火龙果线粒体细胞色素b基因克隆及其应用潜力分析

论文摘要

火龙果（Hylocereus undulatus Britt.）种质资源评价是开展火龙果育种的基础,也可为火龙果的其它方面研究提供指导。线粒体细胞色素b基因（Mt-cyt b）是物种鉴定、系统进化及遗传多样性分析等方面研究的潜在遗传分子标记。本研究通过同源克隆和RACE技术,从红肉火龙果获得了长度为3 093 bp的Pmt-cyt b基因片段,包括1 628 bp的5’UTR、1 182 bp的CDS及283 bp的3’UTR,预测编码393个氨基酸。系统进化分析表明火龙果与白花蝇子草、白玉草、甜菜和奎藜的进化关系最近。对来自中国不同地方的21份火龙果种质资源的进行Pmt-cyt b序列比对分析发现:不同火龙果Pmt-cyt b基因序列完全一样,说明Pmt-cyt b可能不适用于火龙果的品种鉴定及遗传多样性研究。我们的研究补充了火龙果Mt-cyt b种质鉴定的认识,在一定程度上为火龙果种质资源的评价工作和研究仙人掌科其它植物Mt-cyt b基因提供序列参考。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 Pmt-cyt b基因的克隆与分析
•     1.1.1 基因克隆
•     1.1.2 序列分析
•     1.1.3 分子进化分析
•   1.2 Pmt-cyt b基因在火龙果种质资源评价中的应用
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 实验材料
•   3.2 总RNA的提取及cDNA的合成
•   3.3 Pmt-cyt b核心片段克隆
•   3.4 RACE技术扩增Pmt-cyt b全长CDS
•   3.5 RACE扩增测序分析
•   3.6 扩增Pmt-cyt b基因全长及生物信息学分析
•   3.7 Pmt-cyt b基因在火龙果种质资源评价中的应用
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 农全东,张明永,焦正利,程华萍,张美,简曙光,陆宏芳,夏快飞

关键词: 火龙果,线粒体细胞色素,种质资源,评价

来源: 分子植物育种 2019年13期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,园艺

单位: 中国科学院华南植物园华南农业植物分子分析与遗传改良重点实验室,文山州农业科学院,中国科学院华南植物园广东省应用植物学重点实验室,中国科学院大学

基金: 国家重点研发计划项目(2016YFC1403002),中国科学院A类战略性先导科技专项(XDA13020500),中国科学院大学生创新实践训练计划(KCJH-80107-2017-018),广州市科技计划项目(201804010409)共同资助

分类号: S667.9;Q943.2

DOI: 10.13271/j.mpb.017.004194

页码: 4194-4203

总页数: 10

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