋白为Fab F蛋白。研究结果为进一步探索发菜Fab F基因的功能及其在逆境条件下的表达调控和脂肪酸合成途径奠定了基础。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 试验材料
  •   1.2 试验方法
  •     1.2.1 发菜Fab F基因的克隆
  •     1.2.2 发菜Fab F基因的生物信息学分析
  •     1.2.3 发菜Fab F基因的原核表达
  •     1.2.4 表达产物的质谱分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 发菜Fab F基因的克隆
  •   2.2 生物信息学分析
  •     2.2.1 基因序列确定
  •     2.2.2 氨基酸序列分析
  •     2.2.3 发菜Fab F蛋白的疏水性分析
  •     2.2.4 发菜Fab F蛋白磷酸化位点分析
  •     2.2.5 发菜Fab F蛋白的跨膜区分析
  •     2.2.6 发菜Fab F蛋白的二级结构预测
  •     2.2.7 发菜Fab F蛋白的三级结构预测
  •   2.3 发菜Fab F基因的原核表达
  •   2.4 表达产物的质谱分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 严奉坤

    关键词: 发菜,酮脂酰合成酶,基因克隆,原核表达

    来源: 宁夏农林科技 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 宁夏工商职业技术学院

    基金: 宁夏高等学校科学研究项目(NGY2016262)

    分类号: Q943.2

    页码: 68-71+80+4+95

    总页数: 7

    文件大小: 8333K

    下载量: 23

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