导读:本文包含了禽流感病毒基因论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:血凝素,基因,流感,病毒,特征,禽流感病毒,突变。
禽流感病毒基因论文文献综述
刘媛,王文博,何怡蓓,邹自英,朱紫衣[1]（2019）在《成都某部一起感染Yamagata系乙型流感病毒血凝素基因分析》一文中研究指出目的分析成都某部感染乙型流感病毒遗传进化与血凝素(HA)基因突变位点。方法通过犬肾上皮细胞(MDCK细胞)体外分离患者咽拭子标本流感病毒毒株,用PCR获取乙型流感病毒HA基因并测序,与NCBI数据库在线比对并利用MEGA 6.06软件构建系统发育进化树,分析突变位点。结果通过MDCK细胞接种,分离出1株乙型流感病毒株,以感染病例咽拭子核酸及分离毒株的核酸为模板进行PCR扩增得到1 755 bp全长HA基因,获得的序列提交至GenBank数据库,获得基因登录号为MH236281。通过在线比对及系统发育树构建,该病例感染的病毒为Yamagata系乙型流感病毒。与乙型流感病毒Yamagata系的代表毒株Influenza B/Yamagata/16/88(GenBank No. M36105)相比,HA基因点突变碱基为57个;与世界卫生组织(WHO)推荐的疫苗株Influenza B/Utah/08/2014 (Gen Bank No. KU592766)相比,突变碱基数为20个。进一步对HA1氨基酸突变位点进行分析,与四川地区往年流行株相比均发生了不同程度的突变,其中与2010年四川温江的分离株(GenBank No. KP461138)相比突变位点较少,仅有4处点突变;与WHO推荐的疫苗株Influenza B/Utah/08/2014相比,有2个氨基酸位点发生了变异,分别为L176Q和M255V,但突变没有处于HA1上的抗原决定簇区域。其中176位点是一个全新的突变,以往四川流行毒株、Yamagata系的代表毒株Influenza B/Yamagata/16/88及WHO推荐的疫苗株Influenza B/Utah/08/2014的HA1 176位点均为亮氨酸(L),而本研究病例感染的乙型流感毒株HA1 176位点突变为谷氨酰胺(Q)。结论成都地区驻地部队2017—2018流行季感染的乙型流感病毒HA基因已发生一些突变,但突变尚未造成抗原性的改变。(本文来源于《第二军医大学学报》期刊2019年11期）
苏海龙,赵宇,郑丽荣,李耀门,张辛耘[2]（2019）在《鸡体内疫苗抗体选择压对H9N2亚型禽流感病毒内部基因演化的影响》一文中研究指出在我国,接种疫苗是防控H9N2亚型禽流感(Avain influenza,AI)流行的主要措施。为了解H9N2亚型禽流感病毒(Avain influenza virus,AIV)在疫苗抗体选择压下的遗传变异情况,本研究选择A/Chicken/Shanghai/F/98(H9N2,F/98)禽流感病毒分别在有和没有疫苗抗体选择压的SPF鸡体内连续传代。为了减少混合病毒对研究结果的干扰,我们建立了叁个独立传代系列。结果表明,母本病毒在经过有和没有疫苗抗体选择压下连续传代后,两种模式下的传代病毒的内部基因都发生了基因突变。与没有疫苗抗体选择压下的传代病毒相比,有疫苗抗体选择压下的传代病毒氨基酸突变数量明显减少(P<0.05),肺组织分离到的传代病毒的突变氨基酸数量显着多于相同传代条件下气管中分离到的传代病毒的氨基酸突变数量(P<0.05)。此外,疫苗抗体选择压下的传代病毒V9L和V9T有4个特有突变:PB2(H366Q、A322E)和M(P154A、A246Q),没有疫苗抗体选择压下的传代病毒N9L和N9T有9个相同突变:PB2(I298Q、E526R)、PB1(T348A)、PA(L336M)、NP(G52A、L187G)、M(H23I)和NS(S81L、H85S),所有第9代次的传代病毒相同的突变有2个:PB2(R327K、Y369S)。值得注意的是,相比母本病毒没有疫苗抗体选择压下的传代病毒对鸡胚的感染力显着提高(P<0.01),而有免疫选择压下的传代病毒对鸡胚的感染力相比母本病毒变化不大(P>0.05),但丧失了致死鸡胚的能力。本研究对了解禽流感病毒在疫苗的选择压力下的演化规律,以及理解疫苗对病毒进化的影响具有重要参考意义。(本文来源于《病毒学报》期刊2019年06期）
