高通量测序分析云南腾冲热海热泉微生物多样性

论文摘要

【背景】云南腾冲热海热泉中蕴含着丰富的极端微生物资源。【目的】揭示云南腾冲热海热泉中微生物物种多样性及群落结构差异,发掘酸性热泉中铁、硫氧化功能微生物。【方法】采用Illumina HiSeq高通量测序技术对3处热泉15个水体样品中微生物16SrRNA基因V4-V5区进行测序及生物信息学分析。【结果】3处热泉中共获得578061条有效序列,聚类为141个可操作分类单元（Operational taxonomic unit,OTU）,包括19个门66个属。鼓鸣泉（GMQ）、蛤蟆嘴（HMZ）、黄瓜箐（HGQ）3处热泉均以泉古菌门（Crenarchaeota）和厚壁菌门（Firmicute）为主。从属水平分析,碱性热泉鼓鸣泉（GMQ）和中性热泉蛤蟆嘴（HMZ）分别注释到37、32个属,优势属均为芽孢杆菌属（Bacillus）和热棒菌属（Pyrobaculum）。酸性热泉黄瓜箐（HGQ）共注释到20个属,优势属为酸杆菌属（Acidibacillus）和酸硫杆状菌属（Acidithiobacillus）,此外,具有铁、硫氧化潜力的菌属有喜酸菌属（Acidicaldus）、硫化芽孢杆菌属（Sulfobacillus）、硫化叶菌属（Sulfolobus）及生金球菌属（Metallosphaera）等,进一步通过硫氧化培养基分离获得了这些菌属中的纯菌株。【结论】云南腾冲热海热泉水体中蕴含丰富的微生物资源,热泉间微生物物种组成差异明显;酸性热泉中存在多种具有潜在铁、硫代谢功能的菌种;未分类类群、非培养类群丰度很高,尤其是蕴藏着可观的古菌资源。

论文目录

• 1材料与方法
•   1.1样品采集及环境因子测定
•   1.2主要试剂和仪器
•   1.3样品基因组提取
•   1.4 16S rRNA基因扩增子测序
•   1.5测序数据分析
• 2结果与分析
•   2.1热泉理化参数特征及16S rRNA基因序列多样性
•   2.2腾冲热海热泉微生物多样性分析
•   2.3腾冲热海热泉微生物群落结构相似度分析
•     2.3.1微生物组成α多样性分析
•     2.3.2微生物群落结构差异分析
•     2.3.3微生物群落结构热图分析
• 3讨论
•   3.1微生物组成多样性
•   3.2功能微生物组成多样性
• 4结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 秦亚玲,梁宗林,宋阳,王保军,刘双江,姜成英

关键词: 热海热泉,高通量测序,微生物多样性,硫氧化微生物

来源: 微生物学通报 2019年10期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室,中国科学院大学,中国科学院生态环境研究中心环境生物技术重点实验室,中国科学院环境微生物技术联合实验室

基金: 国家自然科学基金(31670124),科技基础性工作专项(2015FY110100),国家重点基础研究发展规划(2014CB846000),国家材料环境腐蚀平台项目~~

分类号: Q938

DOI: 10.13344/j.microbiol.china.190284

页码: 2482-2493

总页数: 12

文件大小: 1144K

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