西藏地区红景天属植物ITS,rbcL,trnS-G序列多态性分析

西藏地区红景天属植物ITS,rbcL,trnS-G序列多态性分析

论文摘要

以西藏红景天为研究材料,利用DNA条形码(核糖体内转录间隔区ITS以及两对叶绿体DNA序列rbcL和trnS-G),对所收集的44个样品进行克隆与测序,并结合NCBI中已报道的22种红景天ITS,rbcL,trnS-G序列进行分析.利用Mega5.0软件基于DNA条形码序列分析上述样本的遗传距离结果显示,ITS和trnS-G序列在红景天属植物种间的差异明显,rbcL序列的差异较小.所构建的N-J进化树结果显示ITS对红景天物种的识别能力优于rbcL和trnS-G,但任何单一的DNA条形码均无法成功辨识全部的红景天属植物.其中ITS序列可以清晰的分辨出大花红景天与圣地红景天,并且不同地理居群间的样本差异较小,rbcL+trnS-G组合DNA条形码可以清晰分辨出长鞭红景天.本研究对西藏红景天属植物进行了遗传多样性分析,为其开发与利用提供指导.

论文目录

  • 0 引言
  • 1 材料和方法
  •   1.1 植物材料
  •   1.2 DNA提取,扩增与测序
  •   1.3 数据处理
  • 2 结果
  •   2.1 ITS,rbcL,trnS-G序列扩增,拼接与变异分析
  •   2.2 基于ITS,rbcL,trnS-G的红景天遗传距离分析
  •   2.3 N-J系统进化树的构建与分析
  •   2.4 DNA条形码保守突变位点分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 张力鹏,滕彦娇,宋文芹,陈成彬

    关键词: 红景天,多态性

    来源: 南开大学学报(自然科学版) 2019年05期

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 南开大学生命科学学院

    分类号: Q943.2

    页码: 93-101

    总页数: 9

    文件大小: 1005K

    下载量: 138

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