马建敏,程栋,李华峰,史晓娟,栾旭波[3]（2019）在《2012-2019年新乡市B型流感病毒基因的变异及流行趋势》一文中研究指出目的研究新乡市B型流感病毒的流行状况和基因变异特征,为当地流感疫苗接种提供政策依据。方法对新乡市2012年1月-2019年2月流感监测结果进行分析,随机抽取分离的23株B型流感病毒,进行血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因测序,使用DNAman软件进行序列比对,Neighbor-Joining法进行进化树分析。结果新乡市B型流感病毒Yamagata系(influenza B virus, Yamagata strain,BY)和Victoria系(influenza B virus, Victoria strain,BV)隔年交替流行,主要感染0～15岁人群(91.4%);2015-2016年和2017-2018年的优势株与当年的叁价疫苗成分不符。HA基因进化树显示,87.5%(7/8)的BV株与疫苗株同处一个分支;而88.98%(8/9)的2013-2015年BY株与同期疫苗株不在一个分支,其抗原表位的突变位点有N116K、S150L、N165Y、D196N和N202S。NA基因未发现耐药位点突变。有6个分离株发生了系间重配。结论 WHO推荐的叁价疫苗株很多情况下与新乡B型流行株不符,推荐使用四价疫苗,并加强对15岁以下人群的接种;新乡BY流行株与疫苗株的HA基因差异较大,期待研发出适合我国本土的疫苗株。(本文来源于《中华疾病控制杂志》期刊2019年11期）
董泽丰,雅雪蓉,王笛,沈强,夏瑜[4]（2019）在《苏州市H5N6亚型高致病禽流感暴发疫情病毒基因特征分析》一文中研究指出目的对苏州市H5N6亚型高致病禽流感暴发疫情病毒进行全基因测序,分析病毒基因变异情况。方法实时荧光-逆转录聚合酶链反应(real-time fluorescent quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)方法检测病死禽咽/肛拭子、疑似病例咽拭子标本甲/乙型及各亚型流感病毒核酸。Sanger法对H5N6病毒进行全基因测序并构建HA及NA系统发育树。结果苏州市2018-2019流行季了报告1例人感染H5N6禽流感实验室确诊病例,春节期间W区某地持续出现病死禽经实验室检测确诊为H5N6禽流感疫情。序列分析表明苏州株血凝素(hemagglutinin,HA)及神经氨酸酶(neuramidinase,NA)基因同源性分别为98.01%～100.0%和98.16%～100.0%。A/chicken/Suzhou/WZ01/2019(H5N6)和A/chicken/Suzhou/WZ03/2019(H5N6)均发生了D198N及Q226H耐药突变。苏州H5N6病毒株属2.3.4.4 H5进化分支,HA蛋白切割位点氨基酸序列为RERRRKR↓GLF,为高致病禽流感病毒。结论 H5N6高致病禽流感病毒为新型多源重配病毒且仍在不断进化,苏州株多个基因位点发生漂移;应密切监测耐药突变及耐药毒株的流行并及时采取科学有效处置措施防止对公众健康和养殖业造成重大损害。(本文来源于《中华疾病控制杂志》期刊2019年11期）
吴立炀,王福广,查云峰,叶健,刘劼[5]（2019）在《2017—2018年广东省H9亚型禽流感病毒HA基因序列分析》一文中研究指出为了解广东省H9亚型禽流感病毒HA基因变异情况,对2017—2018年从广东省活禽市场获得的13株H9亚型禽流感病毒HA基因进行序列分析,发现13个毒株均属于h9.4.2.5分支;潜在的糖基化位点均为8个,主要变异表现在218～220 aa处1个位点缺失和313～315 aa处1个位点增加;受体结合位点主要表现为K149N、A150T、V198T、Q234L和Q235M突变,其中234～236 aa位点突变为LMG,与人源受体相同,具有可感染人的分子特征;抗原性相关位点除201 aa位点较为保守外,其余6个位点主要表现为G90E、S145D、D153G、N167G、A168N、T200R位点的突变,此外168 aa由天冬氨酸(D)突变为天冬酰胺(N),并成为主要氨基酸。以上基因突变提示,当前流行毒株的抗原性可能发生了较大变异,现有疫苗株可能对流行毒株不能提供有效的保护,需要研发新的疫苗毒株。(本文来源于《中国动物检疫》期刊2019年11期）
