江津塘河鱼类资源及遗传多样性调查研究

论文摘要

江津塘河是长江库尾支流,河道中滚水坝于清代建立。本研究于2018年3月至2018年7月期间,对江津塘河坝上大石包（DSB）、回龙坝（HLB）、学堂湾（XTW）以及坝下大沙嘴（DSZ）、牛角沱（NJT）、水皮滩（SPT）6个采样点鱼类进行采集。通过形态学为主,DNA条形码技术为辅进行鱼类的种类鉴定,以及对两种鱼类的遗传多样性分析等操作。为江津塘河渔业资源保护以及环境状况的改善提供了参考依据。探讨塘河滚水坝工程方面的生态隔离对两种繁殖习性鱼类导致的遗传分化的影响。通过该长江支流的研究,为其他支流的鱼类资源的分布判断提供了科学依据与对照,为水坝的建设对渔业资源的阻隔效应提供参考。研究结果如下:1.江津塘河鱼类资源调查通过对江津塘河6个采样点进行渔获物收集,利用DNA条形码技术进行物种鉴定,共收集到鱼类样本1080尾,48.96kg,检测出5目16科37属45种鱼类。其中,鲤形目鱼类最多,占所采样本数的68.75%,隶属10科26种31属。该河流优势种为鲤（Cyprinus carpio）、马口鱼（Opsariicjthys bidens）、?（Hemiculter leuciscucus（Bleeker））。另外,河流鱼类Shannon多样性指数H范围为1.4952.484,Margalef物种丰富度指数D分布范围为2.9355.828,Simpson生态优势度指数C分布范围为0.1900.258,Pielou均匀度指数J分布范围为0.5890.693。结果表明,优势度范围较小,而各群体均匀度差异不大,各采样点鱼类分布较均匀且采样点渔获物结构差异不明显。和历史资料相比,江津塘河鱼类资源受人为因素的影响而有所减少,应加强保护措施。2.江津塘河银鮈遗传多样性研究为分析银鮈（Squalidus argentatus）在江津塘河的遗传多样性,调查水坝建立与遗传多样性的关系,通过对塘河六个采样点230尾银鮈作为实验样本。利用MEGA 6.0和DnaSP 5.0软件对获得的D-loop控制区696bp有效序列进行分析。共检测到变异位点27个,32个单倍型,群体遗传多样性指数（Hd=0.923,pi=0.00867）,表明塘河银鮈存在较丰富的遗传多样性。坝上群体间Fst在0.093220.12900之间,坝下群体间Fst在0.075950.12710之间,坝下群体遗传多样性较坝上更加丰富。坝上与坝下群体间（Fst=0.24831,Nm=0.96）,均呈现出群体间高度的遗传分化现象。另外,从单倍型分布上,坝上单倍型22个,坝下单倍型有28个。坝上独享单倍型仅为4个,坝下独享单倍型10个,坝上的单倍型绝大部分被坝下群体共有,而坝下单倍型在水坝以上共有程度较低。坝上群体与坝下群体基因交流程度小,结果表明滚水坝对银鮈群体遗传结构的影响已经有所显现,应加强对河流洄游鱼类的保护。3.江津塘河高体鳑鲏遗传多样性研究高体鳑鲏（Rhodeus ocellatus）为定居性鱼类,为分析水坝对于定居性鱼类的影响,对塘河6个采样点187尾高体鳑鲏进行采样分析,通过获得的D-loop控制区964bp有效序列进行分析,检测到变异位点48个,共定义了9个单倍型,个体间序列差异较小。遗传多样性指数为（Hd=0.14542,pi=0.00346）,表明遗传多样性水平较低。另外,坝上群体与坝下群体遗传多样性表现较为一致且为随机交流的一个大群体,并未发现由于水坝的阻隔而导致各群体间遗传多样性变化,表明水坝对高体鳑鲏这类定居性鱼类遗传多样性影响较小。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 第1章 文献综述
•   1.1 江津区河流
•     1.1.1 概况
•     1.1.2 江津塘河自然环境概况
•     1.1.3 水利工程对渔业资源的影响
•   1.2 渔业资源分析
•     1.2.1 鱼类物种鉴定
•   1.3 鱼类遗传多样性
•     1.3.1 线粒体DNA分子的组成特征以及遗传特征
•     1.3.2 遗传多样性
•   1.4 银鮈生物学特征以及研究现状
•   1.5 高体鳑鲏生物学特征以及研究现状
• 第2章 引言
•   2.1 选题意义
•   2.2 研究目标
•   2.3 技术路线
• 第3章 江津塘河渔业资源调查研究
•   3.1 材料与方法
•     3.1.1 实验材料
•     3.1.2 实验试剂
•     3.1.3 实验仪器
•   3.2 实验方法
•     3.2.1 基于DNA条形码对种类的鉴定
•   3.3 数据处理分析
•     3.3.1 DNA条形码技术数据处理与分析
•     3.3.2 生物多样性数据处理分析
•   3.4 结果与分析
•     3.4.1 塘河鱼类名录
•     3.4.2 采样点分布及生物性特征
•     3.4.3 鱼类组成及分布特征
•     3.4.4 繁殖类群
•     3.4.5 各采样点鱼类生物学指数
•   3.5 讨论
• 第4章 江津塘河银鮈遗传多样性
•   4.1 材料与方法
•     4.1.1 实验采样点
•     4.1.2 实验试剂与器材
•     4.1.3 实验方法
•     4.1.4 数据处理分析
•   4.2 结果与分析
•     4.2.1 群体内遗传多样性
•     4.2.2 群体间遗传多样性
•     4.2.3 基因流和遗传分化指数
•   4.3 讨论
•     4.3.1 江津塘河各群体银鮈遗传多样性
•     4.3.2 江津塘河各群体间银鮈遗传分化
•     4.3.3 滚水坝对银鮈遗传分化影响
•     4.3.4 江津塘河鱼类生物多样性保护建议
• 第5章 江津塘河鳑鲏遗传多样性
•   5.1 材料与方法
•     5.1.1 实验采样点
•     5.1.2 实验试剂与器材
•     5.1.3 实验方法
•     5.1.4 数据处理与分析
•   5.2 结果与分析
•     5.2.1 群体内遗传多样性
•     5.2.2 群体间遗传多样性
•     5.2.3 基因流和遗传分化指数
•   5.3 讨论
•     5.3.1 江津塘河高体鳑鲏遗传多样性
•     5.3.2 江津塘河高体鳑鲏各群体间遗传分化
•     5.3.3 滚水坝对高体鳑鲏遗传分化影响
•     5.3.4 针对于滚水坝的保留问题建议
• 第6章 小结
• 参考文献
• 致谢
• 攻读硕士学位期间发表文章及参与项目

文章来源

类型: 硕士论文

作者: 蒋红霞

导师: 张春霖

关键词: 江津塘河,鱼类,银鮈,高体鳑鲏,遗传多样性

来源: 西南大学

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 资源科学,水产和渔业

单位: 西南大学

分类号: S932.4

总页数: 62

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