一种基于全覆盖的动态蛋白质相互作用网络构建方法

一种基于全覆盖的动态蛋白质相互作用网络构建方法

论文摘要

关键蛋白质是生物体存活和繁育后代所必需的蛋白质.现有方法主要通过在静态网络中引入时间等信息构建动态网络以提高关键蛋白质识别率.在从静态网络向动态网络构建的过程中,上述方法存在部分关键蛋白质缺失、相互作用信息冗余等缺点,影响关键蛋白质识别效率.提出一种新的动态蛋白质相互作用网络构建方法——全覆盖方法.该方法可保证静态网络的蛋白质相互作用信息全部映射到动态网络,并尽可能减少动态网络中蛋白质相互作用的重复率,即保证动态网络对静态网络的全覆盖并降低数据冗余度.实验表明,与静态网络和3Sigma动态网络相比,全覆盖动态网络在关键蛋白质识别方面具有优势.

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 王希,潘理,胥晓莎,蒋军强,杨勃

关键词: 蛋白质相互作用,全覆盖,动态网络,关键蛋白质

来源: 湖南理工学院学报(自然科学版) 2019年04期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 数学,生物学

单位: 湖南理工学院信息科学与工程学院

基金: 湖南省研究生科研创新项目(CX20190929),湖南省自然科学基金项目(2017JJ2016,2018JJ2152,2018JJ2153,2019JJ40105),湖南省科技计划项目(2018TP2022),湖南省教育厅科学研究项目(17A089,18B356)

分类号: Q51;O157.5

DOI: 10.16740/j.cnki.cn43-1421/n.2019.04.005

页码: 21-27

总页数: 7

文件大小: 1150K

下载量: 65

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