许晶,史伟,张蕾,李慎,郑媛[6]（2019）在《2017-2018年度陕西省甲型H1N1流感病毒基因特征分析》一文中研究指出目的了解陕西省2017-2018年度甲型H1N1流感病毒的血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因变异情况。方法选取2017-2018年度分离的6株甲型H1N1流感毒株进行全基因测序,利用生物信息学软件对分离株的HA和NA基因进行进化和变异分析,并与北半球疫苗株A/Michigan/45/2015进行对比;采用MEGA(5.05)软件NJ法构建基因进化树,进行系统进化分析。结果陕西省2017-2018年度甲型H1N1流感病毒阳性占比36.85%,流行高峰为2017年12月和2018年1月。6株甲型H1N1流感病毒测序得到的HA、NA序列与疫苗株比对,分别有12、11个氨基酸位点发生变异,其中HA有7个位点变异发生在抗原决定簇,受体结合位点、潜在糖基化位点比较稳定;NA序列没有发现耐药位点变异。结论 2017-2018年度陕西省甲型H1N1流感病毒为优势流行株。目前甲型H1N1流感病毒与WHO推荐的新疫苗株高度同源。(本文来源于《现代预防医学》期刊2019年20期）
孟丹,侯晓红,王蒙,龙宪荣,柴同杰[7]（2019）在《PA基因影响H9N2亚型禽流感病毒致病性和气源性传播的研究》一文中研究指出禽流感(Avian Influenza, AI)从发现至今已有近140年的历史,禽流感病毒可气源性传播从而导致疫情大范围快速扩散,流行病学调查显示H9N2亚型禽流感是目前我国家禽群中流行最为普遍的流感病毒,部分H9N2病毒已经可以突破种间障碍感染哺乳动物甚至感染人类。与此同时,2009年新甲型H1N1流感病毒则在人群中广泛流行,因此,这两种亚型的病毒在自然界发生重排的几率非常大。若形成的重组毒株经自然选择进一步发展成高致病性毒株,势必会造成流感大流行,带来不可估量(本文来源于《2019全国呼吸毒理与卫生毒理学术研讨会论文集》期刊2019-10-25）
徐红日,李雅莉,王成祥,刘国星,刘畅[8]（2019）在《黄芩对流感病毒FM1感染所致病毒性肺炎小鼠肺中炎性细胞因子蛋白与基因表达的影响》一文中研究指出建立流感病毒亚洲甲型鼠肺适应株FM1感染所致病毒性肺炎小鼠模型,在FM1感染的不同时相,分别采用免疫组化法与RT-PCR法,动态观察清热解毒代表中药黄芩对流感病毒FM1感染所致小鼠病毒性肺炎模型靶器官肺中炎性细胞因子蛋白与基因表达的影响,阐明黄芩修复流感病毒所致肺炎靶器官免疫炎症损伤的部分作用机制。结果显示,黄芩在感染后第3～5天可降低肺组织中促炎性细胞因子TNF-α,IL-1,IL-6的蛋白与基因表达,在感染后第5天增加肺组织中抗炎性细胞因子IL-10和抗病毒因子IFN-γ的蛋白与基因表达。黄芩可能通过抑制促炎性细胞因子的过度释放,促进抗炎性细胞因子的表达,从而抑制机体全身炎症反应综合征,减轻流感病毒FM1感染所致靶器官肺的免疫炎症性病理损伤,促进肺组织炎性病变的修复。(本文来源于《中国中药杂志》期刊2019年23期）
陈玲霞,孙卫明,姬莉莉,喻金玉,毛玉梅[9]（2019）在《2013-2018年北京市怀柔区甲型H3N2流感病毒HA基因分子特征分析》一文中研究指出目的分析怀柔区2013-2018年甲型H3N2流感病毒血凝素(HA)基因的遗传变异特征。方法选取怀柔区2013年9月-2018年8月50株甲型H3N2流感病毒,进行HA基因扩增和测序,运用MEGA6.0软件分析HA的分子特征,并构建系统进化树。结果怀柔区2013-2018年甲型H3N2流感病毒优势流行株分别为3c.3系(2013年9月-2014年8月)、3c.3a系(2013年9月-2015年8月)和3c.2a系(2015年9月-2018年8月)。系统进化树分析显示,同一监测年度的流行株基本呈现集中分布,各监测年度流行株与当年推荐流感疫苗株距离均较远。分子特征显示HA蛋白5个抗原决定簇均发生变异,有29处氨基酸位点发生变异,变异频率逐年增加;受体结合位点发生N225D、T131K和T135K/N变异;糖基化位点自2015年9月-2018年8月变化增加,144NSS消失,部分流行株新增了142NSS、158NYT和135NSS。结论怀柔区2013-2018年甲型H3N2流感病毒HA基因不断发生突变,变异频率增加,可能出现了抗原漂移,与当年推荐疫苗株匹配程度降低,近期应加强对流感病毒分子变异的监测。(本文来源于《中国病原生物学杂志》期刊2019年09期）
