蓖麻RcSEC14p基因的克隆及低温胁迫下的表达分析

论文摘要

Sec14-like蛋白参与细胞的基本生物学过程,如磷脂代谢、膜运输、信号转导及逆境响应。本研究采用RT-PCR的方法在蓖麻叶片中成功克隆了一个磷脂酰肌醇转运蛋白基因RcSEC14p （Accession No.MK205181）。RcSEC14p基因全长包含一个1 752 bp的完整开放阅读框,推测编码583个氨基酸。生物信息分析发现RcSEC14p为不稳定的亲水性蛋白;蛋白质二级结构元件多为α螺旋和无规卷曲。三级结构分析表明RcSEC14p结构内部含有一个潜在的磷脂结合口袋,可能在脂质代谢和磷酸肌醇信号转导等方面发挥重要的作用。多重序列比对表明蓖麻RcSEC14p与麻风树同源蛋白的相似性高达77.03%。系统进化树分析表明RcSEC14p属于Sec-like蛋白家族的SFH亚家族成员,N端包含一个SEC结构域,C端包含一个Nodulin结构域。q RT-PCR分析发现RcSEC14p受冷胁迫下调表达。该基因的下调表达可能会降低蓖麻的抗冷性。该研究为进一步探讨RcSEC14p是否通过调节磷脂信号转导途径参与冷胁迫响应提供依据。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 RcSEC14p基因的克隆
•   1.2 序列特征分析
•   1.3 多序列比对和进化树分析
•   1.4 RcSEC14p基因表达特性分析
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 实验材料与处理方法
•   3.2 总RNA的提取
•   3.3 RcSec14p基因的克隆
•   3.4 qRT-PCR分析
•   3.5 生物信息学分析
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 王晓宇,李敏,刘栩铭,卜祥琪,丁雪,张继星

关键词: 蓖麻,低温胁迫,表达分析

来源: 分子植物育种 2019年13期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,农作物

单位: 内蒙古民族大学生命科学学院,内蒙古民族大学科尔沁植物逆境生物学研究所,内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心,内蒙古民族大学农学院

基金: 国家自然科学基金(31701467,31760399),内蒙古民族大学博士科研启动资金(BS398),内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室开放基金(MDK2017037)共同资助

分类号: S565.6;Q943.2

DOI: 10.13271/j.mpb.017.004204

页码: 4204-4209

总页数: 6

文件大小: 1817K

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