周杉杉,毛乃颖,姬奕昕,张燕,崔爱利[10]（2019）在《2017～2018年河南省漯河市儿童严重急性呼吸道感染病例中人副流感病毒3型基因特征分析》一文中研究指出严重急性呼吸道感染(Severe acute respiratory infection,SARI)是引起婴幼儿就诊和住院的常见原因,也是该年龄段人群发病的主要原因,而病毒感染占呼吸道感染病例的60%以上,其中人副流感病毒(Human parainfluenza viruses,HPIVs)是引起呼吸道感染的常见病原。为分析河南省漯河市儿童严重急性呼吸道感染(SARI)病例中人副流感病毒3型(HPIV-3)检出状况及血凝素-神经氨酸酶蛋白(Hemagglutinin-neuraminidase,HN)基因特征,采用实时荧光定量聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)方法对河南省漯河市中心医院于2017年10月10日至2018年12月27日送检的627份SARI病例咽拭子进行核酸检测,筛查HPIV-3阳性标本,对HPIV-3阳性标本用反转录聚合酶链反应(Reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增其HN基因,并对扩增产物进行序列测定,与GenBank数据库中的国内外HPIV-3 HN基因进行对比分析,绘制系统进化树,并分析基因特征。627份咽拭子标本中,HPIV-3阳性有27份,检出率为4.3%。59%的HPIV-3阳性病例分布于春夏季,发病人群中,6岁以下儿童占96.3%。通过RT-PCR方法共获得18株HPIV-3的HN基因,经过序列测定及对比分析可划分为两个基因亚型:C3a和C3b。C3a亚型有10株,C3b亚型有8株。18株HPIV-3的HN基因序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.1%～100.0%和98.8%～100%。与原型株Wash/47885/57相比,本次扩增18株HPIV-3 HN基因序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为94.5%～95.0%和97.0%～97.7%。与GenBank中国内外的HPIV-3 HN基因的代表株比较,其核苷酸及氨基酸同源性分别为94.1%～98.5%和96.8%～97.0%。本研究提示HPIV-3是河南省漯河市儿童SARI病例中检出的病原之一,2017年10月至2018年12月期间,至少有C3a、C3b两个基因亚型的HPIV-3毒株在漯河市共流行。(本文来源于《病毒学报》期刊2019年05期）
禽流感病毒基因论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
在我国,接种疫苗是防控H9N2亚型禽流感(Avain influenza,AI)流行的主要措施。为了解H9N2亚型禽流感病毒(Avain influenza virus,AIV)在疫苗抗体选择压下的遗传变异情况,本研究选择A/Chicken/Shanghai/F/98(H9N2,F/98)禽流感病毒分别在有和没有疫苗抗体选择压的SPF鸡体内连续传代。为了减少混合病毒对研究结果的干扰,我们建立了叁个独立传代系列。结果表明,母本病毒在经过有和没有疫苗抗体选择压下连续传代后,两种模式下的传代病毒的内部基因都发生了基因突变。与没有疫苗抗体选择压下的传代病毒相比,有疫苗抗体选择压下的传代病毒氨基酸突变数量明显减少(P<0.05),肺组织分离到的传代病毒的突变氨基酸数量显着多于相同传代条件下气管中分离到的传代病毒的氨基酸突变数量(P<0.05)。此外,疫苗抗体选择压下的传代病毒V9L和V9T有4个特有突变:PB2(H366Q、A322E)和M(P154A、A246Q),没有疫苗抗体选择压下的传代病毒N9L和N9T有9个相同突变:PB2(I298Q、E526R)、PB1(T348A)、PA(L336M)、NP(G52A、L187G)、M(H23I)和NS(S81L、H85S),所有第9代次的传代病毒相同的突变有2个:PB2(R327K、Y369S)。值得注意的是,相比母本病毒没有疫苗抗体选择压下的传代病毒对鸡胚的感染力显着提高(P<0.01),而有免疫选择压下的传代病毒对鸡胚的感染力相比母本病毒变化不大(P>0.05),但丧失了致死鸡胚的能力。本研究对了解禽流感病毒在疫苗的选择压力下的演化规律,以及理解疫苗对病毒进化的影响具有重要参考意义。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
禽流感病毒基因论文参考文献
[1].刘媛,王文博,何怡蓓,邹自英,朱紫衣.成都某部一起感染Yamagata系乙型流感病毒血凝素基因分析[J].第二军医大学学报.2019
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[10].周杉杉,毛乃颖,姬奕昕,张燕,崔爱利.2017～2018年河南省漯河市儿童严重急性呼吸道感染病例中人副流感病毒3型基因特征分析[J].病毒学报.2019
论文知识图
